More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3520 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_3185  ABC transporter related  64.06 
 
 
607 aa  701    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1145  ABC transporter related  59.22 
 
 
605 aa  671    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3509  ABC transporter related  63.91 
 
 
607 aa  702    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1753  ABC transporter, ATP-binding protein  59.76 
 
 
605 aa  677    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1692  ABC transporter, ATP-binding protein  59.76 
 
 
605 aa  677    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3591  ABC transporter ATPase  60.53 
 
 
606 aa  687    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.386794  normal  0.0329455 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3520  ABC transporter related  100 
 
 
602 aa  1181    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0723  ABC transporter related  63.89 
 
 
599 aa  725    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4137  ABC transporter related  55.88 
 
 
605 aa  648    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.245336 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2153  ABC transporter, ATPase subunit  60.82 
 
 
602 aa  714    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2484  ABC transporter related  60 
 
 
605 aa  697    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.10091  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3808  ABC transporter related  56.29 
 
 
606 aa  647    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.53425  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0704  ABC transporter related  63.73 
 
 
605 aa  696    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.041253 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0672  ABC transporter related  62.76 
 
 
609 aa  690    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.276337  normal  0.341528 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3202  ABC transporter related  60.17 
 
 
603 aa  711    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3086  ABC transporter related  59.61 
 
 
609 aa  711    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.395233  normal  0.156942 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1478  ABC transporter related  62.71 
 
 
607 aa  640    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.449493  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2253  ABC transporter related  60.13 
 
 
607 aa  712    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0543985 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2552  ABC transporter related  60.4 
 
 
604 aa  715    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3404  ABC transporter related  61.5 
 
 
604 aa  647    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3104  ABC transporter related  58.05 
 
 
608 aa  654    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.73656  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0944  ABC transporter related  65.05 
 
 
601 aa  734    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0349  ABC transporter related  62.25 
 
 
602 aa  719    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0287299 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2632  ABC transporter related  58.61 
 
 
602 aa  659    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.306904  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3380  ABC transporter related  64.07 
 
 
607 aa  704    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0258636  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2599  ABC transporter related  63.07 
 
 
611 aa  731    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4261  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  55.73 
 
 
609 aa  630  1e-179  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1013  ABC transporter component  55.43 
 
 
610 aa  615  1e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0131  ABC transporter, ATP-binding protein  53.17 
 
 
609 aa  612  9.999999999999999e-175  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0896  ABC transporter related  52.07 
 
 
599 aa  534  1e-150  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.286143 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1714  ABC-transporter ATP-binding protein  50.33 
 
 
614 aa  521  1e-146  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0650863 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2717  putative UUP ATPase  48.92 
 
 
607 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1375  ABC transporter related  48.92 
 
 
607 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0588139 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2140  ABC transporter related  48.41 
 
 
603 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.419129  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3652  ABC transporter related  49.91 
 
 
604 aa  497  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0920  ABC transporter related  46.19 
 
 
596 aa  498  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1919  ABC transporter related  51.22 
 
 
603 aa  472  1e-132  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.338599  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1524  ABC transporter related  49.49 
 
 
593 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.672162 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2052  ABC transporter related  41.65 
 
 
640 aa  464  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0425216  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  44.9 
 
 
642 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  42.48 
 
 
649 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  42.32 
 
 
649 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2068  ABC transporter related  48.09 
 
 
598 aa  457  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0899  ABC transporter related  43.45 
 
 
663 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.998664  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  42.1 
 
 
626 aa  452  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3446  ABC transporter related  47.26 
 
 
596 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0828  ABC transporter related  43.62 
 
 
636 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  42.01 
 
 
649 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  42.01 
 
 
649 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3340  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  42.66 
 
 
645 aa  450  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  43.2 
 
 
641 aa  449  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  42.01 
 
 
661 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  42.01 
 
 
661 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0642  ABC transporter related  42.2 
 
 
629 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.64323  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  42.29 
 
 
641 aa  444  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1204  ABC transporter related  42.02 
 
 
648 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  41.51 
 
 
640 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0939  ABC transporter, ATP-binding protein  41.92 
 
 
648 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0496893  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0975  ABC transporter ATP-binding protein  42.27 
 
 
636 aa  437  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000424481  normal  0.109741 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2207  ABC transporter, ATP-binding protein  41.44 
 
 
648 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.829349  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0918  ABC transporter related  41.85 
 
 
688 aa  438  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.101083 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2087  ABC transporter, ATP-binding protein  41.44 
 
 
648 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0431  putative ATP-binding component of a transport system  44.39 
 
 
641 aa  438  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000359167  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3511  ABC transporter related  43.65 
 
 
594 aa  437  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1136  ABC transporter, ATP-binding protein  41.44 
 
 
660 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1144  ABC transporter, ATP-binding protein  41.44 
 
 
660 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2525  ABC transporter, ATP-binding protein  41.44 
 
 
660 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0693  ABC transporter, ATP-binding protein  41.44 
 
 
648 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3923  ABC transporter related  45.38 
 
 
610 aa  438  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.123801 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1988  ABC transporter ATPase component  40.92 
 
 
637 aa  434  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2551  ABC transporter ATPase component  40.92 
 
 
637 aa  434  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2640  ABC transporter ATPase component  40.92 
 
 
637 aa  434  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2006  ABC transporter related  39.34 
 
 
647 aa  433  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3059  ABC transporter related  42.44 
 
 
628 aa  433  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0838  ABC transporter related  43.04 
 
 
646 aa  431  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0257096 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1298  ABC transporter, ATP-binding protein  41.44 
 
 
1065 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.524137  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1582  ABC transporter related  39.45 
 
 
648 aa  431  1e-119  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0018197  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4373  ABC transporter-related protein  44.71 
 
 
629 aa  430  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0223118  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3785  ABC transporter related  42.28 
 
 
628 aa  430  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485733  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1950  ABC transporter related  38.44 
 
 
653 aa  430  1e-119  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1093  ABC transporter ATPase component  41.04 
 
 
639 aa  428  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.140566  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003440  ABC transporter ATP-binding protein uup  40.06 
 
 
639 aa  426  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.550149  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1419  ABC transporter:AAA ATPase  39.29 
 
 
648 aa  429  1e-118  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.148207 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02335  ABC transporter ATPase component  40.06 
 
 
639 aa  426  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0138  ABC transporter related  43.33 
 
 
643 aa  426  1e-118  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1388  ABC transporter related  43.5 
 
 
623 aa  427  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0285354  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1776  ABC transporter ATPase component  40.92 
 
 
641 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.205391  hitchhiker  0.000192841 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2683  ABC transporter ATPase component  40.92 
 
 
641 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0324813  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2608  ABC transporter ATPase component  40.92 
 
 
641 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00157626  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2568  ABC transporter ATPase component  40.92 
 
 
641 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.452475  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1199  ABC transporter related  40.1 
 
 
648 aa  423  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.219582  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1603  ABC transporter ATPase component  40.19 
 
 
640 aa  422  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0251377  normal  0.331537 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1779  ABC transporter, ATP-binding protein  41.22 
 
 
637 aa  421  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000514394  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1542  ABC transporter ATPase component  40.34 
 
 
640 aa  422  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1634  ABC transporter ATPase component  39.94 
 
 
641 aa  421  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.202979  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2810  ABC transporter ATPase  42.88 
 
 
631 aa  418  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1761  ABC transporter related  39.07 
 
 
642 aa  416  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1602  ABC transporter ATPase component  39.65 
 
 
638 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.52947  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0499  ABC transporter related  42.34 
 
 
631 aa  416  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.107412  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1609  ABC transporter ATPase component  40.19 
 
 
640 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.111541 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>