More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1478 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3509  ABC transporter related  75.87 
 
 		 607 aa  862    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3380  ABC transporter related  75.25 
 
 		 607 aa  861    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0258636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0944  ABC transporter related  60.07 
 
 		 601 aa  688    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1753  ABC transporter, ATP-binding protein  59.97 
 
 		 605 aa  700    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3808  ABC transporter related  58.31 
 
 		 606 aa  699    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.53425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3591  ABC transporter ATPase  64.46 
 
 		 606 aa  759    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.386794  normal  0.0329455 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3104  ABC transporter related  58.49 
 
 		 608 aa  689    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.73656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4137  ABC transporter related  58.28 
 
 		 605 aa  691    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.245336 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3185  ABC transporter related  75.53 
 
 		 607 aa  864    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2153  ABC transporter, ATPase subunit  64.74 
 
 		 602 aa  775    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0704  ABC transporter related  87.81 
 
 		 605 aa  1012    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.041253 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1145  ABC transporter related  60.14 
 
 		 605 aa  700    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1692  ABC transporter, ATP-binding protein  59.97 
 
 		 605 aa  700    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2599  ABC transporter related  65.1 
 
 		 611 aa  795    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0672  ABC transporter related  64.54 
 
 		 609 aa  716    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.276337  normal  0.341528 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3202  ABC transporter related  63.74 
 
 		 603 aa  771    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0349  ABC transporter related  65.12 
 
 		 602 aa  739    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0287299 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3086  ABC transporter related  62.38 
 
 		 609 aa  768    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.395233  normal  0.156942 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2484  ABC transporter related  64.24 
 
 		 605 aa  757    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.10091  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3520  ABC transporter related  62.71 
 
 		 602 aa  669    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2253  ABC transporter related  63.41 
 
 		 607 aa  770    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0543985 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2552  ABC transporter related  64.79 
 
 		 604 aa  793    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0723  ABC transporter related  75.83 
 
 		 599 aa  872    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1478  ABC transporter related  100 
 
 		 607 aa  1193    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.449493  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0131  ABC transporter, ATP-binding protein  53.49 
 
 		 609 aa  645    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3404  ABC transporter related  61.62 
 
 		 604 aa  649    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4261  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  56.38 
 
 		 609 aa  670    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2632  ABC transporter related  61.12 
 
 		 602 aa  713    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.306904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1013  ABC transporter component  52.46 
 
 		 610 aa  588  1e-167  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1714  ABC-transporter ATP-binding protein  52.61 
 
 		 614 aa  578  1.0000000000000001e-163  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0650863 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2717  putative UUP ATPase  51.06 
 
 		 607 aa  575  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1375  ABC transporter related  51.06 
 
 		 607 aa  575  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0588139 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2140  ABC transporter related  51.65 
 
 		 603 aa  571  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.419129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0896  ABC transporter related  52.62 
 
 		 599 aa  553  1e-156  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286143 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0920  ABC transporter related  48.08 
 
 		 596 aa  536  1e-151  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1919  ABC transporter related  51.34 
 
 		 603 aa  520  1e-146  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.338599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3652  ABC transporter related  50.17 
 
 		 604 aa  517  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2068  ABC transporter related  48.35 
 
 		 598 aa  476  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  43.51 
 
 		 642 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  42.57 
 
 		 649 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3923  ABC transporter related  46.42 
 
 		 610 aa  468  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.123801 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3340  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  42.64 
 
 		 645 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  42.41 
 
 		 649 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  42.26 
 
 		 641 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3446  ABC transporter related  46.31 
 
 		 596 aa  459  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1524  ABC transporter related  46.53 
 
 		 593 aa  461  9.999999999999999e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.672162 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  42.26 
 
 		 649 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1204  ABC transporter related  42.28 
 
 		 648 aa  458  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2207  ABC transporter, ATP-binding protein  43.41 
 
 		 648 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.829349  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1144  ABC transporter, ATP-binding protein  43.41 
 
 		 660 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2087  ABC transporter, ATP-binding protein  43.41 
 
 		 648 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  41.81 
 
 		 649 aa  459  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1136  ABC transporter, ATP-binding protein  43.41 
 
 		 660 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0939  ABC transporter, ATP-binding protein  43.57 
 
 		 648 aa  458  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0496893  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2525  ABC transporter, ATP-binding protein  43.41 
 
 		 660 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  41.81 
 
 		 661 aa  458  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0693  ABC transporter, ATP-binding protein  43.41 
 
 		 648 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  41.81 
 
 		 661 aa  458  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0899  ABC transporter related  43.4 
 
 		 663 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.998664  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  41.98 
 
 		 641 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0828  ABC transporter related  42.7 
 
 		 636 aa  455  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2052  ABC transporter related  40.06 
 
 		 640 aa  449  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0425216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1298  ABC transporter, ATP-binding protein  43.41 
 
 		 1065 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.524137  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0918  ABC transporter related  42.88 
 
 		 688 aa  450  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.101083 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0975  ABC transporter ATP-binding protein  42.59 
 
 		 636 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000424481  normal  0.109741 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  40.94 
 
 		 640 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0838  ABC transporter related  42.26 
 
 		 646 aa  445  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0257096 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  41.21 
 
 		 626 aa  444  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0138  ABC transporter related  44.09 
 
 		 643 aa  441  9.999999999999999e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0642  ABC transporter related  40.84 
 
 		 629 aa  438  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.64323  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  40.13 
 
 		 632 aa  435  1e-121  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2563  ABC transporter related protein  44.7 
 
 		 637 aa  433  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0140209 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1950  ABC transporter related  38.66 
 
 		 653 aa  433  1e-120  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0431  putative ATP-binding component of a transport system  43.46 
 
 		 641 aa  434  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000359167  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1988  ABC transporter ATPase component  37.33 
 
 		 637 aa  426  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0181  ferric-enterobactin ABC transporter ATPase  43.77 
 
 		 626 aa  426  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.530164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3059  ABC transporter related  41.59 
 
 		 628 aa  426  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0721  ABC transporter related  39.75 
 
 		 640 aa  427  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3785  ABC transporter related  41.75 
 
 		 628 aa  426  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2640  ABC transporter ATPase component  37.33 
 
 		 637 aa  425  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2551  ABC transporter ATPase component  37.33 
 
 		 637 aa  425  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003440  ABC transporter ATP-binding protein uup  38.56 
 
 		 639 aa  424  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.550149  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0499  ABC transporter related  42.92 
 
 		 631 aa  424  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.107412  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2893  ABC transporter, ATP-binding protein  41.98 
 
 		 620 aa  424  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.669618  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3511  ABC transporter related  43.21 
 
 		 594 aa  425  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2398  ABC transporter related  43.14 
 
 		 650 aa  425  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2512  ABC transporter related  41.98 
 
 		 620 aa  424  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.926021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02335  ABC transporter ATPase component  38.4 
 
 		 639 aa  424  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1572  ABC transporter related  45.85 
 
 		 603 aa  421  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1605  ABC transporter related  42.39 
 
 		 644 aa  421  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0890354  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1388  ABC transporter related  41.52 
 
 		 623 aa  420  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0285354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4373  ABC transporter-related protein  41.84 
 
 		 629 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0223118  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0609  ABC transporter, ATP-binding protein  43.33 
 
 		 632 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.446122  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1126  ABC transporter related  39.69 
 
 		 634 aa  416  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.239651 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1982  hypothetical protein  38.73 
 
 		 617 aa  416  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1582  ABC transporter related  39.29 
 
 		 648 aa  418  9.999999999999999e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0018197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1603  ABC transporter ATPase component  37.99 
 
 		 640 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0251377  normal  0.331537 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1853  ABC transporter ATPase component  38.3 
 
 		 640 aa  414  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1419  ABC transporter:AAA ATPase  39.14 
 
 		 648 aa  414  1e-114  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.148207 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2810  ABC transporter ATPase  42.57 
 
 		 631 aa  415  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>