More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3230 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3230  ABC transporter related protein  100 
 
 		 228 aa  452  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2978  ABC transporter related  73.45 
 
 		 596 aa  301  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.013676  decreased coverage  0.00456661 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1521  ABC transporter related protein  67.54 
 
 		 601 aa  288  4e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0493324  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3302  ABC transporter-related protein  57.71 
 
 		 606 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11685  macrolide ABC transporter ATP-binding protein  56 
 
 		 591 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.819157 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30250  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  58.15 
 
 		 572 aa  227  1e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.24394 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1046  ABC transporter ATPase  47.01 
 
 		 758 aa  226  2e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2744  ABC transporter related  50.89 
 
 		 609 aa  217  1e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0338  ABC transporter, ATP-binding protein  48.5 
 
 		 704 aa  216  2e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1950  ABC transporter related  51.79 
 
 		 615 aa  209  3e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.975434 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0977  ABC transporter related  52.89 
 
 		 616 aa  203  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.126442  hitchhiker  0.00329401 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13340  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  49.81 
 
 		 630 aa  202  3e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0691975  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4554  ABC transporter related  49.6 
 
 		 617 aa  192  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15000  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  45.45 
 
 		 600 aa  192  4e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0302703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0736  ABC transporter related  45.23 
 
 		 630 aa  190  1e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2722  ABC transporter related protein  47.73 
 
 		 631 aa  190  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0409  ABC transporter, ATP-binding subunit  50.21 
 
 		 596 aa  181  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.722245  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08180  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  42.91 
 
 		 632 aa  176  3e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.195035 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1285  ABC transporter related  48.26 
 
 		 610 aa  171  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000856042 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32430  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  50.7 
 
 		 600 aa  169  4e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.775156  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1215  ABC transporter related  51.2 
 
 		 608 aa  167  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.207938  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8452  ABC transporter related  50.45 
 
 		 608 aa  165  6.9999999999999995e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.030329  decreased coverage  0.00000193115 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2963  ABC transporter related  44.81 
 
 		 600 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.616286  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3007  ABC transporter related  44.81 
 
 		 600 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333265  normal  0.911038 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0784  ABC transporter related  46.92 
 
 		 598 aa  159  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0513  ABC transporter related protein  47.12 
 
 		 592 aa  157  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0865  ABC transporter related protein  50.43 
 
 		 608 aa  157  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.380755  normal  0.901463 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05410  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  43.03 
 
 		 613 aa  157  1e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0302406  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0990  ABC transporter related protein  48.17 
 
 		 588 aa  155  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3947  ABC transporter related protein  45.96 
 
 		 601 aa  155  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3996  ABC transporter related protein  46.09 
 
 		 592 aa  153  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3161  ABC transporter-like protein  47.16 
 
 		 608 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.970833 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8616  ABC transporter ATP-binding protein  47.3 
 
 		 602 aa  152  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03410  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  57.36 
 
 		 628 aa  150  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0728  ABC transporter related  47.89 
 
 		 598 aa  150  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0650  ABC transporter related  49.76 
 
 		 590 aa  149  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3854  ABC transporter related  43.78 
 
 		 611 aa  148  8e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.53962  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3959  ABC transporter related  44.49 
 
 		 612 aa  146  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3020  ABC transporter-like  38.33 
 
 		 646 aa  144  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.511953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0772  ABC transporter related  39.62 
 
 		 632 aa  143  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0493  ABC transporter related protein  55.56 
 
 		 602 aa  142  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.518307  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1047  ABC transporter related  66.09 
 
 		 606 aa  137  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1822  ATPase  35.75 
 
 		 631 aa  134  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3518  ABC transporter related  49.4 
 
 		 587 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.284469  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1447  ABC transporter related  38.6 
 
 		 632 aa  131  6.999999999999999e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1040  ABC transporter-related protein  36.45 
 
 		 629 aa  131  7.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  39.3 
 
 		 653 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2312  ABC transporter related  34.18 
 
 		 642 aa  128  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0514  ATPase  35.98 
 
 		 633 aa  125  6e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11743  normal  0.506629 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12061  ABC transporter ATPase  33.48 
 
 		 644 aa  125  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.393632  normal  0.504812 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2364  ABC transporter related  34.6 
 
 		 642 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1381  ATPase  40.27 
 
 		 641 aa  124  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.981261  normal  0.290816 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0950  ATPase  32.42 
 
 		 641 aa  122  3e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.61977  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0123  ABC transporter related  36.99 
 
 		 643 aa  123  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0299  ABC transporter related  33.33 
 
 		 642 aa  123  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18141  hypothetical protein  33.03 
 
 		 641 aa  122  5e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0376333  normal  0.70207 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2115  ABC transporter related  36.32 
 
 		 621 aa  120  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0255573  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4996  ABC transporter related  34.23 
 
 		 620 aa  120  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03991  ABC transporter ATP-binding protein  33.77 
 
 		 652 aa  119  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0768  ABC transporter related  34.17 
 
 		 636 aa  119  3e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0383  ABC transporter, ATP-binding protein  34.12 
 
 		 627 aa  119  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.386036  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3547  ABC transporter-like protein protein  36.87 
 
 		 640 aa  118  7e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1008  Fis family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 629 aa  118  9e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1823  ABC transporter related  34.91 
 
 		 632 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00644209  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0760  ABC transporter related  36.02 
 
 		 625 aa  116  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0743  ABC transporter related  36.02 
 
 		 625 aa  116  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0800  ABC transporter, ATP-binding protein  33.62 
 
 		 622 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00285677 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  35.32 
 
 		 630 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0008  ABC transporter related  34.11 
 
 		 620 aa  115  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.925372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1093  ABC transporter related  31.54 
 
 		 634 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07215  ABC transporter ATP-binding protein  31.96 
 
 		 622 aa  113  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.65 
 
 		 637 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  34.21 
 
 		 637 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  34.21 
 
 		 637 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.21 
 
 		 637 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  34.21 
 
 		 637 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1814  ABC transporter related  33.96 
 
 		 639 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.21 
 
 		 637 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.21 
 
 		 637 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.21 
 
 		 637 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.21 
 
 		 637 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  37.96 
 
 		 631 aa  108  5e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_41351  predicted protein  31.48 
 
 		 679 aa  108  6e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1613  ABC transporter-related protein  34.26 
 
 		 630 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050504  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3145  ABC transporter, ATP-binding protein  35.51 
 
 		 631 aa  107  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000568363  normal  0.0176571 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3847  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 		 635 aa  107  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2173  ABC transporter, ATP-binding protein  35.51 
 
 		 631 aa  107  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00208736  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4267  ABC transporter related  38.55 
 
 		 621 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.183783  normal  0.517303 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1982  ABC transporter, ATP-binding protein  35.05 
 
 		 631 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000663544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1964  ABC transporter, ATP-binding protein  35.05 
 
 		 631 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386922  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2308  ABC transporter, ATP-binding protein  35.05 
 
 		 631 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000184058  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2190  ABC transporter, ATP-binding protein  35.05 
 
 		 631 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4634  ABC transporter related  38.55 
 
 		 621 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1278  ABC transporter ATPase  33.62 
 
 		 625 aa  107  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.760109  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2225  ABC transporter, ATP-binding protein  35.05 
 
 		 631 aa  106  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0298  ABC transporter ATP-binding protein  32.43 
 
 		 643 aa  106  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0433  ABC transporter, ATP-binding protein  30.56 
 
 		 641 aa  105  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3897  ABC transporter related  45.87 
 
 		 613 aa  105  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4406  ABC transporter related protein  32.5 
 
 		 630 aa  105  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0899  ABC transporter related  33.77 
 
 		 637 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>