More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0920 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2717  putative UUP ATPase  72.07 
 
 		 607 aa  858    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1375  ABC transporter related  72.07 
 
 		 607 aa  858    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0588139 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1714  ABC-transporter ATP-binding protein  69.83 
 
 		 614 aa  823    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0650863 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1919  ABC transporter related  69.72 
 
 		 603 aa  767    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.338599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3652  ABC transporter related  70.4 
 
 		 604 aa  795    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0920  ABC transporter related  100 
 
 		 596 aa  1197    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2140  ABC transporter related  72.18 
 
 		 603 aa  869    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.419129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3202  ABC transporter related  49 
 
 		 603 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3086  ABC transporter related  49.01 
 
 		 609 aa  575  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.395233  normal  0.156942 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2552  ABC transporter related  49.17 
 
 		 604 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1013  ABC transporter component  50.17 
 
 		 610 aa  570  1e-161  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2253  ABC transporter related  50.08 
 
 		 607 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0543985 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2484  ABC transporter related  48.83 
 
 		 605 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.10091  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4137  ABC transporter related  49.83 
 
 		 605 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.245336 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4261  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  50.85 
 
 		 609 aa  565  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2153  ABC transporter, ATPase subunit  49.08 
 
 		 602 aa  564  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3808  ABC transporter related  50.08 
 
 		 606 aa  565  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.53425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3104  ABC transporter related  50.35 
 
 		 608 aa  560  1e-158  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.73656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1145  ABC transporter related  48.55 
 
 		 605 aa  553  1e-156  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1753  ABC transporter, ATP-binding protein  47.96 
 
 		 605 aa  545  1e-154  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1692  ABC transporter, ATP-binding protein  47.96 
 
 		 605 aa  545  1e-154  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0723  ABC transporter related  48.99 
 
 		 599 aa  535  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0944  ABC transporter related  48.81 
 
 		 601 aa  536  1e-151  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0896  ABC transporter related  49.33 
 
 		 599 aa  536  1e-151  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286143 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3591  ABC transporter ATPase  47.83 
 
 		 606 aa  534  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.386794  normal  0.0329455 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2599  ABC transporter related  48.68 
 
 		 611 aa  534  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3509  ABC transporter related  48.57 
 
 		 607 aa  524  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3185  ABC transporter related  48.34 
 
 		 607 aa  524  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0131  ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 		 609 aa  514  1e-144  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3380  ABC transporter related  48.58 
 
 		 607 aa  514  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0258636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0349  ABC transporter related  48.33 
 
 		 602 aa  512  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0287299 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3404  ABC transporter related  47.95 
 
 		 604 aa  507  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2632  ABC transporter related  48.07 
 
 		 602 aa  506  9.999999999999999e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.306904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0704  ABC transporter related  46.38 
 
 		 605 aa  500  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.041253 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0672  ABC transporter related  48.46 
 
 		 609 aa  499  1e-140  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.276337  normal  0.341528 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3520  ABC transporter related  46.06 
 
 		 602 aa  473  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1478  ABC transporter related  48.17 
 
 		 607 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.449493  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2068  ABC transporter related  46.28 
 
 		 598 aa  465  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1524  ABC transporter related  45.85 
 
 		 593 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.672162 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02012  ABC transporter, ATP-binding protein  41.43 
 
 		 646 aa  444  1e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0535295  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0431  putative ATP-binding component of a transport system  41.71 
 
 		 641 aa  442  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000359167  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  38.92 
 
 		 632 aa  440  9.999999999999999e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3923  ABC transporter related  45.5 
 
 		 610 aa  442  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.123801 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1988  ABC transporter ATPase component  38.84 
 
 		 637 aa  438  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2640  ABC transporter ATPase component  38.84 
 
 		 637 aa  439  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2551  ABC transporter ATPase component  38.84 
 
 		 637 aa  439  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2006  ABC transporter related  38.39 
 
 		 647 aa  434  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3446  ABC transporter related  43.94 
 
 		 596 aa  435  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3511  ABC transporter related  41.41 
 
 		 594 aa  424  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  39.51 
 
 		 649 aa  423  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  40.52 
 
 		 649 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  39.1 
 
 		 626 aa  420  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  40.06 
 
 		 649 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1681  ABC transporter ATPase component  40 
 
 		 649 aa  418  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  40.06 
 
 		 649 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2810  ABC transporter ATPase  41.46 
 
 		 631 aa  418  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0899  ABC transporter related  39.65 
 
 		 663 aa  418  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.998664  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  40.06 
 
 		 661 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  40.06 
 
 		 661 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0828  ABC transporter related  39.34 
 
 		 636 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2052  ABC transporter related  40.06 
 
 		 640 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0425216  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0913  ABC transporter, ATP-binding protein  41.26 
 
 		 633 aa  413  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  39.12 
 
 		 642 aa  414  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0918  ABC transporter related  40.18 
 
 		 688 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.101083 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1650  ABC transporter ATPase component  39.81 
 
 		 637 aa  415  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  39.35 
 
 		 641 aa  411  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1093  ABC transporter ATPase component  39.37 
 
 		 639 aa  410  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.140566  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  38.11 
 
 		 640 aa  410  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0939  ABC transporter, ATP-binding protein  39.75 
 
 		 648 aa  409  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0496893  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2398  ABC transporter related  38.85 
 
 		 650 aa  410  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  39.18 
 
 		 641 aa  409  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0138  ABC transporter related  38.51 
 
 		 643 aa  410  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2563  ABC transporter related protein  41.59 
 
 		 637 aa  409  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0140209 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02335  ABC transporter ATPase component  38.28 
 
 		 639 aa  408  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3340  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  38.24 
 
 		 645 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1171  ABC transporter ATPase component  38.71 
 
 		 635 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0693  ABC transporter, ATP-binding protein  39.2 
 
 		 648 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2207  ABC transporter, ATP-binding protein  39.2 
 
 		 648 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.829349  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2087  ABC transporter, ATP-binding protein  39.2 
 
 		 648 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0838  ABC transporter related  38.63 
 
 		 646 aa  403  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0257096 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1744  ABC transporter ATPase component  38.13 
 
 		 634 aa  405  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.30913  hitchhiker  0.0000434555 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1136  ABC transporter, ATP-binding protein  39.2 
 
 		 660 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1124  ABC transporter ATPase component  38.71 
 
 		 635 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.915369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2525  ABC transporter, ATP-binding protein  39.2 
 
 		 660 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1020  ABC transporter ATPase component  38.09 
 
 		 635 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00168337  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1103  ABC transporter ATPase component  38.71 
 
 		 635 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1144  ABC transporter, ATP-binding protein  39.2 
 
 		 660 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1137  ABC transporter ATPase component  38.71 
 
 		 635 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003440  ABC transporter ATP-binding protein uup  37.97 
 
 		 639 aa  403  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.550149  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1461  ABC transporter ATPase component  38.27 
 
 		 635 aa  402  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.185296  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0975  ABC transporter ATP-binding protein  38.78 
 
 		 636 aa  402  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000424481  normal  0.109741 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1140  ABC transporter related  38.76 
 
 		 645 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1193  ABC transporter related  42.45 
 
 		 641 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280066  decreased coverage  0.00112176 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1388  ABC transporter related  40.03 
 
 		 623 aa  400  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0285354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1298  ABC transporter, ATP-binding protein  39.51 
 
 		 1065 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.524137  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1204  ABC transporter related  38.15 
 
 		 648 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2170  ABC transporter ATPase component  38.29 
 
 		 635 aa  402  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000710719  normal  0.220785 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1113  ABC transporter ATPase component  38.64 
 
 		 635 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00085111  normal  0.933236 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2512  ABC transporter related  38.26 
 
 		 620 aa  397  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.926021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1779  ABC transporter, ATP-binding protein  40.66 
 
 		 637 aa  396  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000514394  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>