More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1145 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_0349  ABC transporter related  61.02 
 
 
602 aa  704    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0287299 
 
 
-
 
NC_004310  BR1753  ABC transporter, ATP-binding protein  93.21 
 
 
605 aa  1112    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0944  ABC transporter related  55.74 
 
 
601 aa  651    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3591  ABC transporter ATPase  61.82 
 
 
606 aa  728    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.386794  normal  0.0329455 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3509  ABC transporter related  58.9 
 
 
607 aa  684    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2153  ABC transporter, ATPase subunit  63.25 
 
 
602 aa  764    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1692  ABC transporter, ATP-binding protein  93.21 
 
 
605 aa  1112    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0723  ABC transporter related  59.27 
 
 
599 aa  695    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4261  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  69.58 
 
 
609 aa  837    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3185  ABC transporter related  58.68 
 
 
607 aa  685    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0672  ABC transporter related  59.8 
 
 
609 aa  657    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.276337  normal  0.341528 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3202  ABC transporter related  62.91 
 
 
603 aa  768    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3086  ABC transporter related  61.84 
 
 
609 aa  752    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.395233  normal  0.156942 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3520  ABC transporter related  59.57 
 
 
602 aa  644    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3380  ABC transporter related  59.5 
 
 
607 aa  689    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0258636  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2253  ABC transporter related  62.38 
 
 
607 aa  759    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0543985 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2552  ABC transporter related  62.98 
 
 
604 aa  763    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0704  ABC transporter related  59.44 
 
 
605 aa  694    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.041253 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3104  ABC transporter related  72.29 
 
 
608 aa  848    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.73656  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3404  ABC transporter related  70.87 
 
 
604 aa  805    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2599  ABC transporter related  62.88 
 
 
611 aa  738    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1145  ABC transporter related  100 
 
 
605 aa  1212    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0131  ABC transporter, ATP-binding protein  63.12 
 
 
609 aa  763    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4137  ABC transporter related  68.57 
 
 
605 aa  825    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.245336 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1478  ABC transporter related  59.34 
 
 
607 aa  640    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.449493  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2632  ABC transporter related  62.11 
 
 
602 aa  716    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.306904  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3808  ABC transporter related  69.39 
 
 
606 aa  824    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.53425  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2484  ABC transporter related  63.25 
 
 
605 aa  755    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.10091  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1013  ABC transporter component  52.38 
 
 
610 aa  594  1e-168  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0896  ABC transporter related  52.3 
 
 
599 aa  575  1.0000000000000001e-162  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.286143 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1714  ABC-transporter ATP-binding protein  50.99 
 
 
614 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0650863 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0920  ABC transporter related  48.99 
 
 
596 aa  560  1e-158  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2140  ABC transporter related  48.59 
 
 
603 aa  548  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.419129  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1375  ABC transporter related  48.34 
 
 
607 aa  542  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0588139 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2717  putative UUP ATPase  48.34 
 
 
607 aa  542  1e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3652  ABC transporter related  49.32 
 
 
604 aa  530  1e-149  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1919  ABC transporter related  49.75 
 
 
603 aa  515  1e-144  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.338599  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  42.88 
 
 
642 aa  456  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2068  ABC transporter related  47.19 
 
 
598 aa  457  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0642  ABC transporter related  42.39 
 
 
629 aa  449  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.64323  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0899  ABC transporter related  41.1 
 
 
663 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.998664  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  41.65 
 
 
649 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3340  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  41.92 
 
 
645 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  41.09 
 
 
641 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1524  ABC transporter related  46.69 
 
 
593 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.672162 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  41.97 
 
 
649 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  41.93 
 
 
626 aa  445  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3923  ABC transporter related  45.81 
 
 
610 aa  442  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.123801 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0431  putative ATP-binding component of a transport system  42.99 
 
 
641 aa  444  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000359167  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2052  ABC transporter related  41.09 
 
 
640 aa  443  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0425216  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0975  ABC transporter ATP-binding protein  40.79 
 
 
636 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000424481  normal  0.109741 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3446  ABC transporter related  45.16 
 
 
596 aa  439  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1204  ABC transporter related  41.89 
 
 
648 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  41.25 
 
 
649 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0828  ABC transporter related  40.63 
 
 
636 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1136  ABC transporter, ATP-binding protein  41.69 
 
 
660 aa  438  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2207  ABC transporter, ATP-binding protein  41.69 
 
 
648 aa  438  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.829349  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  41.28 
 
 
649 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1144  ABC transporter, ATP-binding protein  41.69 
 
 
660 aa  438  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  40.93 
 
 
640 aa  437  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2525  ABC transporter, ATP-binding protein  41.69 
 
 
660 aa  438  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0939  ABC transporter, ATP-binding protein  41.69 
 
 
648 aa  437  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0496893  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0693  ABC transporter, ATP-binding protein  41.69 
 
 
648 aa  438  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2087  ABC transporter, ATP-binding protein  41.69 
 
 
648 aa  438  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  41.28 
 
 
661 aa  438  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  40.9 
 
 
641 aa  436  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  41.28 
 
 
661 aa  438  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1298  ABC transporter, ATP-binding protein  41.4 
 
 
1065 aa  435  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.524137  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003440  ABC transporter ATP-binding protein uup  41.84 
 
 
639 aa  433  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.550149  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  40.82 
 
 
632 aa  431  1e-119  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0181  ferric-enterobactin ABC transporter ATPase  42.65 
 
 
626 aa  430  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.530164  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0918  ABC transporter related  41.12 
 
 
688 aa  431  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.101083 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0721  ABC transporter related  41.52 
 
 
640 aa  430  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0609  ABC transporter, ATP-binding protein  43.72 
 
 
632 aa  427  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.446122  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3830  ABC transporter-related protein  42.03 
 
 
632 aa  426  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.457691 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1126  ABC transporter related  41.88 
 
 
634 aa  427  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.239651 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3785  ABC transporter related  41.65 
 
 
628 aa  426  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485733  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1542  ABC transporter ATPase component  40.19 
 
 
640 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02335  ABC transporter ATPase component  41.27 
 
 
639 aa  428  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1603  ABC transporter ATPase component  39.88 
 
 
640 aa  425  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0251377  normal  0.331537 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3059  ABC transporter related  41.49 
 
 
628 aa  425  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1634  ABC transporter ATPase component  40.03 
 
 
641 aa  424  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.202979  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1605  ABC transporter related  41.63 
 
 
644 aa  425  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0890354  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2398  ABC transporter related  39.1 
 
 
650 aa  425  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1011  ABC transporter related  40.47 
 
 
636 aa  421  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.954717  normal  0.0514719 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2608  ABC transporter ATPase component  39.88 
 
 
641 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00157626  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1853  ABC transporter ATPase component  39.88 
 
 
640 aa  422  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1776  ABC transporter ATPase component  39.88 
 
 
641 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.205391  hitchhiker  0.000192841 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2683  ABC transporter ATPase component  39.88 
 
 
641 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0324813  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1093  ABC transporter ATPase component  41.35 
 
 
639 aa  422  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.140566  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4373  ABC transporter-related protein  42.16 
 
 
629 aa  421  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0223118  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2006  ABC transporter related  38.65 
 
 
647 aa  420  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2568  ABC transporter ATPase component  39.88 
 
 
641 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.452475  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1609  ABC transporter ATPase component  39.72 
 
 
640 aa  421  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2810  ABC transporter ATPase  41.65 
 
 
631 aa  417  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0413  ABC transporter related  40.97 
 
 
641 aa  419  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00715783  hitchhiker  0.000000249616 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4229  ABC transporter related  40.71 
 
 
648 aa  418  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.868359 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1602  ABC transporter ATPase component  38.94 
 
 
638 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.52947  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0138  ABC transporter related  40.44 
 
 
643 aa  416  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1140  ABC transporter related  40.56 
 
 
645 aa  415  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>