More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3446 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3446  ABC transporter related  100 
 
 		 596 aa  1181    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2068  ABC transporter related  72.29 
 
 		 598 aa  828    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1524  ABC transporter related  71.93 
 
 		 593 aa  789    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.672162 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1013  ABC transporter component  49.02 
 
 		 610 aa  561  1e-158  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0723  ABC transporter related  49 
 
 		 599 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3202  ABC transporter related  46.61 
 
 		 603 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2153  ABC transporter, ATPase subunit  46.45 
 
 		 602 aa  509  1e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2253  ABC transporter related  46.92 
 
 		 607 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0543985 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2717  putative UUP ATPase  46.46 
 
 		 607 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3086  ABC transporter related  44.92 
 
 		 609 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.395233  normal  0.156942 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1375  ABC transporter related  46.46 
 
 		 607 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0588139 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2552  ABC transporter related  45.29 
 
 		 604 aa  504  1e-141  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1714  ABC-transporter ATP-binding protein  47.63 
 
 		 614 aa  502  1e-141  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0650863 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0896  ABC transporter related  48.17 
 
 		 599 aa  500  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286143 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2484  ABC transporter related  47.45 
 
 		 605 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.10091  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4261  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.38 
 
 		 609 aa  500  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2599  ABC transporter related  47.39 
 
 		 611 aa  498  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3808  ABC transporter related  46.53 
 
 		 606 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.53425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4137  ABC transporter related  46.61 
 
 		 605 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.245336 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2140  ABC transporter related  44.63 
 
 		 603 aa  491  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.419129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2632  ABC transporter related  46.86 
 
 		 602 aa  489  1e-137  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.306904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3185  ABC transporter related  46.96 
 
 		 607 aa  487  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0944  ABC transporter related  46.96 
 
 		 601 aa  486  1e-136  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3509  ABC transporter related  47.25 
 
 		 607 aa  487  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3591  ABC transporter ATPase  45.8 
 
 		 606 aa  486  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.386794  normal  0.0329455 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0704  ABC transporter related  46.62 
 
 		 605 aa  485  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.041253 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1145  ABC transporter related  47.4 
 
 		 605 aa  485  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3104  ABC transporter related  46.45 
 
 		 608 aa  483  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.73656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1692  ABC transporter, ATP-binding protein  46.89 
 
 		 605 aa  480  1e-134  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1753  ABC transporter, ATP-binding protein  46.89 
 
 		 605 aa  480  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0920  ABC transporter related  43.96 
 
 		 596 aa  479  1e-134  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3380  ABC transporter related  46.63 
 
 		 607 aa  480  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0258636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3652  ABC transporter related  47.77 
 
 		 604 aa  478  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0349  ABC transporter related  45.59 
 
 		 602 aa  473  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0287299 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3520  ABC transporter related  47.26 
 
 		 602 aa  470  1.0000000000000001e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0672  ABC transporter related  45.88 
 
 		 609 aa  461  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.276337  normal  0.341528 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0131  ABC transporter, ATP-binding protein  41.82 
 
 		 609 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1919  ABC transporter related  47.29 
 
 		 603 aa  444  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.338599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1478  ABC transporter related  46.49 
 
 		 607 aa  442  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.449493  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3404  ABC transporter related  45.76 
 
 		 604 aa  445  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3923  ABC transporter related  45.77 
 
 		 610 aa  432  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.123801 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  39.43 
 
 		 632 aa  431  1e-119  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2512  ABC transporter related  40 
 
 		 620 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.926021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  38.77 
 
 		 640 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  40.73 
 
 		 626 aa  408  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2893  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 620 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.669618  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2810  ABC transporter ATPase  41.13 
 
 		 631 aa  405  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2281  ABC transporter ATP-binding protein  40.13 
 
 		 638 aa  399  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.962843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2398  ABC transporter related  39.75 
 
 		 650 aa  398  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2052  ABC transporter related  38.01 
 
 		 640 aa  396  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0425216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2640  ABC transporter ATPase component  37.01 
 
 		 637 aa  395  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1982  hypothetical protein  36.71 
 
 		 617 aa  394  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1988  ABC transporter ATPase component  37.01 
 
 		 637 aa  395  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0828  ABC transporter related  38.73 
 
 		 636 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2551  ABC transporter ATPase component  37.01 
 
 		 637 aa  395  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0899  ABC transporter related  38.89 
 
 		 663 aa  391  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.998664  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0642  ABC transporter related  38.19 
 
 		 629 aa  389  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.64323  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1199  ABC transporter related  39.03 
 
 		 648 aa  390  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.219582  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1987  hypothetical protein  36.29 
 
 		 617 aa  389  1e-106  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3785  ABC transporter related  40.39 
 
 		 628 aa  388  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4373  ABC transporter-related protein  39.91 
 
 		 629 aa  386  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0223118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3059  ABC transporter related  40.03 
 
 		 628 aa  389  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0609  ABC transporter, ATP-binding protein  40.61 
 
 		 632 aa  384  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.446122  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2207  ABC transporter, ATP-binding protein  40.64 
 
 		 648 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.829349  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0693  ABC transporter, ATP-binding protein  40.64 
 
 		 648 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0721  ABC transporter related  38.8 
 
 		 640 aa  383  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2087  ABC transporter, ATP-binding protein  40.64 
 
 		 648 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1126  ABC transporter related  39.34 
 
 		 634 aa  385  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.239651 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1779  ABC transporter, ATP-binding protein  38.79 
 
 		 637 aa  384  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000514394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  38.63 
 
 		 641 aa  384  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2525  ABC transporter, ATP-binding protein  40.1 
 
 		 660 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  39.86 
 
 		 641 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0975  ABC transporter ATP-binding protein  37.8 
 
 		 636 aa  379  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000424481  normal  0.109741 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  40.17 
 
 		 649 aa  382  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1136  ABC transporter, ATP-binding protein  39.94 
 
 		 660 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  38.01 
 
 		 642 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003440  ABC transporter ATP-binding protein uup  37.5 
 
 		 639 aa  381  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.550149  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1761  ABC transporter related  36.51 
 
 		 642 aa  380  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  40 
 
 		 649 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0939  ABC transporter, ATP-binding protein  40.3 
 
 		 648 aa  381  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0496893  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3340  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  39.71 
 
 		 645 aa  381  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1144  ABC transporter, ATP-binding protein  39.94 
 
 		 660 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1124  ABC transporter ATPase component  38.57 
 
 		 635 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.915369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3511  ABC transporter related  38.85 
 
 		 594 aa  377  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  39.46 
 
 		 649 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0838  ABC transporter related  40.23 
 
 		 646 aa  378  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0257096 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1388  ABC transporter related  39.63 
 
 		 623 aa  376  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0285354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0138  ABC transporter related  38.6 
 
 		 643 aa  376  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1298  ABC transporter, ATP-binding protein  40.1 
 
 		 1065 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.524137  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  39.46 
 
 		 649 aa  378  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  38.97 
 
 		 661 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02335  ABC transporter ATPase component  36.96 
 
 		 639 aa  376  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  38.97 
 
 		 661 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1020  ABC transporter ATPase component  38.41 
 
 		 635 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00168337  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1171  ABC transporter ATPase component  38.41 
 
 		 635 aa  375  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1137  ABC transporter ATPase component  38.41 
 
 		 635 aa  375  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1744  ABC transporter ATPase component  37.42 
 
 		 634 aa  373  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.30913  hitchhiker  0.0000434555 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0918  ABC transporter related  39.97 
 
 		 688 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.101083 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0499  ABC transporter related  37.94 
 
 		 631 aa  375  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.107412  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1113  ABC transporter ATPase component  38.25 
 
 		 635 aa  375  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00085111  normal  0.933236 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>