More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3830 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1204  ABC transporter related  60.68 
 
 
648 aa  733    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0975  ABC transporter ATP-binding protein  62.77 
 
 
636 aa  738    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000424481  normal  0.109741 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3830  ABC transporter-related protein  100 
 
 
632 aa  1248    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.457691 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0693  ABC transporter, ATP-binding protein  60.74 
 
 
648 aa  725    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3059  ABC transporter related  65.62 
 
 
628 aa  799    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2207  ABC transporter, ATP-binding protein  60.74 
 
 
648 aa  725    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.829349  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4373  ABC transporter-related protein  66.03 
 
 
629 aa  786    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0223118  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  61.67 
 
 
649 aa  739    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0838  ABC transporter related  57.19 
 
 
646 aa  658    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0257096 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1126  ABC transporter related  62.91 
 
 
634 aa  768    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.239651 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  63.35 
 
 
642 aa  771    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2810  ABC transporter ATPase  56.54 
 
 
631 aa  636    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  61.05 
 
 
649 aa  738    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2525  ABC transporter, ATP-binding protein  60.74 
 
 
660 aa  726    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1298  ABC transporter, ATP-binding protein  60.74 
 
 
1065 aa  723    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.524137  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0413  ABC transporter related  65.06 
 
 
641 aa  798    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00715783  hitchhiker  0.000000249616 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0899  ABC transporter related  63.24 
 
 
663 aa  751    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.998664  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  60.59 
 
 
649 aa  733    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1136  ABC transporter, ATP-binding protein  60.59 
 
 
660 aa  724    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  58.86 
 
 
641 aa  712    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  54.19 
 
 
640 aa  648    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0828  ABC transporter related  62.93 
 
 
636 aa  749    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0939  ABC transporter, ATP-binding protein  60.62 
 
 
648 aa  721    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0496893  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0181  ferric-enterobactin ABC transporter ATPase  73.1 
 
 
626 aa  875    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.530164  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2087  ABC transporter, ATP-binding protein  60.74 
 
 
648 aa  725    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0642  ABC transporter related  63.87 
 
 
629 aa  778    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.64323  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4229  ABC transporter related  65.33 
 
 
648 aa  803    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.868359 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3340  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  60.34 
 
 
645 aa  730    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  61.51 
 
 
661 aa  738    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  62.77 
 
 
641 aa  766    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  64.77 
 
 
626 aa  827    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2171  ABC transporter related  62.31 
 
 
645 aa  712    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380674  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  61.51 
 
 
661 aa  738    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0918  ABC transporter related  62 
 
 
688 aa  726    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.101083 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0721  ABC transporter related  63.24 
 
 
640 aa  770    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4771  ABC transporter related  65.72 
 
 
635 aa  769    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1144  ABC transporter, ATP-binding protein  60.59 
 
 
660 aa  724    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  61.21 
 
 
649 aa  738    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3785  ABC transporter related  65.46 
 
 
628 aa  798    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485733  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1605  ABC transporter related  57.14 
 
 
644 aa  633  1e-180  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0890354  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1199  ABC transporter related  53.73 
 
 
648 aa  616  1e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.219582  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2398  ABC transporter related  52.95 
 
 
650 aa  594  1e-168  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  48.13 
 
 
632 aa  577  1.0000000000000001e-163  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2052  ABC transporter related  47.63 
 
 
640 aa  564  1.0000000000000001e-159  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0425216  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0431  putative ATP-binding component of a transport system  49.84 
 
 
641 aa  559  1e-158  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000359167  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0138  ABC transporter related  50.16 
 
 
643 aa  555  1e-157  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1602  ABC transporter ATPase component  45.65 
 
 
638 aa  556  1e-157  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.52947  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1632  ABC transporter related  50.63 
 
 
627 aa  553  1e-156  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.27498  normal  0.259057 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2551  ABC transporter ATPase component  45.02 
 
 
637 aa  548  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1649  ABC transporter related  50.16 
 
 
642 aa  551  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.39648  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0499  ABC transporter related  51.09 
 
 
631 aa  550  1e-155  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.107412  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2640  ABC transporter ATPase component  45.02 
 
 
637 aa  548  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1988  ABC transporter ATPase component  45.02 
 
 
637 aa  550  1e-155  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2131  ABC transporter ATP-binding protein  49.84 
 
 
642 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.40675  normal  0.030462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3609  ABC transporter related  49.84 
 
 
642 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677442  normal  0.278537 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2563  ABC transporter related protein  50.39 
 
 
637 aa  542  1e-153  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0140209 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1673  ABC transporter related  49.38 
 
 
642 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.437344 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2006  ABC transporter related  45.09 
 
 
647 aa  545  1e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0618  ABC transporter related  49.22 
 
 
635 aa  542  1e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000117313 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2512  ABC transporter related  48.26 
 
 
620 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.926021  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1950  ABC transporter related  44.44 
 
 
653 aa  540  9.999999999999999e-153  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2893  ABC transporter, ATP-binding protein  48.26 
 
 
620 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.669618  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1761  ABC transporter related  46.74 
 
 
642 aa  538  9.999999999999999e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14160  ABC transporter, ATP binding component  50.55 
 
 
639 aa  541  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1576  ABC transporter related  50.47 
 
 
641 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.712623 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00393  ABC transporter ATP-binding protein  50.73 
 
 
615 aa  540  9.999999999999999e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3521  ABC transporter, ATP-binding protein  49.84 
 
 
636 aa  538  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1681  ABC transporter ATPase component  46.75 
 
 
649 aa  535  1e-151  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02012  ABC transporter, ATP-binding protein  43.17 
 
 
646 aa  536  1e-151  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0535295  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0609  ABC transporter, ATP-binding protein  50.16 
 
 
632 aa  532  1e-150  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.446122  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2608  ABC transporter ATPase component  43.17 
 
 
641 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00157626  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3294  ABC transporter  49.53 
 
 
636 aa  535  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.313351  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2568  ABC transporter ATPase component  43.32 
 
 
641 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.452475  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1776  ABC transporter ATPase component  43.32 
 
 
641 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.205391  hitchhiker  0.000192841 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2683  ABC transporter ATPase component  43.32 
 
 
641 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0324813  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1419  ABC transporter:AAA ATPase  44.12 
 
 
648 aa  528  1e-149  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.148207 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3882  ABC transporter-like  49.77 
 
 
640 aa  530  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.153189 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2184  ABC transporter ATP-binding protein  49.13 
 
 
639 aa  530  1e-149  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.448903  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1582  ABC transporter related  44.12 
 
 
648 aa  528  1e-149  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0018197  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1093  ABC transporter ATPase component  45.81 
 
 
639 aa  529  1e-149  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.140566  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1634  ABC transporter ATPase component  43.17 
 
 
641 aa  529  1e-149  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.202979  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2095  ABC transporter related  48.66 
 
 
623 aa  526  1e-148  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.958097  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02335  ABC transporter ATPase component  44.79 
 
 
639 aa  525  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3277  ABC transporter, ATP-binding protein Uup  43.83 
 
 
645 aa  523  1e-147  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1853  ABC transporter ATPase component  44.2 
 
 
640 aa  525  1e-147  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1603  ABC transporter ATPase component  43.57 
 
 
640 aa  524  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0251377  normal  0.331537 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2170  ABC transporter ATPase component  44.31 
 
 
635 aa  524  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000710719  normal  0.220785 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1542  ABC transporter ATPase component  43.74 
 
 
640 aa  524  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1609  ABC transporter ATPase component  43.74 
 
 
640 aa  522  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1461  ABC transporter ATPase component  43.99 
 
 
635 aa  519  1e-146  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.185296  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1553  ABC transporter ATPase component  46.42 
 
 
636 aa  520  1e-146  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003440  ABC transporter ATP-binding protein uup  44.32 
 
 
639 aa  518  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.550149  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0913  ABC transporter, ATP-binding protein  48.91 
 
 
633 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1113  ABC transporter ATPase component  44.57 
 
 
635 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00085111  normal  0.933236 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1650  ABC transporter ATPase component  45.02 
 
 
637 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1650  ABC transporter related protein  44.17 
 
 
641 aa  515  1e-144  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2694  ABC transporter related protein  44.15 
 
 
635 aa  510  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.562851  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1058  ABC transporter ATPase component  44.15 
 
 
635 aa  510  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000977813  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1064  ABC transporter ATPase component  44.15 
 
 
635 aa  509  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000187784  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2368  ABC transporter ATPase component  44.31 
 
 
635 aa  509  1e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.561386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>