More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4137 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3380  ABC transporter related  57.42 
 
 		 607 aa  673    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0258636  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1753  ABC transporter, ATP-binding protein  68.88 
 
 		 605 aa  825    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0723  ABC transporter related  57.93 
 
 		 599 aa  681    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0131  ABC transporter, ATP-binding protein  56.53 
 
 		 609 aa  685    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3591  ABC transporter ATPase  59.28 
 
 		 606 aa  702    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.386794  normal  0.0329455 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0672  ABC transporter related  59.28 
 
 		 609 aa  653    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.276337  normal  0.341528 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3185  ABC transporter related  56.39 
 
 		 607 aa  662    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3808  ABC transporter related  94.07 
 
 		 606 aa  1130    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.53425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0349  ABC transporter related  58.75 
 
 		 602 aa  678    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0287299 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2153  ABC transporter, ATPase subunit  60.07 
 
 		 602 aa  732    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1692  ABC transporter, ATP-binding protein  68.88 
 
 		 605 aa  825    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0704  ABC transporter related  58.48 
 
 		 605 aa  673    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.041253 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0944  ABC transporter related  55.91 
 
 		 601 aa  654    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2599  ABC transporter related  60.49 
 
 		 611 aa  709    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3509  ABC transporter related  56.6 
 
 		 607 aa  661    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3202  ABC transporter related  60.23 
 
 		 603 aa  731    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3086  ABC transporter related  57.94 
 
 		 609 aa  721    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.395233  normal  0.156942 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4137  ABC transporter related  100 
 
 		 605 aa  1228    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.245336 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2253  ABC transporter related  60.1 
 
 		 607 aa  742    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0543985 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2552  ABC transporter related  59.61 
 
 		 604 aa  736    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3104  ABC transporter related  80.61 
 
 		 608 aa  986    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.73656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3404  ABC transporter related  66.95 
 
 		 604 aa  759    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1145  ABC transporter related  68.57 
 
 		 605 aa  825    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2484  ABC transporter related  59.97 
 
 		 605 aa  728    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.10091  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1478  ABC transporter related  57.96 
 
 		 607 aa  636    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.449493  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2632  ABC transporter related  59.15 
 
 		 602 aa  684    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.306904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4261  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  83.76 
 
 		 609 aa  1019    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3520  ABC transporter related  56.38 
 
 		 602 aa  619  1e-176  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0896  ABC transporter related  52.62 
 
 		 599 aa  584  1.0000000000000001e-165  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286143 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1714  ABC-transporter ATP-binding protein  52.13 
 
 		 614 aa  580  1e-164  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0650863 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1013  ABC transporter component  50.16 
 
 		 610 aa  572  1e-161  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0920  ABC transporter related  49.58 
 
 		 596 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2717  putative UUP ATPase  49.18 
 
 		 607 aa  552  1e-156  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1375  ABC transporter related  49.18 
 
 		 607 aa  552  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0588139 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2140  ABC transporter related  49.58 
 
 		 603 aa  545  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.419129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1919  ABC transporter related  50.69 
 
 		 603 aa  522  1e-147  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.338599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3652  ABC transporter related  49.31 
 
 		 604 aa  515  1e-144  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3923  ABC transporter related  46.15 
 
 		 610 aa  455  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.123801 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2068  ABC transporter related  45.98 
 
 		 598 aa  456  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  42.07 
 
 		 642 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3446  ABC transporter related  45.98 
 
 		 596 aa  451  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0939  ABC transporter, ATP-binding protein  41.65 
 
 		 648 aa  442  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0496893  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  41.47 
 
 		 641 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2087  ABC transporter, ATP-binding protein  41.03 
 
 		 648 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0693  ABC transporter, ATP-binding protein  41.03 
 
 		 648 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2207  ABC transporter, ATP-binding protein  41.03 
 
 		 648 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.829349  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2525  ABC transporter, ATP-binding protein  41.03 
 
 		 660 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1136  ABC transporter, ATP-binding protein  40.87 
 
 		 660 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  40.97 
 
 		 649 aa  436  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3340  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  41.25 
 
 		 645 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1144  ABC transporter, ATP-binding protein  40.87 
 
 		 660 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  40.5 
 
 		 649 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  40.5 
 
 		 649 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  39.84 
 
 		 626 aa  434  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1298  ABC transporter, ATP-binding protein  41.03 
 
 		 1065 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.524137  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  40.57 
 
 		 641 aa  433  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0918  ABC transporter related  41.12 
 
 		 688 aa  429  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.101083 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  40.34 
 
 		 649 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  40.34 
 
 		 661 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  40.34 
 
 		 661 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1204  ABC transporter related  41.06 
 
 		 648 aa  427  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3511  ABC transporter related  41.53 
 
 		 594 aa  423  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0609  ABC transporter, ATP-binding protein  41.56 
 
 		 632 aa  421  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.446122  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0899  ABC transporter related  39.84 
 
 		 663 aa  421  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.998664  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003440  ABC transporter ATP-binding protein uup  39.45 
 
 		 639 aa  421  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.550149  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1093  ABC transporter ATPase component  40.87 
 
 		 639 aa  419  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.140566  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1524  ABC transporter related  44.83 
 
 		 593 aa  421  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.672162 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02335  ABC transporter ATPase component  39.45 
 
 		 639 aa  422  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0828  ABC transporter related  39.62 
 
 		 636 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0975  ABC transporter ATP-binding protein  39.53 
 
 		 636 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000424481  normal  0.109741 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2810  ABC transporter ATPase  40.41 
 
 		 631 aa  416  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0642  ABC transporter related  40.22 
 
 		 629 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.64323  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  37.74 
 
 		 632 aa  416  9.999999999999999e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2052  ABC transporter related  38.18 
 
 		 640 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0425216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1988  ABC transporter ATPase component  38.65 
 
 		 637 aa  415  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1681  ABC transporter ATPase component  39.06 
 
 		 649 aa  412  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0431  putative ATP-binding component of a transport system  40.66 
 
 		 641 aa  413  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000359167  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2551  ABC transporter ATPase component  38.65 
 
 		 637 aa  414  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2640  ABC transporter ATPase component  38.65 
 
 		 637 aa  414  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1634  ABC transporter ATPase component  38.51 
 
 		 641 aa  410  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.202979  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2683  ABC transporter ATPase component  38.2 
 
 		 641 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0324813  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1853  ABC transporter ATPase component  39.19 
 
 		 640 aa  411  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1603  ABC transporter ATPase component  38.88 
 
 		 640 aa  410  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0251377  normal  0.331537 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2608  ABC transporter ATPase component  38.2 
 
 		 641 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00157626  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1744  ABC transporter ATPase component  39.04 
 
 		 634 aa  412  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.30913  hitchhiker  0.0000434555 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1388  ABC transporter related  40.83 
 
 		 623 aa  409  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0285354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2568  ABC transporter ATPase component  38.2 
 
 		 641 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.452475  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1776  ABC transporter ATPase component  38.2 
 
 		 641 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.205391  hitchhiker  0.000192841 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0618  ABC transporter related  41.04 
 
 		 635 aa  410  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000117313 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0138  ABC transporter related  39.41 
 
 		 643 aa  409  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1602  ABC transporter ATPase component  39.38 
 
 		 638 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.52947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1950  ABC transporter related  38.36 
 
 		 653 aa  406  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3830  ABC transporter-related protein  41.91 
 
 		 632 aa  407  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.457691 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1542  ABC transporter ATPase component  38.88 
 
 		 640 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1609  ABC transporter ATPase component  38.88 
 
 		 640 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0838  ABC transporter related  38.98 
 
 		 646 aa  405  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0257096 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  38.05 
 
 		 640 aa  403  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0499  ABC transporter related  40.69 
 
 		 631 aa  405  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.107412  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1605  ABC transporter related  40 
 
 		 644 aa  404  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0890354  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0721  ABC transporter related  38.71 
 
 		 640 aa  405  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>