More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2488 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2488  ABC transporter related  100 
 
 		 534 aa  1029    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0822  ABC transporter related  61.74 
 
 		 531 aa  638    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0684569  normal  0.79375 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0935  ABC transporter related  62.36 
 
 		 530 aa  652    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0047  ABC transporter component  57.71 
 
 		 535 aa  557  1e-157  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3596  ABC transporter related  57.03 
 
 		 527 aa  552  1e-156  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.737822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2015  ABC transporter related  58.48 
 
 		 525 aa  550  1e-155  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.406124  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0461  ABC transporter related  58.1 
 
 		 531 aa  551  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5328  ABC transporter related  57.52 
 
 		 524 aa  551  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.862409 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0518  ABC transporter related  56.36 
 
 		 533 aa  548  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3837  ABC transporter related  58.44 
 
 		 532 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1436  ABC transporter ATPase  57.79 
 
 		 527 aa  518  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2095  ABC transporter related  58.44 
 
 		 534 aa  504  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1888  ABC transporter related  52.37 
 
 		 545 aa  487  1e-136  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0963  ABC transporter related  50.57 
 
 		 526 aa  478  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4720  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.53 
 
 		 524 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0854  ABC transporter ATP-binding protein  36.5 
 
 		 534 aa  371  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7127  ABC transporter related  42.8 
 
 		 541 aa  365  1e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.618924 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4241  ABC transporter related  44.94 
 
 		 537 aa  349  7e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4011  ABC transporter related  44.94 
 
 		 537 aa  349  7e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.460893  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4085  ABC transporter related  44.94 
 
 		 537 aa  349  7e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3169  ABC transporter related  43.25 
 
 		 541 aa  347  3e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4514  ABC transporter-related protein  43.33 
 
 		 535 aa  340  4e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577215  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5386  ABC transporter ATP-binding protein  42.46 
 
 		 544 aa  338  9.999999999999999e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.221909  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2896  ABC transporter-like protein  43.15 
 
 		 549 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4308  ABC transporter-related protein  38.62 
 
 		 539 aa  314  1.9999999999999998e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4684  ABC transporter related protein  40.57 
 
 		 536 aa  312  1e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2147  ABC transporter related protein  41.64 
 
 		 554 aa  311  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.168618  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2015  ABC transporter related  41.48 
 
 		 553 aa  309  1.0000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.464297  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5053  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.08 
 
 		 536 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2181  ABC transporter related  42.36 
 
 		 565 aa  307  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163034  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3913  ABC transporter ATPase  41.48 
 
 		 557 aa  299  8e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195461  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5951  ABC transporter related protein  39.16 
 
 		 558 aa  296  6e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2987  ABC transporter related  40.04 
 
 		 555 aa  296  6e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000223105 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5740  ABC transporter related  42.06 
 
 		 553 aa  291  3e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0750761 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3386  ABC transporter related  40.04 
 
 		 516 aa  289  9e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.409428  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6267  ABC transporter, fused ATPase subunits  39.66 
 
 		 548 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0348  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  40.27 
 
 		 548 aa  282  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.860489  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2973  ABC transporter related  41.54 
 
 		 546 aa  282  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7142  ABC transporter related  31.26 
 
 		 528 aa  280  5e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2144  ABC transporter related  31.06 
 
 		 529 aa  277  3e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0092  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  40.96 
 
 		 548 aa  276  5e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0401  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  40.96 
 
 		 548 aa  276  5e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15947  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2006  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  40.96 
 
 		 548 aa  276  5e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2282  ABC transporter, ATP-binding protein  40.96 
 
 		 548 aa  276  5e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0421  ABC transporter, ATP-binding protein  40.96 
 
 		 548 aa  276  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3090  ABC transporter, ATP-binding protein  40.96 
 
 		 548 aa  276  5e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0583  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  40.96 
 
 		 548 aa  276  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2836  ABC transporter related  40.38 
 
 		 546 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3494  ABC transporter related  31.63 
 
 		 529 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46010  putative ATP-binding component of ABC transporter  40.15 
 
 		 538 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0218  ABC transporter, ATP-binding protein  30.49 
 
 		 529 aa  274  3e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.902745  normal  0.428381 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1859  ABC transporter related protein  36.6 
 
 		 535 aa  274  4.0000000000000004e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0744608  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5557  ABC transporter related  33.09 
 
 		 529 aa  273  8.000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2097  ABC transporter related  32.33 
 
 		 530 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0494627 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2310  ABC transporter related  38.48 
 
 		 551 aa  270  7e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2924  ABC transporter related  38.48 
 
 		 551 aa  270  7e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2539  ABC transporter related  35.7 
 
 		 531 aa  267  4e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.552748 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1526  ABC transporter related protein  38.2 
 
 		 548 aa  266  8e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.373611  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2939  ABC transporter related  38.86 
 
 		 550 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2945  ABC transporter-like  34.88 
 
 		 541 aa  261  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3586  ABC transporter related protein  39.11 
 
 		 530 aa  256  7e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2411  ABC transporter related  34.54 
 
 		 530 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1807  putative ATP-binding component of ABC transporter  31.93 
 
 		 531 aa  247  3e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.451616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1995  ABC transporter-related protein  36.79 
 
 		 532 aa  247  3e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  hitchhiker  0.000319079 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0400  ABC transporter related  38 
 
 		 535 aa  243  5e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.132459  normal  0.738425 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001382  ABC-type transport system ATPase component  33.33 
 
 		 523 aa  243  7.999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0479008  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1472  ABC transporter related protein  37.52 
 
 		 520 aa  243  9e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0217  ABC transporter related protein  36.04 
 
 		 511 aa  242  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.928543  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2418  ABC transporter related  35.8 
 
 		 525 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.741222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2265  ABC transporter related  35.48 
 
 		 525 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0084  ABC transporter related  65.5 
 
 		 209 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  27.49 
 
 		 639 aa  216  5.9999999999999996e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0828  ABC transporter related  34.99 
 
 		 636 aa  212  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  29.1 
 
 		 643 aa  212  1e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  32.77 
 
 		 620 aa  211  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0899  ABC transporter related  35.36 
 
 		 663 aa  210  5e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.998664  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3420  ABC transporter related protein  34.41 
 
 		 554 aa  209  7e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.859354  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  30.25 
 
 		 646 aa  209  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  31.64 
 
 		 636 aa  208  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2772  ABC transporter related  31.51 
 
 		 519 aa  208  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0806  ABC transporter related  35.5 
 
 		 569 aa  207  3e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1220  ABC transporter related  34.66 
 
 		 627 aa  207  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289587 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0945  ABC transporter related  29.85 
 
 		 580 aa  206  7e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15950  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  33.27 
 
 		 550 aa  206  1e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1075  ABC transporter related  34.09 
 
 		 627 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000840512 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2336  ABC transporter related  35.12 
 
 		 625 aa  204  5e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.590481  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19010  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  33.7 
 
 		 555 aa  203  5e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0660652 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2091  ABC transporter related  34.75 
 
 		 627 aa  203  6e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105315 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  34.99 
 
 		 641 aa  202  9e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6763  ABC transporter related  35.7 
 
 		 623 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.260757  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2877  ABC transporter related  33.52 
 
 		 621 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.358823  normal  0.296098 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3334  ABC transporter related  33.14 
 
 		 637 aa  201  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115349 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  33.4 
 
 		 649 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3467  ABC transporter related  35.33 
 
 		 625 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  34.26 
 
 		 649 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  31.28 
 
 		 641 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1673  ABC transporter, ATPase subunit  34.17 
 
 		 625 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0939  ABC transporter, ATP-binding protein  33.15 
 
 		 648 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0496893  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6573  ABC transporter related  36.6 
 
 		 623 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00902465 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0995  ABC transporter related  33.27 
 
 		 550 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>