More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2717 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2140  ABC transporter related  92.05 
 
 		 603 aa  1095    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.419129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2717  putative UUP ATPase  100 
 
 		 607 aa  1204    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1919  ABC transporter related  71.31 
 
 		 603 aa  785    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.338599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3652  ABC transporter related  75.68 
 
 		 604 aa  859    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0920  ABC transporter related  71.57 
 
 		 596 aa  853    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1375  ABC transporter related  100 
 
 		 607 aa  1204    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0588139 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1714  ABC-transporter ATP-binding protein  70.07 
 
 		 614 aa  830    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0650863 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3202  ABC transporter related  51.84 
 
 		 603 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2552  ABC transporter related  50.33 
 
 		 604 aa  593  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3086  ABC transporter related  50.66 
 
 		 609 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.395233  normal  0.156942 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2484  ABC transporter related  52.32 
 
 		 605 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.10091  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2253  ABC transporter related  51.82 
 
 		 607 aa  587  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0543985 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2153  ABC transporter, ATPase subunit  51.16 
 
 		 602 aa  581  1e-164  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1013  ABC transporter component  51.55 
 
 		 610 aa  578  1e-164  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2599  ABC transporter related  51.57 
 
 		 611 aa  575  1.0000000000000001e-163  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0723  ABC transporter related  51.49 
 
 		 599 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0896  ABC transporter related  51.9 
 
 		 599 aa  557  1e-157  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286143 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3380  ABC transporter related  51.15 
 
 		 607 aa  548  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0258636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3808  ABC transporter related  49.83 
 
 		 606 aa  544  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.53425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4137  ABC transporter related  49.32 
 
 		 605 aa  542  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.245336 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3185  ABC transporter related  50.82 
 
 		 607 aa  542  1e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1753  ABC transporter, ATP-binding protein  49.66 
 
 		 605 aa  541  9.999999999999999e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3591  ABC transporter ATPase  49.92 
 
 		 606 aa  540  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.386794  normal  0.0329455 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1692  ABC transporter, ATP-binding protein  49.66 
 
 		 605 aa  541  9.999999999999999e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3509  ABC transporter related  50.82 
 
 		 607 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0349  ABC transporter related  50.84 
 
 		 602 aa  538  1e-151  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0287299 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1145  ABC transporter related  48.22 
 
 		 605 aa  533  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0944  ABC transporter related  50.5 
 
 		 601 aa  534  1e-150  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0704  ABC transporter related  50.16 
 
 		 605 aa  528  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.041253 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0672  ABC transporter related  50.59 
 
 		 609 aa  528  1e-149  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.276337  normal  0.341528 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4261  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.83 
 
 		 609 aa  526  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3104  ABC transporter related  49.48 
 
 		 608 aa  523  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.73656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3404  ABC transporter related  50.25 
 
 		 604 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2632  ABC transporter related  49.25 
 
 		 602 aa  516  1.0000000000000001e-145  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.306904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0131  ABC transporter, ATP-binding protein  44.5 
 
 		 609 aa  502  1e-141  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1478  ABC transporter related  51.71 
 
 		 607 aa  504  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.449493  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1524  ABC transporter related  48.74 
 
 		 593 aa  498  1e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.672162 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3520  ABC transporter related  49.25 
 
 		 602 aa  496  1e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2068  ABC transporter related  48.42 
 
 		 598 aa  489  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02012  ABC transporter, ATP-binding protein  42.17 
 
 		 646 aa  479  1e-134  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0535295  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3923  ABC transporter related  46.9 
 
 		 610 aa  474  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.123801 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3446  ABC transporter related  46.45 
 
 		 596 aa  458  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2640  ABC transporter ATPase component  39.28 
 
 		 637 aa  449  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2551  ABC transporter ATPase component  39.28 
 
 		 637 aa  449  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1988  ABC transporter ATPase component  39.28 
 
 		 637 aa  450  1e-125  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2006  ABC transporter related  38.81 
 
 		 647 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0431  putative ATP-binding component of a transport system  41.3 
 
 		 641 aa  436  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000359167  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1093  ABC transporter ATPase component  39.63 
 
 		 639 aa  429  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.140566  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02335  ABC transporter ATPase component  40.53 
 
 		 639 aa  431  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003440  ABC transporter ATP-binding protein uup  39.97 
 
 		 639 aa  429  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.550149  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1779  ABC transporter, ATP-binding protein  41.4 
 
 		 637 aa  427  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000514394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1020  ABC transporter ATPase component  39.25 
 
 		 635 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00168337  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1650  ABC transporter ATPase component  40.13 
 
 		 637 aa  423  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2810  ABC transporter ATPase  41.54 
 
 		 631 aa  423  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1113  ABC transporter ATPase component  39.25 
 
 		 635 aa  424  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00085111  normal  0.933236 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1681  ABC transporter ATPase component  39.69 
 
 		 649 aa  424  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  40.07 
 
 		 632 aa  422  1e-117  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1744  ABC transporter ATPase component  39.28 
 
 		 634 aa  421  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.30913  hitchhiker  0.0000434555 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1137  ABC transporter ATPase component  39.09 
 
 		 635 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1171  ABC transporter ATPase component  39.09 
 
 		 635 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1103  ABC transporter ATPase component  39.09 
 
 		 635 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2170  ABC transporter ATPase component  38.99 
 
 		 635 aa  421  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000710719  normal  0.220785 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1124  ABC transporter ATPase component  39.09 
 
 		 635 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.915369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1461  ABC transporter ATPase component  38.3 
 
 		 635 aa  420  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.185296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  39.72 
 
 		 649 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1761  ABC transporter related  38.45 
 
 		 642 aa  416  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0138  ABC transporter related  40.77 
 
 		 643 aa  418  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0499  ABC transporter related  41.77 
 
 		 631 aa  417  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.107412  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00953  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  38.84 
 
 		 635 aa  413  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000475773  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2694  ABC transporter related protein  38.84 
 
 		 635 aa  413  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.562851  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1792  ABC transporter ATPase component  39.19 
 
 		 642 aa  414  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  39.57 
 
 		 649 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1058  ABC transporter ATPase component  38.84 
 
 		 635 aa  413  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000977813  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00960  hypothetical protein  38.84 
 
 		 635 aa  413  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000554098  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0899  ABC transporter related  40.25 
 
 		 663 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.998664  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0828  ABC transporter related  39.94 
 
 		 636 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0838  ABC transporter related  40.37 
 
 		 646 aa  414  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0257096 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  39.78 
 
 		 642 aa  415  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  38.73 
 
 		 640 aa  414  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2647  ABC transporter ATPase component  38.84 
 
 		 635 aa  413  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0437839  hitchhiker  0.000617984 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2398  ABC transporter related  39.63 
 
 		 650 aa  414  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  39.32 
 
 		 641 aa  414  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  39.57 
 
 		 661 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1634  ABC transporter ATPase component  36.59 
 
 		 641 aa  414  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.202979  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1064  ABC transporter ATPase component  38.99 
 
 		 635 aa  414  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000187784  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1542  ABC transporter ATPase component  36.65 
 
 		 640 aa  413  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2368  ABC transporter ATPase component  38.68 
 
 		 635 aa  412  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.561386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  39.57 
 
 		 661 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  39.57 
 
 		 649 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0609  ABC transporter, ATP-binding protein  42.25 
 
 		 632 aa  412  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.446122  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0918  ABC transporter related  40.12 
 
 		 688 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.101083 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1950  ABC transporter related  37.6 
 
 		 653 aa  411  1e-113  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1853  ABC transporter ATPase component  37.11 
 
 		 640 aa  410  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1603  ABC transporter ATPase component  36.34 
 
 		 640 aa  409  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0251377  normal  0.331537 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3511  ABC transporter related  41.82 
 
 		 594 aa  411  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1609  ABC transporter ATPase component  36.65 
 
 		 640 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  39.57 
 
 		 649 aa  411  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1388  ABC transporter related  39.53 
 
 		 623 aa  409  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0285354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  38.78 
 
 		 626 aa  407  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3059  ABC transporter related  39.56 
 
 		 628 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>