More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2893 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2512  ABC transporter related  100 
 
 		 620 aa  1233    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.926021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2893  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 620 aa  1233    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.669618  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  50.7 
 
 		 640 aa  598  1e-170  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  51.1 
 
 		 641 aa  584  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1199  ABC transporter related  51.73 
 
 		 648 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.219582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  50.86 
 
 		 642 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0899  ABC transporter related  50.94 
 
 		 663 aa  567  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.998664  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0828  ABC transporter related  50.23 
 
 		 636 aa  565  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0975  ABC transporter ATP-binding protein  50.7 
 
 		 636 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000424481  normal  0.109741 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2810  ABC transporter ATPase  50 
 
 		 631 aa  552  1e-156  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1605  ABC transporter related  50.86 
 
 		 644 aa  548  1e-155  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0890354  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3059  ABC transporter related  50.48 
 
 		 628 aa  533  1e-150  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0499  ABC transporter related  50.63 
 
 		 631 aa  534  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.107412  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3785  ABC transporter related  50.48 
 
 		 628 aa  533  1e-150  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0838  ABC transporter related  48.01 
 
 		 646 aa  535  1e-150  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0257096 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  47.23 
 
 		 649 aa  532  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3340  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  47.38 
 
 		 645 aa  533  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  47.21 
 
 		 626 aa  533  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  47.38 
 
 		 649 aa  534  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  47.08 
 
 		 649 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1204  ABC transporter related  47 
 
 		 648 aa  530  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  47.23 
 
 		 661 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  47.23 
 
 		 661 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  47.08 
 
 		 649 aa  526  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0181  ferric-enterobactin ABC transporter ATPase  49.2 
 
 		 626 aa  528  1e-148  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.530164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  46.68 
 
 		 641 aa  523  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3830  ABC transporter-related protein  49.11 
 
 		 632 aa  524  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.457691 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0918  ABC transporter related  47.69 
 
 		 688 aa  520  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.101083 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0642  ABC transporter related  46.74 
 
 		 629 aa  521  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.64323  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1144  ABC transporter, ATP-binding protein  47.83 
 
 		 660 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2052  ABC transporter related  44.34 
 
 		 640 aa  515  1.0000000000000001e-145  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0425216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2525  ABC transporter, ATP-binding protein  47.99 
 
 		 660 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2207  ABC transporter, ATP-binding protein  47.99 
 
 		 648 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.829349  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0721  ABC transporter related  46.93 
 
 		 640 aa  516  1.0000000000000001e-145  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1136  ABC transporter, ATP-binding protein  47.83 
 
 		 660 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2087  ABC transporter, ATP-binding protein  47.99 
 
 		 648 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1126  ABC transporter related  47.14 
 
 		 634 aa  518  1.0000000000000001e-145  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.239651 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0693  ABC transporter, ATP-binding protein  47.99 
 
 		 648 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0618  ABC transporter related  49.29 
 
 		 635 aa  516  1.0000000000000001e-145  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000117313 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1298  ABC transporter, ATP-binding protein  47.99 
 
 		 1065 aa  514  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.524137  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4373  ABC transporter-related protein  48.19 
 
 		 629 aa  512  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0223118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1761  ABC transporter related  44.98 
 
 		 642 aa  515  1e-144  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0939  ABC transporter, ATP-binding protein  47.15 
 
 		 648 aa  513  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0496893  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  43.8 
 
 		 632 aa  510  1e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2398  ABC transporter related  47 
 
 		 650 aa  510  1e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1388  ABC transporter related  46.89 
 
 		 623 aa  511  1e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0285354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0413  ABC transporter related  45.67 
 
 		 641 aa  507  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00715783  hitchhiker  0.000000249616 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4771  ABC transporter related  49.25 
 
 		 635 aa  506  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1649  ABC transporter related  46.42 
 
 		 642 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.39648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0138  ABC transporter related  48.83 
 
 		 643 aa  505  9.999999999999999e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0609  ABC transporter, ATP-binding protein  47.83 
 
 		 632 aa  504  1e-141  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.446122  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4229  ABC transporter related  45.67 
 
 		 648 aa  504  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.868359 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1650  ABC transporter related protein  44.38 
 
 		 641 aa  502  1e-141  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1602  ABC transporter ATPase component  44.04 
 
 		 638 aa  496  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.52947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3511  ABC transporter related  46.99 
 
 		 594 aa  496  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2171  ABC transporter related  47.27 
 
 		 645 aa  498  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2551  ABC transporter ATPase component  42.81 
 
 		 637 aa  493  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2640  ABC transporter ATPase component  42.81 
 
 		 637 aa  493  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1988  ABC transporter ATPase component  42.81 
 
 		 637 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1603  ABC transporter ATPase component  42.54 
 
 		 640 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0251377  normal  0.331537 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1542  ABC transporter ATPase component  42.23 
 
 		 640 aa  491  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1609  ABC transporter ATPase component  42.39 
 
 		 640 aa  489  1e-137  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2563  ABC transporter related protein  46.61 
 
 		 637 aa  487  1e-136  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0140209 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2145  ABC transporter ATPase component  43.55 
 
 		 639 aa  487  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.338763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2006  ABC transporter related  41.71 
 
 		 647 aa  488  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2131  ABC transporter ATP-binding protein  45.79 
 
 		 642 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.40675  normal  0.030462 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1853  ABC transporter ATPase component  42.07 
 
 		 640 aa  484  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2568  ABC transporter ATPase component  42.17 
 
 		 641 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.452475  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2683  ABC transporter ATPase component  42.17 
 
 		 641 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0324813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0431  putative ATP-binding component of a transport system  46.09 
 
 		 641 aa  483  1e-135  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000359167  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3609  ABC transporter related  45.79 
 
 		 642 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677442  normal  0.278537 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2608  ABC transporter ATPase component  42.17 
 
 		 641 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00157626  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1948  ABC transporter ATPase component  43.23 
 
 		 645 aa  485  1e-135  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000765701  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1776  ABC transporter ATPase component  42.17 
 
 		 641 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.205391  hitchhiker  0.000192841 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1673  ABC transporter related  45.58 
 
 		 642 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437344 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1461  ABC transporter ATPase component  42.7 
 
 		 635 aa  479  1e-134  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.185296  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3521  ABC transporter, ATP-binding protein  44.91 
 
 		 636 aa  479  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3294  ABC transporter  45.06 
 
 		 636 aa  482  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.313351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1634  ABC transporter ATPase component  41.69 
 
 		 641 aa  481  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.202979  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003440  ABC transporter ATP-binding protein uup  43.42 
 
 		 639 aa  481  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.550149  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1650  ABC transporter ATPase component  43.42 
 
 		 637 aa  480  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2471  ABC transporter ATPase component  42.95 
 
 		 638 aa  478  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0490995  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3882  ABC transporter-like  45.31 
 
 		 640 aa  478  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153189 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02335  ABC transporter ATPase component  43.57 
 
 		 639 aa  477  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1950  ABC transporter related  43.76 
 
 		 653 aa  478  1e-133  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1093  ABC transporter ATPase component  42.41 
 
 		 639 aa  475  1e-133  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.140566  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1576  ABC transporter related  46.18 
 
 		 641 aa  476  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.712623 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0913  ABC transporter, ATP-binding protein  46.28 
 
 		 633 aa  474  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14160  ABC transporter, ATP binding component  45.92 
 
 		 639 aa  474  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1744  ABC transporter ATPase component  41.9 
 
 		 634 aa  472  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.30913  hitchhiker  0.0000434555 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1011  ABC transporter related  45.98 
 
 		 636 aa  474  1e-132  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.954717  normal  0.0514719 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2659  ABC transporter ATPase component  42.61 
 
 		 638 aa  474  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1814  ABC transporter ATPase component  42.32 
 
 		 639 aa  472  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000485056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1779  ABC transporter, ATP-binding protein  49.52 
 
 		 637 aa  471  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000514394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2281  ABC transporter ATP-binding protein  43.64 
 
 		 638 aa  471  1.0000000000000001e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.962843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1140  ABC transporter related  43.64 
 
 		 645 aa  469  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0384  ABC transporter related  46.19 
 
 		 628 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2170  ABC transporter ATPase component  42.47 
 
 		 635 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000710719  normal  0.220785 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1632  ABC transporter related  44.98 
 
 		 627 aa  465  1e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.27498  normal  0.259057 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25020  ABC transporter ATP-binding protein  46.33 
 
 		 640 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>