More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0723 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_3520  ABC transporter related  63.89 
 
 
602 aa  691    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1753  ABC transporter, ATP-binding protein  59.76 
 
 
605 aa  700    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0944  ABC transporter related  59.6 
 
 
601 aa  687    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2484  ABC transporter related  63.55 
 
 
605 aa  764    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.10091  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0723  ABC transporter related  100 
 
 
599 aa  1196    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0672  ABC transporter related  63.97 
 
 
609 aa  707    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.276337  normal  0.341528 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2153  ABC transporter, ATPase subunit  65.55 
 
 
602 aa  785    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0704  ABC transporter related  74.17 
 
 
605 aa  847    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.041253 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1478  ABC transporter related  75.83 
 
 
607 aa  791    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.449493  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4261  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  57.69 
 
 
609 aa  668    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3591  ABC transporter ATPase  63.27 
 
 
606 aa  752    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.386794  normal  0.0329455 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1692  ABC transporter, ATP-binding protein  59.76 
 
 
605 aa  700    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2599  ABC transporter related  63.58 
 
 
611 aa  768    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3202  ABC transporter related  64.6 
 
 
603 aa  775    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3086  ABC transporter related  63.29 
 
 
609 aa  779    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.395233  normal  0.156942 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3509  ABC transporter related  77.83 
 
 
607 aa  897    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0349  ABC transporter related  63.64 
 
 
602 aa  727    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0287299 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2253  ABC transporter related  63.83 
 
 
607 aa  768    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0543985 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2552  ABC transporter related  65.38 
 
 
604 aa  795    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4137  ABC transporter related  58.99 
 
 
605 aa  687    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.245336 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3380  ABC transporter related  78.33 
 
 
607 aa  900    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0258636  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3404  ABC transporter related  59.25 
 
 
604 aa  643    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3808  ABC transporter related  58.57 
 
 
606 aa  687    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.53425  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1145  ABC transporter related  59.42 
 
 
605 aa  701    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3185  ABC transporter related  77.83 
 
 
607 aa  898    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3104  ABC transporter related  58.84 
 
 
608 aa  682    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.73656  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2632  ABC transporter related  59.87 
 
 
602 aa  696    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.306904  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0131  ABC transporter, ATP-binding protein  52.43 
 
 
609 aa  621  1e-176  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1013  ABC transporter component  54.04 
 
 
610 aa  617  1e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1714  ABC-transporter ATP-binding protein  53.38 
 
 
614 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0650863 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1375  ABC transporter related  50.83 
 
 
607 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0588139 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2717  putative UUP ATPase  50.83 
 
 
607 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2140  ABC transporter related  49.58 
 
 
603 aa  565  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.419129  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0896  ABC transporter related  53.09 
 
 
599 aa  561  1.0000000000000001e-159  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.286143 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0920  ABC transporter related  48.48 
 
 
596 aa  551  1e-156  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1919  ABC transporter related  53.65 
 
 
603 aa  550  1e-155  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.338599  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3652  ABC transporter related  50.85 
 
 
604 aa  540  9.999999999999999e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2068  ABC transporter related  49.26 
 
 
598 aa  499  1e-140  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3446  ABC transporter related  48.41 
 
 
596 aa  479  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1524  ABC transporter related  48.41 
 
 
593 aa  476  1e-133  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.672162 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3923  ABC transporter related  46.86 
 
 
610 aa  468  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.123801 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  43.57 
 
 
641 aa  464  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0899  ABC transporter related  42.43 
 
 
663 aa  457  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.998664  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2052  ABC transporter related  41.97 
 
 
640 aa  456  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0425216  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1093  ABC transporter ATPase component  42.43 
 
 
639 aa  453  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.140566  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3340  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  42.81 
 
 
645 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0828  ABC transporter related  42.12 
 
 
636 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  42.03 
 
 
626 aa  447  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  42.37 
 
 
642 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  41.21 
 
 
649 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1204  ABC transporter related  42.46 
 
 
648 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0939  ABC transporter, ATP-binding protein  42.08 
 
 
648 aa  442  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0496893  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  40.97 
 
 
641 aa  443  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2006  ABC transporter related  40.63 
 
 
647 aa  443  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  41.43 
 
 
649 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  41.28 
 
 
649 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0838  ABC transporter related  42.99 
 
 
646 aa  440  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0257096 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003440  ABC transporter ATP-binding protein uup  41.57 
 
 
639 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.550149  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02335  ABC transporter ATPase component  41.26 
 
 
639 aa  441  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1136  ABC transporter, ATP-binding protein  41.77 
 
 
660 aa  438  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0975  ABC transporter ATP-binding protein  41.97 
 
 
636 aa  438  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000424481  normal  0.109741 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  41.59 
 
 
632 aa  438  1e-121  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2207  ABC transporter, ATP-binding protein  41.77 
 
 
648 aa  438  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.829349  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2525  ABC transporter, ATP-binding protein  41.77 
 
 
660 aa  438  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  41.06 
 
 
649 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0431  putative ATP-binding component of a transport system  43.89 
 
 
641 aa  437  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000359167  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1144  ABC transporter, ATP-binding protein  41.77 
 
 
660 aa  438  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0693  ABC transporter, ATP-binding protein  41.77 
 
 
648 aa  438  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  41.39 
 
 
640 aa  437  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2087  ABC transporter, ATP-binding protein  41.77 
 
 
648 aa  438  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1388  ABC transporter related  43.31 
 
 
623 aa  437  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0285354  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2398  ABC transporter related  43.3 
 
 
650 aa  437  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2551  ABC transporter ATPase component  39.81 
 
 
637 aa  433  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1298  ABC transporter, ATP-binding protein  41.77 
 
 
1065 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.524137  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0138  ABC transporter related  43.64 
 
 
643 aa  434  1e-120  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1988  ABC transporter ATPase component  39.81 
 
 
637 aa  433  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  41.06 
 
 
661 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2640  ABC transporter ATPase component  39.81 
 
 
637 aa  433  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  41.06 
 
 
661 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3511  ABC transporter related  43.71 
 
 
594 aa  430  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0721  ABC transporter related  40.63 
 
 
640 aa  429  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0918  ABC transporter related  41.52 
 
 
688 aa  428  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.101083 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02012  ABC transporter, ATP-binding protein  39.75 
 
 
646 aa  429  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0535295  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1634  ABC transporter ATPase component  39.38 
 
 
641 aa  427  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.202979  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2810  ABC transporter ATPase  42.42 
 
 
631 aa  428  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1681  ABC transporter ATPase component  40.59 
 
 
649 aa  426  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0642  ABC transporter related  40.76 
 
 
629 aa  426  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.64323  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1603  ABC transporter ATPase component  39.28 
 
 
640 aa  428  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0251377  normal  0.331537 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1542  ABC transporter ATPase component  39.28 
 
 
640 aa  427  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1609  ABC transporter ATPase component  39.28 
 
 
640 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1853  ABC transporter ATPase component  39.25 
 
 
640 aa  422  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0181  ferric-enterobactin ABC transporter ATPase  43.87 
 
 
626 aa  422  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.530164  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1632  ABC transporter related  42.97 
 
 
627 aa  423  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.27498  normal  0.259057 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1779  ABC transporter, ATP-binding protein  41.51 
 
 
637 aa  425  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000514394  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0609  ABC transporter, ATP-binding protein  43.84 
 
 
632 aa  420  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.446122  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2683  ABC transporter ATPase component  39.04 
 
 
641 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0324813  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2568  ABC transporter ATPase component  39.04 
 
 
641 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.452475  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3785  ABC transporter related  42.74 
 
 
628 aa  419  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485733  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3059  ABC transporter related  42.79 
 
 
628 aa  421  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0499  ABC transporter related  43.6 
 
 
631 aa  420  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.107412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>