More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4514 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2181  ABC transporter related  75.19 
 
 
565 aa  726    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163034  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3169  ABC transporter related  65.48 
 
 
541 aa  660    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5386  ABC transporter ATP-binding protein  67.47 
 
 
544 aa  672    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.221909  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4011  ABC transporter related  71.54 
 
 
537 aa  713    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.460893  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4085  ABC transporter related  71.54 
 
 
537 aa  713    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425666  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4514  ABC transporter-related protein  100 
 
 
535 aa  1040    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577215  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4241  ABC transporter related  71.54 
 
 
537 aa  713    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7127  ABC transporter related  64.04 
 
 
541 aa  663    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.618924 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2147  ABC transporter related protein  53.72 
 
 
554 aa  510  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.168618  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2896  ABC transporter-like protein  55.3 
 
 
549 aa  501  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5951  ABC transporter related protein  49.55 
 
 
558 aa  456  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4684  ABC transporter related protein  51.52 
 
 
536 aa  450  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2015  ABC transporter related  51.98 
 
 
553 aa  444  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.464297  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2987  ABC transporter related  52.27 
 
 
555 aa  439  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000223105 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3386  ABC transporter related  51.42 
 
 
516 aa  421  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.409428  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2539  ABC transporter related  44.59 
 
 
531 aa  404  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.552748 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1859  ABC transporter related protein  47.16 
 
 
535 aa  401  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0744608  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1472  ABC transporter related protein  46.17 
 
 
520 aa  379  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1526  ABC transporter related protein  43.54 
 
 
548 aa  375  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.373611  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3586  ABC transporter related protein  47.83 
 
 
530 aa  360  4e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0217  ABC transporter related protein  44.32 
 
 
511 aa  359  7e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.928543  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0854  ABC transporter ATP-binding protein  34.54 
 
 
534 aa  343  4e-93  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0935  ABC transporter related  39.85 
 
 
530 aa  335  9e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2488  ABC transporter related  43.33 
 
 
534 aa  332  1e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0518  ABC transporter related  41.76 
 
 
533 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0822  ABC transporter related  39.2 
 
 
531 aa  322  7e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0684569  normal  0.79375 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3596  ABC transporter related  40.15 
 
 
527 aa  315  9.999999999999999e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.737822  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0218  ABC transporter, ATP-binding protein  30.74 
 
 
529 aa  312  1e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.902745  normal  0.428381 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0963  ABC transporter related  38.72 
 
 
526 aa  310  5e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3494  ABC transporter related  32.33 
 
 
529 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4720  putative ABC transporter, ATP-binding protein  43.08 
 
 
524 aa  307  3e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7142  ABC transporter related  32.01 
 
 
528 aa  303  6.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2015  ABC transporter related  39.47 
 
 
525 aa  301  1e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.406124  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3837  ABC transporter related  39.89 
 
 
532 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1888  ABC transporter related  38.26 
 
 
545 aa  299  9e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0461  ABC transporter related  38.75 
 
 
531 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5053  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.13 
 
 
536 aa  298  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2144  ABC transporter related  30.36 
 
 
529 aa  296  6e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6267  ABC transporter, fused ATPase subunits  39.58 
 
 
548 aa  295  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5557  ABC transporter related  33.14 
 
 
529 aa  294  3e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0047  ABC transporter component  37.69 
 
 
535 aa  293  6e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5328  ABC transporter related  37.12 
 
 
524 aa  291  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.862409 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3913  ABC transporter ATPase  38.39 
 
 
557 aa  289  9e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195461  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2836  ABC transporter related  40.08 
 
 
546 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4308  ABC transporter-related protein  37.86 
 
 
539 aa  288  2.9999999999999996e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1436  ABC transporter ATPase  40.64 
 
 
527 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2411  ABC transporter related  36.6 
 
 
530 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235484  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2973  ABC transporter related  39.92 
 
 
546 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46010  putative ATP-binding component of ABC transporter  39.43 
 
 
538 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640378  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5740  ABC transporter related  38.29 
 
 
553 aa  281  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0750761 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2945  ABC transporter-like  36.9 
 
 
541 aa  281  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2310  ABC transporter related  37.67 
 
 
551 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2924  ABC transporter related  37.67 
 
 
551 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2939  ABC transporter related  38.12 
 
 
550 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2095  ABC transporter related  41.4 
 
 
534 aa  276  5e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472904  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2282  ABC transporter, ATP-binding protein  38.91 
 
 
548 aa  276  8e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0092  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  38.91 
 
 
548 aa  276  8e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0583  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  38.91 
 
 
548 aa  276  8e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3090  ABC transporter, ATP-binding protein  38.91 
 
 
548 aa  276  8e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2006  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  38.91 
 
 
548 aa  276  8e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0401  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  38.91 
 
 
548 aa  276  8e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15947  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0421  ABC transporter, ATP-binding protein  38.91 
 
 
548 aa  276  8e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0348  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  38.62 
 
 
548 aa  274  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.860489  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2097  ABC transporter related  31.09 
 
 
530 aa  272  1e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0494627 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2418  ABC transporter related  37.07 
 
 
525 aa  260  4e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.741222  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1995  ABC transporter-related protein  38.75 
 
 
532 aa  258  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  hitchhiker  0.000319079 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2265  ABC transporter related  36.12 
 
 
525 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  34.06 
 
 
668 aa  248  3e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  34.67 
 
 
709 aa  247  4e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1807  putative ATP-binding component of ABC transporter  33.02 
 
 
531 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.451616  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0400  ABC transporter related  35.4 
 
 
535 aa  241  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.132459  normal  0.738425 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  35.33 
 
 
767 aa  239  8e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19010  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  38.32 
 
 
555 aa  239  1e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0660652 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  34.13 
 
 
690 aa  236  5.0000000000000005e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001382  ABC-type transport system ATPase component  34.03 
 
 
523 aa  236  7e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0479008  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1160  ABC transporter related  36.73 
 
 
532 aa  233  9e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.616262 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1027  ABC transporter related  34.57 
 
 
664 aa  231  3e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15950  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  36.16 
 
 
550 aa  228  2e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2910  ABC transporter related  33.39 
 
 
537 aa  227  3e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2114  ABC transporter related  33.76 
 
 
532 aa  225  1e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  30.26 
 
 
634 aa  225  2e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1858  ABC transporter related  33.83 
 
 
532 aa  224  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00066186 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  32.17 
 
 
638 aa  224  3e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  32.91 
 
 
645 aa  224  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3420  ABC transporter related protein  36.2 
 
 
554 aa  223  6e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.859354  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08326  putative ATP-binding component of ABC transporter  32.78 
 
 
564 aa  222  9.999999999999999e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1880  ABC transporter ATPase  35.38 
 
 
532 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.548476  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2563  ABC transporter related  34.38 
 
 
532 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0199173  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2052  ABC transporter related  32.42 
 
 
640 aa  221  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0425216  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11540  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  35.21 
 
 
532 aa  221  3e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00577413  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  33.71 
 
 
540 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26480  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  35.85 
 
 
539 aa  221  3.9999999999999997e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.460594  normal  0.379064 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  34.68 
 
 
626 aa  218  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  32.58 
 
 
672 aa  218  2e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4079  ABC transporter related  33.83 
 
 
540 aa  218  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  33.27 
 
 
545 aa  218  2.9999999999999998e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  28.34 
 
 
639 aa  217  5e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  30.49 
 
 
631 aa  216  7e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  33.46 
 
 
540 aa  216  9e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  34.81 
 
 
544 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>