More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1524 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3446  ABC transporter related  72.32 
 
 		 596 aa  782    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2068  ABC transporter related  73.61 
 
 		 598 aa  811    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1524  ABC transporter related  100 
 
 		 593 aa  1176    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.672162 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1375  ABC transporter related  48.91 
 
 		 607 aa  543  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0588139 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2140  ABC transporter related  48.83 
 
 		 603 aa  542  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.419129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2717  putative UUP ATPase  48.91 
 
 		 607 aa  543  1e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1013  ABC transporter component  49.5 
 
 		 610 aa  543  1e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3202  ABC transporter related  48.34 
 
 		 603 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1714  ABC-transporter ATP-binding protein  48.05 
 
 		 614 aa  510  1e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0650863 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2484  ABC transporter related  48.68 
 
 		 605 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.10091  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3086  ABC transporter related  47.2 
 
 		 609 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.395233  normal  0.156942 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0723  ABC transporter related  48.59 
 
 		 599 aa  502  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2153  ABC transporter, ATPase subunit  47.51 
 
 		 602 aa  500  1e-140  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2552  ABC transporter related  46.35 
 
 		 604 aa  499  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2253  ABC transporter related  48.07 
 
 		 607 aa  498  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0543985 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3652  ABC transporter related  48.96 
 
 		 604 aa  492  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0920  ABC transporter related  44.8 
 
 		 596 aa  491  1e-137  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1145  ABC transporter related  46.95 
 
 		 605 aa  491  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1692  ABC transporter, ATP-binding protein  46.95 
 
 		 605 aa  487  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1753  ABC transporter, ATP-binding protein  46.95 
 
 		 605 aa  487  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2599  ABC transporter related  47.95 
 
 		 611 aa  486  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0704  ABC transporter related  47.42 
 
 		 605 aa  482  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.041253 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0944  ABC transporter related  47.53 
 
 		 601 aa  478  1e-133  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0896  ABC transporter related  46.99 
 
 		 599 aa  478  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286143 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3404  ABC transporter related  48.46 
 
 		 604 aa  475  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3520  ABC transporter related  49.66 
 
 		 602 aa  474  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3185  ABC transporter related  47.61 
 
 		 607 aa  475  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3104  ABC transporter related  46.52 
 
 		 608 aa  474  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.73656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3509  ABC transporter related  47.61 
 
 		 607 aa  475  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3591  ABC transporter ATPase  46.78 
 
 		 606 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.386794  normal  0.0329455 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3380  ABC transporter related  48.17 
 
 		 607 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0258636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4261  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.59 
 
 		 609 aa  466  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0349  ABC transporter related  46.46 
 
 		 602 aa  464  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0287299 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0131  ABC transporter, ATP-binding protein  43.71 
 
 		 609 aa  462  1e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1919  ABC transporter related  48.01 
 
 		 603 aa  465  1e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.338599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3808  ABC transporter related  46 
 
 		 606 aa  465  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.53425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2632  ABC transporter related  47.01 
 
 		 602 aa  465  1e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.306904  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4137  ABC transporter related  45.33 
 
 		 605 aa  462  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.245336 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0672  ABC transporter related  46.89 
 
 		 609 aa  451  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.276337  normal  0.341528 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1478  ABC transporter related  47.53 
 
 		 607 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.449493  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3923  ABC transporter related  44.46 
 
 		 610 aa  425  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.123801 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  40.54 
 
 		 626 aa  418  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2640  ABC transporter ATPase component  39.07 
 
 		 637 aa  402  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2551  ABC transporter ATPase component  39.07 
 
 		 637 aa  402  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  38.21 
 
 		 640 aa  402  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1988  ABC transporter ATPase component  39.07 
 
 		 637 aa  403  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  38.66 
 
 		 632 aa  403  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  39.3 
 
 		 642 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  39.53 
 
 		 649 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  39.38 
 
 		 661 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  39.22 
 
 		 649 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  39.38 
 
 		 649 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  39.06 
 
 		 649 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  39.38 
 
 		 661 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0828  ABC transporter related  39.32 
 
 		 636 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2207  ABC transporter, ATP-binding protein  39.75 
 
 		 648 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.829349  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0693  ABC transporter, ATP-binding protein  39.75 
 
 		 648 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3059  ABC transporter related  39.97 
 
 		 628 aa  393  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0899  ABC transporter related  39.48 
 
 		 663 aa  395  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.998664  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3785  ABC transporter related  40.13 
 
 		 628 aa  395  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0939  ABC transporter, ATP-binding protein  39.75 
 
 		 648 aa  394  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0496893  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1144  ABC transporter, ATP-binding protein  39.75 
 
 		 660 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1199  ABC transporter related  39.87 
 
 		 648 aa  395  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.219582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1136  ABC transporter, ATP-binding protein  39.75 
 
 		 660 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2525  ABC transporter, ATP-binding protein  39.75 
 
 		 660 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2087  ABC transporter, ATP-binding protein  39.75 
 
 		 648 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1298  ABC transporter, ATP-binding protein  39.91 
 
 		 1065 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.524137  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  39.14 
 
 		 641 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0918  ABC transporter related  39.84 
 
 		 688 aa  392  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.101083 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2893  ABC transporter, ATP-binding protein  39.97 
 
 		 620 aa  385  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.669618  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2512  ABC transporter related  39.97 
 
 		 620 aa  385  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.926021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003440  ABC transporter ATP-binding protein uup  38.18 
 
 		 639 aa  387  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.550149  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2810  ABC transporter ATPase  38.78 
 
 		 631 aa  387  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0431  putative ATP-binding component of a transport system  39.46 
 
 		 641 aa  388  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000359167  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3340  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  39.21 
 
 		 645 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2398  ABC transporter related  39.56 
 
 		 650 aa  388  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1124  ABC transporter ATPase component  38.54 
 
 		 635 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.915369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1093  ABC transporter ATPase component  39.38 
 
 		 639 aa  383  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.140566  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1744  ABC transporter ATPase component  39.19 
 
 		 634 aa  385  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.30913  hitchhiker  0.0000434555 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2052  ABC transporter related  37.97 
 
 		 640 aa  385  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0425216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02335  ABC transporter ATPase component  37.64 
 
 		 639 aa  384  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4373  ABC transporter-related protein  39.58 
 
 		 629 aa  383  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0223118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  37.8 
 
 		 641 aa  385  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1650  ABC transporter ATPase component  38.64 
 
 		 637 aa  380  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1103  ABC transporter ATPase component  38.38 
 
 		 635 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3511  ABC transporter related  39.43 
 
 		 594 aa  382  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1681  ABC transporter ATPase component  38.54 
 
 		 649 aa  379  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1171  ABC transporter ATPase component  38.38 
 
 		 635 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1761  ABC transporter related  36.84 
 
 		 642 aa  381  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0642  ABC transporter related  38.51 
 
 		 629 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.64323  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0138  ABC transporter related  38.46 
 
 		 643 aa  379  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1020  ABC transporter ATPase component  38.38 
 
 		 635 aa  382  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00168337  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1137  ABC transporter ATPase component  38.38 
 
 		 635 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2006  ABC transporter related  36.72 
 
 		 647 aa  379  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0975  ABC transporter ATP-binding protein  38.03 
 
 		 636 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000424481  normal  0.109741 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1982  hypothetical protein  36.77 
 
 		 617 aa  376  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1113  ABC transporter ATPase component  37.95 
 
 		 635 aa  377  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00085111  normal  0.933236 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0413  ABC transporter related  39.14 
 
 		 641 aa  376  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00715783  hitchhiker  0.000000249616 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1204  ABC transporter related  38.71 
 
 		 648 aa  379  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2171  ABC transporter related  39.31 
 
 		 645 aa  372  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380674  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>