More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0540 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0077  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  71.76 
 
 		 644 aa  924    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0439155  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0967  ABC transporter, ATP-binding protein  64.02 
 
 		 643 aa  794    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0925  ABC transporter, ATP-binding protein  63.86 
 
 		 643 aa  810    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.511016  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0897  ABC transporter, ATP-binding protein  64.64 
 
 		 643 aa  819    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0619  ABC transporter ATP-binding protein uup  72.91 
 
 		 646 aa  952    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.828103  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1268  ABC transporter-related protein  56.32 
 
 		 646 aa  686    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0540  ABC transporter ATP-binding protein uup  100 
 
 		 644 aa  1286    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.692263  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1433  ABC transporter related protein  57.48 
 
 		 649 aa  715    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0571  ABC transporter, ATP-binding protein  63.24 
 
 		 645 aa  798    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.940937  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0644  peptidase T (tripeptide aminopeptidase; aminotripeptidase; tripeptidase)  73.01 
 
 		 643 aa  946    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  37.16 
 
 		 641 aa  399  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1113  ABC transporter ATPase component  38.04 
 
 		 635 aa  392  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00085111  normal  0.933236 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  36.35 
 
 		 642 aa  393  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2170  ABC transporter ATPase component  37.88 
 
 		 635 aa  393  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000710719  normal  0.220785 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0828  ABC transporter related  36.97 
 
 		 636 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  36.97 
 
 		 640 aa  392  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  36.84 
 
 		 649 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00953  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  37.72 
 
 		 635 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000475773  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2694  ABC transporter related protein  37.72 
 
 		 635 aa  387  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.562851  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1988  ABC transporter ATPase component  36.04 
 
 		 637 aa  387  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  36.29 
 
 		 632 aa  386  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2368  ABC transporter ATPase component  37.88 
 
 		 635 aa  386  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.561386  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00960  hypothetical protein  37.72 
 
 		 635 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000554098  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2640  ABC transporter ATPase component  36.04 
 
 		 637 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  36.68 
 
 		 649 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2647  ABC transporter ATPase component  37.72 
 
 		 635 aa  387  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0437839  hitchhiker  0.000617984 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1058  ABC transporter ATPase component  37.72 
 
 		 635 aa  387  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000977813  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2551  ABC transporter ATPase component  36.04 
 
 		 637 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1064  ABC transporter ATPase component  37.88 
 
 		 635 aa  389  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000187784  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0899  ABC transporter related  36.53 
 
 		 663 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.998664  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1103  ABC transporter ATPase component  37.24 
 
 		 635 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1020  ABC transporter ATPase component  37.24 
 
 		 635 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00168337  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1137  ABC transporter ATPase component  37.24 
 
 		 635 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1124  ABC transporter ATPase component  37.24 
 
 		 635 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.915369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1171  ABC transporter ATPase component  37.24 
 
 		 635 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311518  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0609  ABC transporter, ATP-binding protein  38.24 
 
 		 632 aa  381  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.446122  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  36 
 
 		 649 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02335  ABC transporter ATPase component  37.4 
 
 		 639 aa  380  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3785  ABC transporter related  36.62 
 
 		 628 aa  381  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  36.1 
 
 		 649 aa  382  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1093  ABC transporter ATPase component  37.48 
 
 		 639 aa  380  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.140566  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  35.48 
 
 		 626 aa  382  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3340  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  36.54 
 
 		 645 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3059  ABC transporter related  36.62 
 
 		 628 aa  381  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1650  ABC transporter ATPase component  36.46 
 
 		 637 aa  380  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0975  ABC transporter ATP-binding protein  36.16 
 
 		 636 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000424481  normal  0.109741 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  35.84 
 
 		 661 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0918  ABC transporter related  36.36 
 
 		 688 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.101083 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4373  ABC transporter-related protein  36.91 
 
 		 629 aa  376  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0223118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1681  ABC transporter ATPase component  34.8 
 
 		 649 aa  377  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1199  ABC transporter related  37.07 
 
 		 648 aa  377  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.219582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1461  ABC transporter ATPase component  35.56 
 
 		 635 aa  377  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.185296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  35.84 
 
 		 661 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003440  ABC transporter ATP-binding protein uup  36.84 
 
 		 639 aa  379  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.550149  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2479  ABC transporter-related protein  37.31 
 
 		 634 aa  373  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  36.29 
 
 		 641 aa  373  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0413  ABC transporter related  36.43 
 
 		 641 aa  370  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00715783  hitchhiker  0.000000249616 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2207  ABC transporter, ATP-binding protein  35.68 
 
 		 648 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.829349  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02012  ABC transporter, ATP-binding protein  36.55 
 
 		 646 aa  372  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0535295  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1204  ABC transporter related  36.25 
 
 		 648 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2065  ABC transporter ATPase component  36.57 
 
 		 636 aa  369  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1602  ABC transporter ATPase component  36.18 
 
 		 638 aa  370  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.52947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1761  ABC transporter related  37.23 
 
 		 642 aa  371  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1603  ABC transporter ATPase component  35.59 
 
 		 640 aa  371  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0251377  normal  0.331537 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2525  ABC transporter, ATP-binding protein  35.68 
 
 		 660 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2087  ABC transporter, ATP-binding protein  35.68 
 
 		 648 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1609  ABC transporter ATPase component  35.59 
 
 		 640 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0693  ABC transporter, ATP-binding protein  35.68 
 
 		 648 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1298  ABC transporter, ATP-binding protein  35.68 
 
 		 1065 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.524137  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1744  ABC transporter ATPase component  34.3 
 
 		 634 aa  369  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.30913  hitchhiker  0.0000434555 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2398  ABC transporter related  35.4 
 
 		 650 aa  368  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1144  ABC transporter, ATP-binding protein  35.68 
 
 		 660 aa  369  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1136  ABC transporter, ATP-binding protein  35.68 
 
 		 660 aa  369  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1542  ABC transporter ATPase component  35.43 
 
 		 640 aa  369  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1853  ABC transporter ATPase component  35.59 
 
 		 640 aa  365  1e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0939  ABC transporter, ATP-binding protein  35.73 
 
 		 648 aa  365  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0496893  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0499  ABC transporter related  35.16 
 
 		 631 aa  364  2e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.107412  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2659  ABC transporter ATPase component  36.8 
 
 		 638 aa  362  8e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1792  ABC transporter ATPase component  35.59 
 
 		 642 aa  362  1e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2281  ABC transporter ATP-binding protein  36.81 
 
 		 638 aa  361  2e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.962843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0721  ABC transporter related  37.44 
 
 		 640 aa  361  2e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4229  ABC transporter related  36.02 
 
 		 648 aa  360  3e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.868359 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2052  ABC transporter related  34.5 
 
 		 640 aa  360  4e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0425216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2893  ABC transporter, ATP-binding protein  35.34 
 
 		 620 aa  360  6e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.669618  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2145  ABC transporter ATPase component  35.6 
 
 		 639 aa  360  6e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.338763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2512  ABC transporter related  35.34 
 
 		 620 aa  360  6e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.926021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0838  ABC transporter related  36.17 
 
 		 646 aa  359  8e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0257096 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1126  ABC transporter related  36.53 
 
 		 634 aa  358  1.9999999999999998e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.239651 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0642  ABC transporter related  35.41 
 
 		 629 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.64323  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0618  ABC transporter related  35.38 
 
 		 635 aa  357  2.9999999999999997e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000117313 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3830  ABC transporter-related protein  35.24 
 
 		 632 aa  357  3.9999999999999996e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.457691 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2171  ABC transporter related  35.41 
 
 		 645 aa  356  7.999999999999999e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0431  putative ATP-binding component of a transport system  35.28 
 
 		 641 aa  355  1e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000359167  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1553  ABC transporter ATPase component  36.67 
 
 		 636 aa  355  1e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1948  ABC transporter ATPase component  35.78 
 
 		 645 aa  355  2e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000765701  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2471  ABC transporter ATPase component  36.06 
 
 		 638 aa  354  2e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0490995  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1605  ABC transporter related  33.38 
 
 		 644 aa  354  2e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0890354  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2006  ABC transporter related  36.41 
 
 		 647 aa  353  4e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2810  ABC transporter ATPase  33.6 
 
 		 631 aa  353  5e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1634  ABC transporter ATPase component  34.78 
 
 		 641 aa  353  7e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.202979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>