More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3923 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3923  ABC transporter related  100 
 
 
610 aa  1234    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.123801 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1013  ABC transporter component  48.2 
 
 
610 aa  544  1e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0896  ABC transporter related  50.82 
 
 
599 aa  541  9.999999999999999e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.286143 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3086  ABC transporter related  47.22 
 
 
609 aa  535  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.395233  normal  0.156942 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2717  putative UUP ATPase  46.9 
 
 
607 aa  530  1e-149  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2484  ABC transporter related  48.28 
 
 
605 aa  528  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.10091  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1375  ABC transporter related  46.9 
 
 
607 aa  530  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0588139 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2253  ABC transporter related  47.53 
 
 
607 aa  529  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0543985 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3202  ABC transporter related  46.95 
 
 
603 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2552  ABC transporter related  46.72 
 
 
604 aa  526  1e-148  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2153  ABC transporter, ATPase subunit  47.52 
 
 
602 aa  523  1e-147  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2140  ABC transporter related  45.98 
 
 
603 aa  523  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.419129  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2599  ABC transporter related  47.73 
 
 
611 aa  520  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1714  ABC-transporter ATP-binding protein  46.68 
 
 
614 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0650863 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3591  ABC transporter ATPase  46.62 
 
 
606 aa  495  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.386794  normal  0.0329455 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3104  ABC transporter related  47.06 
 
 
608 aa  498  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.73656  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0723  ABC transporter related  46.86 
 
 
599 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0920  ABC transporter related  44.44 
 
 
596 aa  493  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0944  ABC transporter related  45.7 
 
 
601 aa  491  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3652  ABC transporter related  46.79 
 
 
604 aa  491  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3808  ABC transporter related  46.55 
 
 
606 aa  488  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.53425  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4137  ABC transporter related  46.09 
 
 
605 aa  488  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.245336 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0349  ABC transporter related  45.84 
 
 
602 aa  484  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0287299 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4261  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.32 
 
 
609 aa  483  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1753  ABC transporter, ATP-binding protein  46.52 
 
 
605 aa  479  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1692  ABC transporter, ATP-binding protein  46.52 
 
 
605 aa  479  1e-134  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1145  ABC transporter related  46.02 
 
 
605 aa  476  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3404  ABC transporter related  48.22 
 
 
604 aa  474  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3509  ABC transporter related  45.66 
 
 
607 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3185  ABC transporter related  45.66 
 
 
607 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0131  ABC transporter, ATP-binding protein  43.3 
 
 
609 aa  468  9.999999999999999e-131  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3380  ABC transporter related  45.56 
 
 
607 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0258636  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0704  ABC transporter related  45.28 
 
 
605 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.041253 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2632  ABC transporter related  45.89 
 
 
602 aa  467  9.999999999999999e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.306904  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2068  ABC transporter related  46.23 
 
 
598 aa  446  1.0000000000000001e-124  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1919  ABC transporter related  46.59 
 
 
603 aa  447  1.0000000000000001e-124  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.338599  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0672  ABC transporter related  45.22 
 
 
609 aa  444  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.276337  normal  0.341528 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3520  ABC transporter related  45.38 
 
 
602 aa  441  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1478  ABC transporter related  45.93 
 
 
607 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.449493  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3446  ABC transporter related  45.6 
 
 
596 aa  427  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1524  ABC transporter related  44.46 
 
 
593 aa  425  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.672162 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  40.6 
 
 
626 aa  409  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  40.22 
 
 
642 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  39.5 
 
 
641 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  39.51 
 
 
649 aa  404  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  39.81 
 
 
649 aa  405  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  39.66 
 
 
661 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  39.66 
 
 
661 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  39.51 
 
 
649 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2398  ABC transporter related  40.09 
 
 
650 aa  401  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02012  ABC transporter, ATP-binding protein  36.93 
 
 
646 aa  401  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0535295  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  39.66 
 
 
649 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1144  ABC transporter, ATP-binding protein  39.54 
 
 
660 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2207  ABC transporter, ATP-binding protein  39.54 
 
 
648 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.829349  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0838  ABC transporter related  41.15 
 
 
646 aa  397  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0257096 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2087  ABC transporter, ATP-binding protein  39.54 
 
 
648 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2525  ABC transporter, ATP-binding protein  39.54 
 
 
660 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1136  ABC transporter, ATP-binding protein  39.54 
 
 
660 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0693  ABC transporter, ATP-binding protein  39.54 
 
 
648 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0939  ABC transporter, ATP-binding protein  39.32 
 
 
648 aa  395  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0496893  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1779  ABC transporter, ATP-binding protein  39.47 
 
 
637 aa  394  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000514394  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1204  ABC transporter related  39.88 
 
 
648 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  39.5 
 
 
641 aa  391  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3059  ABC transporter related  42.24 
 
 
628 aa  389  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1298  ABC transporter, ATP-binding protein  39.39 
 
 
1065 aa  392  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.524137  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  38.49 
 
 
640 aa  390  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3785  ABC transporter related  42.41 
 
 
628 aa  390  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485733  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0642  ABC transporter related  41.53 
 
 
629 aa  390  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.64323  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3340  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  39.75 
 
 
645 aa  391  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0918  ABC transporter related  39.38 
 
 
688 aa  388  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.101083 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0899  ABC transporter related  39.69 
 
 
663 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.998664  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0828  ABC transporter related  39.53 
 
 
636 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2006  ABC transporter related  36.42 
 
 
647 aa  384  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4373  ABC transporter-related protein  41.32 
 
 
629 aa  381  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0223118  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  38.09 
 
 
632 aa  382  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3511  ABC transporter related  39.04 
 
 
594 aa  376  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0975  ABC transporter ATP-binding protein  39.44 
 
 
636 aa  378  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000424481  normal  0.109741 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2810  ABC transporter ATPase  40.92 
 
 
631 aa  376  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1987  hypothetical protein  37.76 
 
 
617 aa  373  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1982  hypothetical protein  37.91 
 
 
617 aa  373  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1950  ABC transporter related  37 
 
 
653 aa  373  1e-102  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0499  ABC transporter related  40.22 
 
 
631 aa  373  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.107412  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2171  ABC transporter related  40.37 
 
 
645 aa  371  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380674  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2563  ABC transporter related protein  39.09 
 
 
637 aa  372  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0140209 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1602  ABC transporter ATPase component  37.36 
 
 
638 aa  370  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.52947  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1634  ABC transporter ATPase component  37.5 
 
 
641 aa  369  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.202979  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4771  ABC transporter related  41.5 
 
 
635 aa  366  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1388  ABC transporter related  38.58 
 
 
623 aa  367  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0285354  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1988  ABC transporter ATPase component  36.2 
 
 
637 aa  365  1e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00393  ABC transporter ATP-binding protein  40.42 
 
 
615 aa  365  1e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2640  ABC transporter ATPase component  36.2 
 
 
637 aa  365  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2551  ABC transporter ATPase component  36.2 
 
 
637 aa  365  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1582  ABC transporter related  36.94 
 
 
648 aa  364  2e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0018197  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1419  ABC transporter:AAA ATPase  35.65 
 
 
648 aa  363  4e-99  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.148207 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0721  ABC transporter related  38.57 
 
 
640 aa  363  7.0000000000000005e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3830  ABC transporter-related protein  44.06 
 
 
632 aa  363  7.0000000000000005e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.457691 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1199  ABC transporter related  37.54 
 
 
648 aa  362  8e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.219582  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4229  ABC transporter related  38.37 
 
 
648 aa  362  8e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.868359 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1126  ABC transporter related  39 
 
 
634 aa  362  8e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.239651 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0413  ABC transporter related  38.43 
 
 
641 aa  362  9e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00715783  hitchhiker  0.000000249616 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>