More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2140 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1375  ABC transporter related  91.72 
 
 		 607 aa  1105    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0588139 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1714  ABC-transporter ATP-binding protein  70.49 
 
 		 614 aa  828    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0650863 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2717  putative UUP ATPase  91.72 
 
 		 607 aa  1105    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3652  ABC transporter related  75.64 
 
 		 604 aa  860    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1919  ABC transporter related  71.19 
 
 		 603 aa  789    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.338599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0920  ABC transporter related  72.61 
 
 		 596 aa  860    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2140  ABC transporter related  100 
 
 		 603 aa  1197    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.419129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3202  ABC transporter related  51.33 
 
 		 603 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2484  ABC transporter related  52.67 
 
 		 605 aa  589  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.10091  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3086  ABC transporter related  50.17 
 
 		 609 aa  589  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.395233  normal  0.156942 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2552  ABC transporter related  50.08 
 
 		 604 aa  591  1e-167  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2253  ABC transporter related  51.83 
 
 		 607 aa  588  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0543985 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2153  ABC transporter, ATPase subunit  50.91 
 
 		 602 aa  578  1e-164  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2599  ABC transporter related  51.4 
 
 		 611 aa  569  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1013  ABC transporter component  50.49 
 
 		 610 aa  567  1e-160  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0896  ABC transporter related  51.83 
 
 		 599 aa  555  1e-157  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286143 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0723  ABC transporter related  50.08 
 
 		 599 aa  551  1e-155  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4137  ABC transporter related  49.32 
 
 		 605 aa  541  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.245336 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0944  ABC transporter related  51 
 
 		 601 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1692  ABC transporter, ATP-binding protein  48.82 
 
 		 605 aa  538  9.999999999999999e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1753  ABC transporter, ATP-binding protein  48.82 
 
 		 605 aa  538  9.999999999999999e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3591  ABC transporter ATPase  49.08 
 
 		 606 aa  536  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.386794  normal  0.0329455 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0349  ABC transporter related  49.59 
 
 		 602 aa  534  1e-150  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0287299 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3808  ABC transporter related  48.74 
 
 		 606 aa  534  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.53425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3380  ABC transporter related  50.74 
 
 		 607 aa  534  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0258636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3509  ABC transporter related  50.82 
 
 		 607 aa  533  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1145  ABC transporter related  48.39 
 
 		 605 aa  535  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3185  ABC transporter related  50.82 
 
 		 607 aa  533  1e-150  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0672  ABC transporter related  50.43 
 
 		 609 aa  524  1e-147  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.276337  normal  0.341528 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0704  ABC transporter related  49.5 
 
 		 605 aa  522  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.041253 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4261  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.41 
 
 		 609 aa  524  1e-147  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2632  ABC transporter related  48.91 
 
 		 602 aa  516  1.0000000000000001e-145  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.306904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3104  ABC transporter related  48.02 
 
 		 608 aa  514  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.73656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3404  ABC transporter related  50 
 
 		 604 aa  512  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0131  ABC transporter, ATP-binding protein  44.61 
 
 		 609 aa  507  9.999999999999999e-143  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1524  ABC transporter related  48.83 
 
 		 593 aa  502  1e-141  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.672162 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1478  ABC transporter related  51.65 
 
 		 607 aa  501  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.449493  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2068  ABC transporter related  49.34 
 
 		 598 aa  496  1e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3520  ABC transporter related  48.58 
 
 		 602 aa  490  1e-137  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02012  ABC transporter, ATP-binding protein  42.22 
 
 		 646 aa  473  1e-132  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0535295  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3923  ABC transporter related  46.24 
 
 		 610 aa  468  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.123801 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2006  ABC transporter related  39.16 
 
 		 647 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3446  ABC transporter related  44.85 
 
 		 596 aa  444  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2640  ABC transporter ATPase component  38.98 
 
 		 637 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2551  ABC transporter ATPase component  38.98 
 
 		 637 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1988  ABC transporter ATPase component  38.98 
 
 		 637 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0431  putative ATP-binding component of a transport system  41.65 
 
 		 641 aa  434  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000359167  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02335  ABC transporter ATPase component  40.44 
 
 		 639 aa  433  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003440  ABC transporter ATP-binding protein uup  39.97 
 
 		 639 aa  429  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.550149  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  39.1 
 
 		 632 aa  426  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2810  ABC transporter ATPase  40.86 
 
 		 631 aa  426  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1093  ABC transporter ATPase component  39.78 
 
 		 639 aa  424  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.140566  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2398  ABC transporter related  40.49 
 
 		 650 aa  422  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1113  ABC transporter ATPase component  39.03 
 
 		 635 aa  419  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00085111  normal  0.933236 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  39.78 
 
 		 649 aa  421  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2170  ABC transporter ATPase component  38.87 
 
 		 635 aa  419  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000710719  normal  0.220785 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1744  ABC transporter ATPase component  38.5 
 
 		 634 aa  416  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.30913  hitchhiker  0.0000434555 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1681  ABC transporter ATPase component  39.51 
 
 		 649 aa  418  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1650  ABC transporter ATPase component  39.66 
 
 		 637 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1761  ABC transporter related  39.11 
 
 		 642 aa  416  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2052  ABC transporter related  38.47 
 
 		 640 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0425216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1779  ABC transporter, ATP-binding protein  40.25 
 
 		 637 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000514394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1542  ABC transporter ATPase component  36.94 
 
 		 640 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1853  ABC transporter ATPase component  37.25 
 
 		 640 aa  414  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1020  ABC transporter ATPase component  38.71 
 
 		 635 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00168337  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3059  ABC transporter related  40.38 
 
 		 628 aa  414  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  39.78 
 
 		 649 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  39.24 
 
 		 626 aa  415  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  39.78 
 
 		 661 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1064  ABC transporter ATPase component  38.87 
 
 		 635 aa  413  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000187784  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1609  ABC transporter ATPase component  36.94 
 
 		 640 aa  414  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  39.78 
 
 		 649 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1461  ABC transporter ATPase component  37.89 
 
 		 635 aa  414  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.185296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  39.78 
 
 		 661 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1603  ABC transporter ATPase component  36.79 
 
 		 640 aa  412  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0251377  normal  0.331537 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00953  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  38.71 
 
 		 635 aa  411  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000475773  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2694  ABC transporter related protein  38.71 
 
 		 635 aa  411  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.562851  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2368  ABC transporter ATPase component  38.56 
 
 		 635 aa  411  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.561386  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0609  ABC transporter, ATP-binding protein  42.05 
 
 		 632 aa  412  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.446122  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  39.63 
 
 		 649 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00960  hypothetical protein  38.71 
 
 		 635 aa  411  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000554098  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2608  ABC transporter ATPase component  36.34 
 
 		 641 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00157626  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2647  ABC transporter ATPase component  38.71 
 
 		 635 aa  411  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0437839  hitchhiker  0.000617984 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1103  ABC transporter ATPase component  38.56 
 
 		 635 aa  412  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0499  ABC transporter related  40.5 
 
 		 631 aa  411  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.107412  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2683  ABC transporter ATPase component  36.34 
 
 		 641 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0324813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  39.01 
 
 		 642 aa  410  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0138  ABC transporter related  40.37 
 
 		 643 aa  410  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3785  ABC transporter related  40.06 
 
 		 628 aa  411  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1792  ABC transporter ATPase component  39.35 
 
 		 642 aa  412  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1171  ABC transporter ATPase component  38.56 
 
 		 635 aa  412  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1776  ABC transporter ATPase component  36.34 
 
 		 641 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.205391  hitchhiker  0.000192841 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1634  ABC transporter ATPase component  36.34 
 
 		 641 aa  410  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.202979  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1137  ABC transporter ATPase component  38.56 
 
 		 635 aa  412  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2568  ABC transporter ATPase component  36.34 
 
 		 641 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.452475  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1124  ABC transporter ATPase component  38.56 
 
 		 635 aa  412  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.915369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1058  ABC transporter ATPase component  38.71 
 
 		 635 aa  411  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000977813  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2525  ABC transporter, ATP-binding protein  40.31 
 
 		 660 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  37.83 
 
 		 640 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0939  ABC transporter, ATP-binding protein  40.31 
 
 		 648 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0496893  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>