More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1013 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1013  ABC transporter component  100 
 
 		 610 aa  1209    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0896  ABC transporter related  56.26 
 
 		 599 aa  633  1e-180  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286143 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3086  ABC transporter related  51.55 
 
 		 609 aa  598  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.395233  normal  0.156942 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0723  ABC transporter related  54.04 
 
 		 599 aa  595  1e-169  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2552  ABC transporter related  52.12 
 
 		 604 aa  597  1e-169  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2599  ABC transporter related  53.48 
 
 		 611 aa  593  1e-168  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2153  ABC transporter, ATPase subunit  52.55 
 
 		 602 aa  592  1e-168  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2253  ABC transporter related  52.81 
 
 		 607 aa  594  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0543985 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3202  ABC transporter related  53.02 
 
 		 603 aa  591  1e-167  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2484  ABC transporter related  53.63 
 
 		 605 aa  586  1e-166  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.10091  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0349  ABC transporter related  52.74 
 
 		 602 aa  586  1e-166  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0287299 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1714  ABC-transporter ATP-binding protein  52.14 
 
 		 614 aa  579  1e-164  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0650863 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2717  putative UUP ATPase  51.4 
 
 		 607 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1375  ABC transporter related  51.4 
 
 		 607 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0588139 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2632  ABC transporter related  53.11 
 
 		 602 aa  577  1.0000000000000001e-163  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.306904  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1753  ABC transporter, ATP-binding protein  52.19 
 
 		 605 aa  571  1e-161  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1692  ABC transporter, ATP-binding protein  52.19 
 
 		 605 aa  571  1e-161  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1145  ABC transporter related  51.95 
 
 		 605 aa  570  1e-161  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3591  ABC transporter ATPase  52.05 
 
 		 606 aa  570  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.386794  normal  0.0329455 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0944  ABC transporter related  50.58 
 
 		 601 aa  566  1e-160  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4261  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  50.83 
 
 		 609 aa  566  1e-160  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3520  ABC transporter related  55.43 
 
 		 602 aa  568  1e-160  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3185  ABC transporter related  53.28 
 
 		 607 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3509  ABC transporter related  53.28 
 
 		 607 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3380  ABC transporter related  53.44 
 
 		 607 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0258636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2140  ABC transporter related  50.25 
 
 		 603 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.419129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0704  ABC transporter related  53.11 
 
 		 605 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.041253 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3652  ABC transporter related  52.48 
 
 		 604 aa  560  1e-158  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3104  ABC transporter related  51.25 
 
 		 608 aa  556  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.73656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0920  ABC transporter related  50.17 
 
 		 596 aa  557  1e-157  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4137  ABC transporter related  49.5 
 
 		 605 aa  547  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.245336 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0672  ABC transporter related  53.2 
 
 		 609 aa  545  1e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.276337  normal  0.341528 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3808  ABC transporter related  50.08 
 
 		 606 aa  545  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.53425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3404  ABC transporter related  51.35 
 
 		 604 aa  523  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1478  ABC transporter related  52.55 
 
 		 607 aa  511  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.449493  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1919  ABC transporter related  52.52 
 
 		 603 aa  509  1e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.338599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2068  ABC transporter related  47.96 
 
 		 598 aa  501  1e-140  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3446  ABC transporter related  48.2 
 
 		 596 aa  496  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1524  ABC transporter related  49.33 
 
 		 593 aa  496  1e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.672162 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3923  ABC transporter related  48.2 
 
 		 610 aa  492  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.123801 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0131  ABC transporter, ATP-binding protein  45.12 
 
 		 609 aa  493  9.999999999999999e-139  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2052  ABC transporter related  42.26 
 
 		 640 aa  474  1e-132  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0425216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2398  ABC transporter related  43.3 
 
 		 650 aa  466  9.999999999999999e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  43.19 
 
 		 641 aa  466  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0975  ABC transporter ATP-binding protein  42.7 
 
 		 636 aa  462  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000424481  normal  0.109741 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  43.3 
 
 		 642 aa  462  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  40.72 
 
 		 632 aa  461  9.999999999999999e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3511  ABC transporter related  45.48 
 
 		 594 aa  456  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0828  ABC transporter related  43.01 
 
 		 636 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  42.81 
 
 		 640 aa  450  1e-125  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0899  ABC transporter related  43.17 
 
 		 663 aa  451  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.998664  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02012  ABC transporter, ATP-binding protein  41.04 
 
 		 646 aa  450  1e-125  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0535295  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2006  ABC transporter related  40.53 
 
 		 647 aa  449  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1988  ABC transporter ATPase component  39.53 
 
 		 637 aa  445  1.0000000000000001e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  42.04 
 
 		 641 aa  444  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2810  ABC transporter ATPase  42.48 
 
 		 631 aa  443  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2640  ABC transporter ATPase component  39.53 
 
 		 637 aa  445  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  42.59 
 
 		 649 aa  444  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1761  ABC transporter related  41.81 
 
 		 642 aa  445  1e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2551  ABC transporter ATPase component  39.53 
 
 		 637 aa  445  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1602  ABC transporter ATPase component  41.32 
 
 		 638 aa  443  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.52947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0499  ABC transporter related  44.97 
 
 		 631 aa  445  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.107412  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  42.26 
 
 		 626 aa  441  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  41.7 
 
 		 649 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  42.51 
 
 		 649 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02335  ABC transporter ATPase component  40.44 
 
 		 639 aa  437  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1603  ABC transporter ATPase component  39.69 
 
 		 640 aa  436  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0251377  normal  0.331537 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0642  ABC transporter related  41.48 
 
 		 629 aa  437  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.64323  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  42.51 
 
 		 661 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1553  ABC transporter ATPase component  41.44 
 
 		 636 aa  438  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1542  ABC transporter ATPase component  39.69 
 
 		 640 aa  436  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  41.55 
 
 		 649 aa  438  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  42.51 
 
 		 661 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0913  ABC transporter, ATP-binding protein  44.92 
 
 		 633 aa  434  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2525  ABC transporter, ATP-binding protein  41.46 
 
 		 660 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2207  ABC transporter, ATP-binding protein  41.46 
 
 		 648 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.829349  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0431  putative ATP-binding component of a transport system  43.19 
 
 		 641 aa  434  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000359167  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1779  ABC transporter, ATP-binding protein  41.07 
 
 		 637 aa  435  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000514394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1140  ABC transporter related  40 
 
 		 645 aa  433  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3340  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  40.92 
 
 		 645 aa  435  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1634  ABC transporter ATPase component  39.84 
 
 		 641 aa  434  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.202979  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2087  ABC transporter, ATP-binding protein  41.46 
 
 		 648 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0693  ABC transporter, ATP-binding protein  41.46 
 
 		 648 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1609  ABC transporter ATPase component  39.69 
 
 		 640 aa  434  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1388  ABC transporter related  42.16 
 
 		 623 aa  432  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0285354  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0609  ABC transporter, ATP-binding protein  43.04 
 
 		 632 aa  429  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.446122  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1853  ABC transporter ATPase component  40.03 
 
 		 640 aa  431  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2281  ABC transporter ATP-binding protein  39.67 
 
 		 638 aa  431  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.962843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2145  ABC transporter ATPase component  40.16 
 
 		 639 aa  432  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.338763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1814  ABC transporter ATPase component  40.62 
 
 		 639 aa  429  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000485056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1144  ABC transporter, ATP-binding protein  41.46 
 
 		 660 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003440  ABC transporter ATP-binding protein uup  40.13 
 
 		 639 aa  431  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.550149  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0939  ABC transporter, ATP-binding protein  41.62 
 
 		 648 aa  431  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0496893  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3830  ABC transporter-related protein  43.72 
 
 		 632 aa  430  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.457691 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1199  ABC transporter related  42.07 
 
 		 648 aa  431  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.219582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1136  ABC transporter, ATP-binding protein  41.46 
 
 		 660 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1204  ABC transporter related  40.67 
 
 		 648 aa  426  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1298  ABC transporter, ATP-binding protein  41.28 
 
 		 1065 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.524137  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1605  ABC transporter related  43.97 
 
 		 644 aa  426  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0890354  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1948  ABC transporter ATPase component  39.94 
 
 		 645 aa  426  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000765701  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>