More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3837 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3837  ABC transporter related  100 
 
 		 532 aa  1035    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0822  ABC transporter related  61.79 
 
 		 531 aa  640    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0684569  normal  0.79375 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0935  ABC transporter related  61.22 
 
 		 530 aa  632  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2488  ABC transporter related  58.44 
 
 		 534 aa  540  9.999999999999999e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0461  ABC transporter related  56.95 
 
 		 531 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5328  ABC transporter related  57.77 
 
 		 524 aa  537  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.862409 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3596  ABC transporter related  54.29 
 
 		 527 aa  533  1e-150  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.737822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0047  ABC transporter component  55.81 
 
 		 535 aa  529  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0518  ABC transporter related  53.77 
 
 		 533 aa  526  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2015  ABC transporter related  54.29 
 
 		 525 aa  501  1e-140  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.406124  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1436  ABC transporter ATPase  52.85 
 
 		 527 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2095  ABC transporter related  55.62 
 
 		 534 aa  489  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0963  ABC transporter related  50 
 
 		 526 aa  466  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1888  ABC transporter related  48.85 
 
 		 545 aa  444  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4720  putative ABC transporter, ATP-binding protein  43.02 
 
 		 524 aa  352  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0854  ABC transporter ATP-binding protein  35.67 
 
 		 534 aa  333  5e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4514  ABC transporter-related protein  39.89 
 
 		 535 aa  314  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577215  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2147  ABC transporter related protein  41.44 
 
 		 554 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.168618  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7127  ABC transporter related  40.11 
 
 		 541 aa  312  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.618924 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4684  ABC transporter related protein  41.22 
 
 		 536 aa  312  1e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4241  ABC transporter related  40.87 
 
 		 537 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4011  ABC transporter related  40.87 
 
 		 537 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.460893  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4085  ABC transporter related  40.87 
 
 		 537 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5053  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.44 
 
 		 536 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5386  ABC transporter ATP-binding protein  41.65 
 
 		 544 aa  307  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.221909  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3169  ABC transporter related  40.64 
 
 		 541 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2181  ABC transporter related  42.58 
 
 		 565 aa  295  2e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163034  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2015  ABC transporter related  39.47 
 
 		 553 aa  291  2e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.464297  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2896  ABC transporter-like protein  40.18 
 
 		 549 aa  289  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2987  ABC transporter related  39.47 
 
 		 555 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000223105 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2144  ABC transporter related  32.95 
 
 		 529 aa  283  4.0000000000000003e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7142  ABC transporter related  32 
 
 		 528 aa  279  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3913  ABC transporter ATPase  39.89 
 
 		 557 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195461  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5740  ABC transporter related  38.19 
 
 		 553 aa  269  8.999999999999999e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0750761 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5557  ABC transporter related  32.95 
 
 		 529 aa  268  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0218  ABC transporter, ATP-binding protein  32.08 
 
 		 529 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.902745  normal  0.428381 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5951  ABC transporter related protein  36.55 
 
 		 558 aa  263  6.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4308  ABC transporter-related protein  36 
 
 		 539 aa  262  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2310  ABC transporter related  36.67 
 
 		 551 aa  256  7e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2924  ABC transporter related  36.67 
 
 		 551 aa  256  7e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1526  ABC transporter related protein  35.48 
 
 		 548 aa  256  9e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.373611  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0348  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.24 
 
 		 548 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.860489  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2939  ABC transporter related  36.74 
 
 		 550 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2411  ABC transporter related  34.34 
 
 		 530 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2097  ABC transporter related  30.68 
 
 		 530 aa  247  4e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0494627 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2973  ABC transporter related  36.81 
 
 		 546 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2836  ABC transporter related  36.81 
 
 		 546 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46010  putative ATP-binding component of ABC transporter  37.36 
 
 		 538 aa  244  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6267  ABC transporter, fused ATPase subunits  35.61 
 
 		 548 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3386  ABC transporter related  37.13 
 
 		 516 aa  243  5e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.409428  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1807  putative ATP-binding component of ABC transporter  31.24 
 
 		 531 aa  243  7e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.451616  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0217  ABC transporter related protein  35.85 
 
 		 511 aa  243  7.999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.928543  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3494  ABC transporter related  29.81 
 
 		 529 aa  241  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0092  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.4 
 
 		 548 aa  239  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2282  ABC transporter, ATP-binding protein  35.4 
 
 		 548 aa  239  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0421  ABC transporter, ATP-binding protein  35.4 
 
 		 548 aa  239  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3090  ABC transporter, ATP-binding protein  35.4 
 
 		 548 aa  239  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2006  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.4 
 
 		 548 aa  239  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0401  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.4 
 
 		 548 aa  239  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15947  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0583  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.4 
 
 		 548 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2539  ABC transporter related  33.46 
 
 		 531 aa  236  7e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.552748 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001382  ABC-type transport system ATPase component  31.15 
 
 		 523 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0479008  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1859  ABC transporter related protein  35.32 
 
 		 535 aa  233  5e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0744608  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2945  ABC transporter-like  32.07 
 
 		 541 aa  226  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1220  ABC transporter related  36.22 
 
 		 627 aa  225  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289587 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2265  ABC transporter related  35.12 
 
 		 525 aa  224  4e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2418  ABC transporter related  33.27 
 
 		 525 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.741222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0400  ABC transporter related  35.26 
 
 		 535 aa  220  5e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.132459  normal  0.738425 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3586  ABC transporter related protein  34.71 
 
 		 530 aa  219  1e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1075  ABC transporter related  35.45 
 
 		 627 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000840512 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1549  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  34.26 
 
 		 639 aa  213  7e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1472  ABC transporter related protein  34.99 
 
 		 520 aa  213  7.999999999999999e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3334  ABC transporter related  33.58 
 
 		 637 aa  211  3e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115349 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2596  ABC transporter related  33.4 
 
 		 627 aa  208  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1995  ABC transporter-related protein  36.05 
 
 		 532 aa  207  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  hitchhiker  0.000319079 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2091  ABC transporter related  32.58 
 
 		 627 aa  207  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105315 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3480  ABC transporter related  34.59 
 
 		 634 aa  207  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549576 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0770  ABC transporter related  34.04 
 
 		 629 aa  206  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0943746 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0683  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 640 aa  205  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1673  ABC transporter, ATPase subunit  34.39 
 
 		 625 aa  204  3e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3835  ABC transporter ATP-binding protein  35.5 
 
 		 622 aa  203  7e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.551802 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  29.4 
 
 		 636 aa  203  8e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0692  ABC transporter, ATP-binding protein  33 
 
 		 627 aa  203  8e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.242868  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0945  ABC transporter related  29.57 
 
 		 580 aa  202  8e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1237  ABC transporter ATPase  30.45 
 
 		 639 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0857839  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6763  ABC transporter related  34.78 
 
 		 623 aa  201  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.260757  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3467  ABC transporter related  33.73 
 
 		 625 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2484  ABC transporter related  34 
 
 		 625 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.814906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  31.18 
 
 		 659 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  33.66 
 
 		 632 aa  200  6e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6573  ABC transporter related  35.19 
 
 		 623 aa  200  7e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00902465 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4782  ABC transporter related  35.22 
 
 		 620 aa  200  7e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  30.13 
 
 		 643 aa  199  7.999999999999999e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  30.58 
 
 		 636 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.6 
 
 		 635 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3827  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.6 
 
 		 635 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4634  ABC transporter related  35.22 
 
 		 621 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3764  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.6 
 
 		 635 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.460675 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.6 
 
 		 635 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3118  ABC transporter related  33.8 
 
 		 631 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>