More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4684 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4684  ABC transporter related protein  100 
 
 		 536 aa  1042    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2147  ABC transporter related protein  64.07 
 
 		 554 aa  629  1e-179  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.168618  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2896  ABC transporter-like protein  59.26 
 
 		 549 aa  551  1e-156  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2015  ABC transporter related  56.13 
 
 		 553 aa  491  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.464297  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2987  ABC transporter related  56.25 
 
 		 555 aa  490  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000223105 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5951  ABC transporter related protein  51.53 
 
 		 558 aa  484  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1859  ABC transporter related protein  53.08 
 
 		 535 aa  459  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0744608  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3386  ABC transporter related  53.85 
 
 		 516 aa  455  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.409428  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4514  ABC transporter-related protein  51.52 
 
 		 535 aa  450  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577215  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3169  ABC transporter related  50.47 
 
 		 541 aa  441  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1472  ABC transporter related protein  53.32 
 
 		 520 aa  440  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7127  ABC transporter related  47.11 
 
 		 541 aa  433  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.618924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5386  ABC transporter ATP-binding protein  47.68 
 
 		 544 aa  427  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.221909  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2539  ABC transporter related  46.46 
 
 		 531 aa  426  1e-118  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.552748 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3586  ABC transporter related protein  53.77 
 
 		 530 aa  417  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4011  ABC transporter related  49.44 
 
 		 537 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.460893  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4241  ABC transporter related  49.44 
 
 		 537 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4085  ABC transporter related  49.44 
 
 		 537 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1526  ABC transporter related protein  45.72 
 
 		 548 aa  405  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.373611  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0217  ABC transporter related protein  48.76 
 
 		 511 aa  389  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.928543  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2181  ABC transporter related  47.92 
 
 		 565 aa  374  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163034  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0935  ABC transporter related  40.38 
 
 		 530 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0822  ABC transporter related  39.43 
 
 		 531 aa  319  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0684569  normal  0.79375 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3596  ABC transporter related  39.77 
 
 		 527 aa  310  2.9999999999999997e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.737822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0461  ABC transporter related  40.75 
 
 		 531 aa  310  5e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3837  ABC transporter related  41.22 
 
 		 532 aa  306  9.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2488  ABC transporter related  40.57 
 
 		 534 aa  300  4e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0047  ABC transporter component  38.68 
 
 		 535 aa  299  7e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5328  ABC transporter related  38.97 
 
 		 524 aa  296  5e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.862409 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0963  ABC transporter related  37.19 
 
 		 526 aa  295  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0854  ABC transporter ATP-binding protein  32.58 
 
 		 534 aa  291  1e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5557  ABC transporter related  35.05 
 
 		 529 aa  290  6e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3913  ABC transporter ATPase  38.66 
 
 		 557 aa  288  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195461  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2015  ABC transporter related  38.29 
 
 		 525 aa  286  5e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.406124  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1436  ABC transporter ATPase  39.58 
 
 		 527 aa  286  7e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1888  ABC transporter related  36.93 
 
 		 545 aa  283  5.000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5053  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.1 
 
 		 536 aa  281  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7142  ABC transporter related  32.33 
 
 		 528 aa  277  3e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46010  putative ATP-binding component of ABC transporter  39.09 
 
 		 538 aa  273  6e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0518  ABC transporter related  37.07 
 
 		 533 aa  271  2e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0218  ABC transporter, ATP-binding protein  32.46 
 
 		 529 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.902745  normal  0.428381 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2144  ABC transporter related  31.6 
 
 		 529 aa  265  2e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4308  ABC transporter-related protein  37.41 
 
 		 539 aa  264  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2097  ABC transporter related  32.2 
 
 		 530 aa  263  8e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0494627 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5740  ABC transporter related  37.48 
 
 		 553 aa  259  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0750761 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0400  ABC transporter related  37.31 
 
 		 535 aa  247  4e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.132459  normal  0.738425 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2411  ABC transporter related  33.84 
 
 		 530 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2095  ABC transporter related  40.65 
 
 		 534 aa  243  7.999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3494  ABC transporter related  28.44 
 
 		 529 aa  240  4e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4720  putative ABC transporter, ATP-binding protein  35.74 
 
 		 524 aa  237  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6267  ABC transporter, fused ATPase subunits  35.77 
 
 		 548 aa  237  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0348  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.33 
 
 		 548 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.860489  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2265  ABC transporter related  35.9 
 
 		 525 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2836  ABC transporter related  35.99 
 
 		 546 aa  233  9e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2310  ABC transporter related  35.37 
 
 		 551 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2973  ABC transporter related  36.68 
 
 		 546 aa  230  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2924  ABC transporter related  35.37 
 
 		 551 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0401  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.03 
 
 		 548 aa  229  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15947  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0092  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.03 
 
 		 548 aa  229  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2006  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.03 
 
 		 548 aa  229  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0583  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.85 
 
 		 548 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2418  ABC transporter related  36.96 
 
 		 525 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.741222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3090  ABC transporter, ATP-binding protein  36.03 
 
 		 548 aa  229  1e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2282  ABC transporter, ATP-binding protein  36.03 
 
 		 548 aa  229  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0421  ABC transporter, ATP-binding protein  36.03 
 
 		 548 aa  229  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1995  ABC transporter-related protein  37.12 
 
 		 532 aa  228  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  hitchhiker  0.000319079 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2939  ABC transporter related  35.44 
 
 		 550 aa  226  9e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2945  ABC transporter-like  32.55 
 
 		 541 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  29.92 
 
 		 639 aa  222  1.9999999999999999e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  30.26 
 
 		 638 aa  218  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  28.71 
 
 		 634 aa  216  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001382  ABC-type transport system ATPase component  31.31 
 
 		 523 aa  215  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0479008  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  30.9 
 
 		 645 aa  211  2e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  28.83 
 
 		 643 aa  210  6e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  30.44 
 
 		 646 aa  203  5e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2772  ABC transporter related  28.9 
 
 		 519 aa  203  5e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0945  ABC transporter related  28.9 
 
 		 580 aa  203  7e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1807  putative ATP-binding component of ABC transporter  29.14 
 
 		 531 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.451616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0453  ABC transporter related protein  32.91 
 
 		 552 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  32.38 
 
 		 641 aa  201  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  35.4 
 
 		 620 aa  200  6e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  29.04 
 
 		 666 aa  199  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  32.23 
 
 		 659 aa  197  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0961  ABC transporter related  28.86 
 
 		 641 aa  197  5.000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1658  ABC transporter, ATP-binding protein  28.04 
 
 		 644 aa  196  6e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0768628  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  31.58 
 
 		 636 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  30.23 
 
 		 630 aa  196  9e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  33.52 
 
 		 567 aa  196  9e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  33.72 
 
 		 709 aa  195  1e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1642  ABC transporter related  35.52 
 
 		 632 aa  194  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  29.7 
 
 		 637 aa  195  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  31.38 
 
 		 540 aa  195  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  32.51 
 
 		 545 aa  194  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1799  ABC transporter related protein  29.42 
 
 		 638 aa  194  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1237  ABC transporter ATPase  29.17 
 
 		 639 aa  194  3e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0857839  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  31.41 
 
 		 658 aa  194  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  28.09 
 
 		 642 aa  194  4e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000290627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  28.09 
 
 		 642 aa  194  4e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  30.19 
 
 		 644 aa  193  6e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5234  ABC transporter related protein  33.89 
 
 		 555 aa  193  6e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547616  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>