More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0929 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0929  ABC transporter related  100 
 
 		 714 aa  1428    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.526225  normal  0.675301 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0776  ABC transporter-like protein  44.05 
 
 		 626 aa  403  1e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.740868 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  34.79 
 
 		 634 aa  372  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1528  ABC transporter related protein  43 
 
 		 632 aa  364  2e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.319656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1799  ABC transporter related protein  35.6 
 
 		 638 aa  341  4e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  35.48 
 
 		 630 aa  340  5e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14070  ABC transporter related  37.73 
 
 		 640 aa  339  9.999999999999999e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0328486  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  34.78 
 
 		 643 aa  338  9.999999999999999e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  35.69 
 
 		 641 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0024  ABC transporter related protein  32.12 
 
 		 627 aa  338  1.9999999999999998e-91  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  36.87 
 
 		 636 aa  336  9e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  35.54 
 
 		 644 aa  332  2e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  35.93 
 
 		 767 aa  330  5.0000000000000004e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1237  ABC transporter ATPase  33.17 
 
 		 639 aa  329  1.0000000000000001e-88  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0857839  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  33.85 
 
 		 658 aa  327  6e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  33.64 
 
 		 659 aa  325  2e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  33.7 
 
 		 658 aa  325  2e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  33.7 
 
 		 658 aa  325  2e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  33.7 
 
 		 640 aa  325  2e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  33.7 
 
 		 658 aa  325  2e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  33.28 
 
 		 639 aa  324  3e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0506  ABC transporter related  41.37 
 
 		 691 aa  324  4e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  33.7 
 
 		 658 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  36.28 
 
 		 636 aa  321  3e-86  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 644 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  37.27 
 
 		 690 aa  320  5e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  34.06 
 
 		 659 aa  319  1e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  32.52 
 
 		 645 aa  319  1e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 662 aa  318  3e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 644 aa  318  3e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  33.65 
 
 		 635 aa  318  3e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  35.16 
 
 		 634 aa  317  4e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  31.76 
 
 		 637 aa  316  9.999999999999999e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  32.23 
 
 		 632 aa  314  4.999999999999999e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1040  ABC transporter-related protein  35.59 
 
 		 629 aa  313  5.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  31.68 
 
 		 643 aa  313  6.999999999999999e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  37.13 
 
 		 668 aa  312  1e-83  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  31.35 
 
 		 646 aa  309  1.0000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0540  ABC transporter ATP-binding protein uup  30.98 
 
 		 644 aa  309  1.0000000000000001e-82  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.692263  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3740  ABC transporter related  32.55 
 
 		 667 aa  308  3e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.345281  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  36.46 
 
 		 564 aa  307  4.0000000000000004e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0167  ABC transporter related protein  39.13 
 
 		 624 aa  306  6e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692888  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1447  ABC transporter related  34.56 
 
 		 632 aa  306  6e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  32.9 
 
 		 649 aa  306  8.000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  35.13 
 
 		 575 aa  306  9.000000000000001e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  32.2 
 
 		 666 aa  305  2.0000000000000002e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1233  ABC transporter related  37.09 
 
 		 659 aa  304  4.0000000000000003e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.632204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1008  Fis family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 629 aa  304  4.0000000000000003e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.98 
 
 		 645 aa  303  5.000000000000001e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1721  ABC transporter, ATP-binding protein  36.06 
 
 		 643 aa  303  6.000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269264  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2727  ABC transporter related  34.64 
 
 		 649 aa  303  7.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.26231  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  31.62 
 
 		 638 aa  302  1e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1449  ABC transporter  36.06 
 
 		 643 aa  302  2e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.174197  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  35.6 
 
 		 659 aa  301  4e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4007  ABC transporter related protein  32.54 
 
 		 641 aa  301  4e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  33.21 
 
 		 535 aa  301  4e-80  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  34.06 
 
 		 631 aa  301  4e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3318  ABC transporter related protein  36.35 
 
 		 632 aa  299  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1237  ABC transporter related  33.99 
 
 		 638 aa  299  1e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000223212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  37.31 
 
 		 620 aa  299  1e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  32.86 
 
 		 636 aa  298  2e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  33.39 
 
 		 630 aa  298  3e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0238  ABC transporter, ATP-binding protein  35.01 
 
 		 626 aa  297  4e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  34.68 
 
 		 645 aa  297  6e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1613  ABC transporter-related protein  33.64 
 
 		 630 aa  295  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050504  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1126  ABC transporter related  34.19 
 
 		 634 aa  295  2e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.239651 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0217  ABC transporter ATP-binding protein  34.84 
 
 		 626 aa  294  3e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0228  ABC transporter ATP-binding protein  34.84 
 
 		 626 aa  294  3e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2771  ABC transporter related  36.41 
 
 		 578 aa  295  3e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.512603  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  36.7 
 
 		 567 aa  294  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2312  ABC transporter related  32.42 
 
 		 642 aa  293  5e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0077  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  32.29 
 
 		 644 aa  293  6e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0439155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0495  ABC transporter, ATP-binding protein  35.21 
 
 		 514 aa  293  9e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0741  ABC transporter related  31.91 
 
 		 545 aa  293  9e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0595182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50537  predicted protein  36.63 
 
 		 879 aa  292  1e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.437528  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0609  ABC transporter, ATP-binding protein  36.57 
 
 		 632 aa  292  1e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.446122  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  31.66 
 
 		 630 aa  292  1e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0358  ABC transporter, ATP-binding protein  35.21 
 
 		 514 aa  292  1e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.908649  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0299  ABC transporter related  31.81 
 
 		 642 aa  292  1e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0780  ATPase  34.96 
 
 		 630 aa  292  2e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.989868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0644  peptidase T (tripeptide aminopeptidase; aminotripeptidase; tripeptidase)  30.54 
 
 		 643 aa  292  2e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1642  ABC transporter related  37.6 
 
 		 632 aa  291  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  36.88 
 
 		 709 aa  291  3e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  35.18 
 
 		 545 aa  291  3e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2308  ABC transporter, ATP-binding protein  31.98 
 
 		 631 aa  290  4e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000184058  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2010  ABC transporter ATP-binding protein  32.4 
 
 		 631 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000675061  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0204  ABC transporter, ATP-binding protein  34.27 
 
 		 626 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2479  ABC transporter-related protein  36.49 
 
 		 634 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2164  ABC transporter ATP-binding protein  32.4 
 
 		 631 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00326588  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1988  ABC transporter ATPase component  32.37 
 
 		 637 aa  290  6e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0245  ABC transporter, ATP-binding protein  34.8 
 
 		 626 aa  290  7e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2640  ABC transporter ATPase component  32.37 
 
 		 637 aa  290  7e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2551  ABC transporter ATPase component  32.37 
 
 		 637 aa  290  7e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1982  ABC transporter, ATP-binding protein  31.98 
 
 		 631 aa  290  8e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000663544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1964  ABC transporter, ATP-binding protein  31.98 
 
 		 631 aa  290  8e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386922  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  33.59 
 
 		 626 aa  290  8e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0361  ABC transporter, ATP-binding protein  34.83 
 
 		 514 aa  289  1e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.749336  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0093  ABC transporter ATP-binding protein  32.66 
 
 		 536 aa  289  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.785822  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0106  ABC transporter related  32.95 
 
 		 544 aa  289  1e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0721  ABC transporter related  34.13 
 
 		 640 aa  289  1e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>