More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0945 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0945  ABC transporter related  100 
 
 
580 aa  1172    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0831  ABC transporter related  60.83 
 
 
577 aa  672    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00618018  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0368  ABC transporter related  42.69 
 
 
606 aa  432  1e-120  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  31.52 
 
 
639 aa  314  2.9999999999999996e-84  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  33.84 
 
 
659 aa  311  2e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  31.52 
 
 
634 aa  310  5e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  33.74 
 
 
658 aa  307  4.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  34.15 
 
 
658 aa  307  4.0000000000000004e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  34 
 
 
658 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  34.15 
 
 
640 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  34 
 
 
658 aa  306  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
644 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  33.64 
 
 
644 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  32.81 
 
 
636 aa  302  1e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  33.54 
 
 
658 aa  302  1e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  33.49 
 
 
662 aa  301  2e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  32.3 
 
 
641 aa  300  6e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  35.06 
 
 
666 aa  296  5e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  33.33 
 
 
659 aa  295  1e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1237  ABC transporter ATPase  32.7 
 
 
639 aa  293  5e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0857839  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  31.29 
 
 
663 aa  293  6e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  30.97 
 
 
663 aa  293  7e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  32.9 
 
 
643 aa  292  1e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  35.86 
 
 
564 aa  290  5.0000000000000004e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1799  ABC transporter related protein  35.05 
 
 
638 aa  290  6e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  34.71 
 
 
634 aa  290  6e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  33.33 
 
 
668 aa  288  2e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  34.67 
 
 
581 aa  286  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  33.46 
 
 
535 aa  284  3.0000000000000004e-75  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  30.16 
 
 
649 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  36.18 
 
 
644 aa  284  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  30.92 
 
 
643 aa  283  7.000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  34.6 
 
 
690 aa  282  1e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  30.91 
 
 
630 aa  281  3e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4007  ABC transporter related protein  30.4 
 
 
641 aa  280  6e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  33.44 
 
 
638 aa  280  6e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  32.7 
 
 
685 aa  280  7e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1658  ABC transporter, ATP-binding protein  30.86 
 
 
644 aa  279  8e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0768628  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  30.56 
 
 
649 aa  279  8e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  30.7 
 
 
645 aa  279  1e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  31.3 
 
 
635 aa  279  1e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  32.25 
 
 
642 aa  278  2e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  32.25 
 
 
642 aa  278  2e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000290627  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1626  ABC transporter related  30.66 
 
 
619 aa  277  4e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  32.72 
 
 
620 aa  276  5e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  31.65 
 
 
636 aa  276  6e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  35.95 
 
 
575 aa  275  1.0000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0024  ABC transporter related protein  32.69 
 
 
627 aa  275  2.0000000000000002e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  33.21 
 
 
645 aa  274  3e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  33.14 
 
 
709 aa  273  5.000000000000001e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  29.78 
 
 
672 aa  273  5.000000000000001e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  32.1 
 
 
767 aa  273  9e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0941  ATPase  35.37 
 
 
569 aa  270  4e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1348  ABC transporter related  30.67 
 
 
625 aa  270  5e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2551  ABC transporter-like protein protein  35.48 
 
 
564 aa  270  7e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1743  ABC transporter related  29.5 
 
 
633 aa  270  7e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0202205 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0133  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.59 
 
 
553 aa  268  2e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0668164  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  31.5 
 
 
637 aa  268  2e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3467  ABC transporter related  31.59 
 
 
625 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1237  ABC transporter related  31.27 
 
 
638 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000223212  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0144  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.15 
 
 
553 aa  267  2.9999999999999995e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  35.53 
 
 
630 aa  265  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0741  ABC transporter related  32.01 
 
 
545 aa  265  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0595182  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2008  ABC transporter, ATPase subunit  33.84 
 
 
641 aa  263  4.999999999999999e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198836  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0061  ABC transporter related  28.94 
 
 
635 aa  263  6.999999999999999e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.234701 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  35.29 
 
 
567 aa  263  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1852  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.54 
 
 
554 aa  263  6.999999999999999e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1913  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.73 
 
 
554 aa  263  8e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.129102  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2727  ABC transporter related  32.19 
 
 
649 aa  262  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.26231  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3480  ABC transporter related  31.83 
 
 
634 aa  262  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00549576 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  31.61 
 
 
656 aa  262  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2242  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 
553 aa  262  2e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  28.92 
 
 
646 aa  261  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3681  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.87 
 
 
553 aa  261  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1170  ABC transporter related protein  32.45 
 
 
610 aa  261  2e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.187468  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.5 
 
 
637 aa  262  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.5 
 
 
637 aa  261  3e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1799  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.65 
 
 
554 aa  261  3e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.255837 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2338  ABC transporter related protein  29.25 
 
 
635 aa  261  3e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3764  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.28 
 
 
635 aa  261  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.460675 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2293  ABC transporter related  34.45 
 
 
613 aa  261  3e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3729  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.28 
 
 
635 aa  261  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83809  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0279  ABC transporter related  32.02 
 
 
673 aa  261  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  29.5 
 
 
637 aa  261  4e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  29.5 
 
 
637 aa  261  4e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.5 
 
 
637 aa  261  4e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.5 
 
 
637 aa  261  4e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.5 
 
 
637 aa  261  4e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2156  ABC transporter, ATP-binding protein  30.49 
 
 
532 aa  260  4e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0167  ABC transporter related protein  29.22 
 
 
624 aa  260  4e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692888  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  29.5 
 
 
637 aa  261  4e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.5 
 
 
637 aa  260  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01943  ABC transporter ATP-binding protein  29.46 
 
 
630 aa  260  5.0000000000000005e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1367  ABC transporter, ATP-binding protein  31.95 
 
 
634 aa  260  6e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1449  ABC transporter  34.67 
 
 
643 aa  259  6e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.174197  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.11 
 
 
635 aa  259  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  32.26 
 
 
645 aa  259  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2186  ABC transporter, ATP-binding protein  29.64 
 
 
638 aa  259  1e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151795  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0168  ABC transporter ATP-binding protein  30.49 
 
 
532 aa  259  1e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.508364  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0690  ABC transporter related protein  33.84 
 
 
648 aa  258  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.185815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>