More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2599 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_2484  ABC transporter related  65.25 
 
 
605 aa  789    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.10091  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3808  ABC transporter related  60.61 
 
 
606 aa  708    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.53425  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0131  ABC transporter, ATP-binding protein  53.04 
 
 
609 aa  638    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0944  ABC transporter related  59.47 
 
 
601 aa  703    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1753  ABC transporter, ATP-binding protein  63.85 
 
 
605 aa  746    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0349  ABC transporter related  65.63 
 
 
602 aa  770    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0287299 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1478  ABC transporter related  65.26 
 
 
607 aa  724    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.449493  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3591  ABC transporter ATPase  66.45 
 
 
606 aa  791    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.386794  normal  0.0329455 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3104  ABC transporter related  61.29 
 
 
608 aa  711    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.73656  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0704  ABC transporter related  66.72 
 
 
605 aa  791    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.041253 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0723  ABC transporter related  64.79 
 
 
599 aa  771    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3185  ABC transporter related  64.92 
 
 
607 aa  765    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1145  ABC transporter related  63.45 
 
 
605 aa  738    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2153  ABC transporter, ATPase subunit  65.36 
 
 
602 aa  802    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2599  ABC transporter related  100 
 
 
611 aa  1222    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4261  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  60 
 
 
609 aa  701    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1692  ABC transporter, ATP-binding protein  63.85 
 
 
605 aa  746    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3520  ABC transporter related  63.44 
 
 
602 aa  702    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3202  ABC transporter related  64.75 
 
 
603 aa  807    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3086  ABC transporter related  64.81 
 
 
609 aa  805    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.395233  normal  0.156942 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3509  ABC transporter related  65.18 
 
 
607 aa  764    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2253  ABC transporter related  65.57 
 
 
607 aa  799    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0543985 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2552  ABC transporter related  65.37 
 
 
604 aa  815    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4137  ABC transporter related  60.07 
 
 
605 aa  711    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.245336 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3404  ABC transporter related  61.25 
 
 
604 aa  665    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0672  ABC transporter related  64.44 
 
 
609 aa  738    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.276337  normal  0.341528 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3380  ABC transporter related  66.12 
 
 
607 aa  771    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0258636  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2632  ABC transporter related  63.83 
 
 
602 aa  762    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.306904  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1013  ABC transporter component  53.48 
 
 
610 aa  629  1e-179  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1714  ABC-transporter ATP-binding protein  53.19 
 
 
614 aa  595  1e-169  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0650863 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1375  ABC transporter related  51.73 
 
 
607 aa  597  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0588139 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2717  putative UUP ATPase  51.73 
 
 
607 aa  597  1e-169  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0896  ABC transporter related  52.92 
 
 
599 aa  598  1e-169  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.286143 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2140  ABC transporter related  50.81 
 
 
603 aa  588  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.419129  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3652  ABC transporter related  52.36 
 
 
604 aa  564  1.0000000000000001e-159  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0920  ABC transporter related  48.84 
 
 
596 aa  552  1e-156  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1919  ABC transporter related  52.02 
 
 
603 aa  537  1e-151  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.338599  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  45.23 
 
 
649 aa  501  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  45.6 
 
 
649 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3923  ABC transporter related  47.9 
 
 
610 aa  496  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.123801 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  45.6 
 
 
649 aa  497  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  44.98 
 
 
642 aa  495  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  45.13 
 
 
649 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  45.13 
 
 
661 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  45.13 
 
 
661 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  43.88 
 
 
641 aa  486  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2068  ABC transporter related  49.17 
 
 
598 aa  486  1e-136  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  43.69 
 
 
641 aa  483  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0975  ABC transporter ATP-binding protein  44.51 
 
 
636 aa  481  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000424481  normal  0.109741 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0939  ABC transporter, ATP-binding protein  44.57 
 
 
648 aa  480  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0496893  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0899  ABC transporter related  44.88 
 
 
663 aa  480  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.998664  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0828  ABC transporter related  44.72 
 
 
636 aa  479  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3340  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  44.11 
 
 
645 aa  479  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2207  ABC transporter, ATP-binding protein  44.62 
 
 
648 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.829349  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2525  ABC transporter, ATP-binding protein  44.62 
 
 
660 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2087  ABC transporter, ATP-binding protein  44.62 
 
 
648 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0693  ABC transporter, ATP-binding protein  44.62 
 
 
648 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1204  ABC transporter related  44.03 
 
 
648 aa  476  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1136  ABC transporter, ATP-binding protein  44.62 
 
 
660 aa  475  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0918  ABC transporter related  44.65 
 
 
688 aa  473  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.101083 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1144  ABC transporter, ATP-binding protein  44.62 
 
 
660 aa  475  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1298  ABC transporter, ATP-binding protein  43.98 
 
 
1065 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.524137  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2398  ABC transporter related  45.37 
 
 
650 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  42.74 
 
 
626 aa  466  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1988  ABC transporter ATPase component  41.1 
 
 
637 aa  465  1e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0642  ABC transporter related  43.43 
 
 
629 aa  463  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.64323  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1524  ABC transporter related  47.7 
 
 
593 aa  462  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.672162 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2551  ABC transporter ATPase component  41.1 
 
 
637 aa  464  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2640  ABC transporter ATPase component  41.1 
 
 
637 aa  464  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3446  ABC transporter related  47.07 
 
 
596 aa  462  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2052  ABC transporter related  40.66 
 
 
640 aa  456  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0425216  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1388  ABC transporter related  43.31 
 
 
623 aa  455  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0285354  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  41.43 
 
 
640 aa  457  1e-127  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1681  ABC transporter ATPase component  41.8 
 
 
649 aa  457  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0721  ABC transporter related  41.64 
 
 
640 aa  458  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1093  ABC transporter ATPase component  41.71 
 
 
639 aa  457  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.140566  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0838  ABC transporter related  44.14 
 
 
646 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0257096 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3785  ABC transporter related  42.79 
 
 
628 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485733  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02335  ABC transporter ATPase component  40.28 
 
 
639 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3059  ABC transporter related  42.79 
 
 
628 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003440  ABC transporter ATP-binding protein uup  41.06 
 
 
639 aa  455  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.550149  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0181  ferric-enterobactin ABC transporter ATPase  44.55 
 
 
626 aa  449  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.530164  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0431  putative ATP-binding component of a transport system  43.63 
 
 
641 aa  449  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000359167  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1950  ABC transporter related  39.94 
 
 
653 aa  449  1e-125  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4373  ABC transporter-related protein  44.23 
 
 
629 aa  449  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0223118  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3830  ABC transporter-related protein  45.48 
 
 
632 aa  451  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.457691 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4229  ABC transporter related  42.28 
 
 
648 aa  452  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.868359 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1126  ABC transporter related  41.32 
 
 
634 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.239651 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0413  ABC transporter related  41.21 
 
 
641 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00715783  hitchhiker  0.000000249616 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1605  ABC transporter related  44.15 
 
 
644 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0890354  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0138  ABC transporter related  42.06 
 
 
643 aa  445  1e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1113  ABC transporter ATPase component  41.19 
 
 
635 aa  444  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00085111  normal  0.933236 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1650  ABC transporter ATPase component  40.87 
 
 
637 aa  443  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2810  ABC transporter ATPase  43.63 
 
 
631 aa  443  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02012  ABC transporter, ATP-binding protein  40.44 
 
 
646 aa  443  1e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0535295  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2170  ABC transporter ATPase component  40.72 
 
 
635 aa  442  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000710719  normal  0.220785 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0609  ABC transporter, ATP-binding protein  43.22 
 
 
632 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.446122  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3511  ABC transporter related  42.43 
 
 
594 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1761  ABC transporter related  41.28 
 
 
642 aa  441  9.999999999999999e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1461  ABC transporter ATPase component  40.41 
 
 
635 aa  442  9.999999999999999e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.185296  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>