More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3596 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_1436  ABC transporter ATPase  76.19 
 
 
527 aa  745    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0047  ABC transporter component  66.16 
 
 
535 aa  670    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3596  ABC transporter related  100 
 
 
527 aa  1051    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.737822  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0822  ABC transporter related  60.15 
 
 
531 aa  615  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0684569  normal  0.79375 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0935  ABC transporter related  59.32 
 
 
530 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1888  ABC transporter related  57.36 
 
 
545 aa  554  1e-156  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2488  ABC transporter related  57.14 
 
 
534 aa  524  1e-147  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2015  ABC transporter related  53.23 
 
 
525 aa  516  1.0000000000000001e-145  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.406124  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5328  ABC transporter related  53.52 
 
 
524 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.862409 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0461  ABC transporter related  54.37 
 
 
531 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3837  ABC transporter related  54.29 
 
 
532 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0518  ABC transporter related  50.38 
 
 
533 aa  497  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2095  ABC transporter related  52.76 
 
 
534 aa  464  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472904  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0963  ABC transporter related  50.19 
 
 
526 aa  464  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0854  ABC transporter ATP-binding protein  37.83 
 
 
534 aa  367  1e-100  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4720  putative ABC transporter, ATP-binding protein  44.53 
 
 
524 aa  365  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5053  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.42 
 
 
536 aa  331  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7127  ABC transporter related  39.96 
 
 
541 aa  323  4e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.618924 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4514  ABC transporter-related protein  40.15 
 
 
535 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577215  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2147  ABC transporter related protein  39.45 
 
 
554 aa  311  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.168618  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4684  ABC transporter related protein  39.77 
 
 
536 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5951  ABC transporter related protein  38.21 
 
 
558 aa  305  1.0000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4308  ABC transporter-related protein  39.26 
 
 
539 aa  305  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5386  ABC transporter ATP-binding protein  39.29 
 
 
544 aa  304  3.0000000000000004e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.221909  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2896  ABC transporter-like protein  41.17 
 
 
549 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3913  ABC transporter ATPase  38.98 
 
 
557 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195461  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5740  ABC transporter related  37.96 
 
 
553 aa  297  3e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0750761 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3386  ABC transporter related  40.07 
 
 
516 aa  297  3e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.409428  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3169  ABC transporter related  39.51 
 
 
541 aa  296  6e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0348  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  38.13 
 
 
548 aa  293  6e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.860489  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2015  ABC transporter related  38.98 
 
 
553 aa  291  2e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.464297  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4011  ABC transporter related  39.18 
 
 
537 aa  291  3e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.460893  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4085  ABC transporter related  39.18 
 
 
537 aa  291  3e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425666  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4241  ABC transporter related  39.18 
 
 
537 aa  291  3e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1526  ABC transporter related protein  38.02 
 
 
548 aa  285  2.0000000000000002e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.373611  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2987  ABC transporter related  37.66 
 
 
555 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000223105 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46010  putative ATP-binding component of ABC transporter  38.21 
 
 
538 aa  282  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640378  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6267  ABC transporter, fused ATPase subunits  36.85 
 
 
548 aa  280  6e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2973  ABC transporter related  37.2 
 
 
546 aa  280  6e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2836  ABC transporter related  37.05 
 
 
546 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2181  ABC transporter related  40.04 
 
 
565 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163034  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2006  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  37.38 
 
 
548 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2282  ABC transporter, ATP-binding protein  37.38 
 
 
548 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0092  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  37.38 
 
 
548 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0583  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  37.38 
 
 
548 aa  272  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2945  ABC transporter-like  34.91 
 
 
541 aa  271  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0421  ABC transporter, ATP-binding protein  37.38 
 
 
548 aa  272  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1995  ABC transporter-related protein  37.74 
 
 
532 aa  272  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  hitchhiker  0.000319079 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0401  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  37.38 
 
 
548 aa  272  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15947  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3090  ABC transporter, ATP-binding protein  37.38 
 
 
548 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0084  ABC transporter related  76.38 
 
 
209 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5557  ABC transporter related  34.24 
 
 
529 aa  268  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2310  ABC transporter related  35.56 
 
 
551 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2924  ABC transporter related  35.56 
 
 
551 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2144  ABC transporter related  31.06 
 
 
529 aa  265  2e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0218  ABC transporter, ATP-binding protein  31.44 
 
 
529 aa  262  1e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.902745  normal  0.428381 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7142  ABC transporter related  32.43 
 
 
528 aa  260  4e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2939  ABC transporter related  36.13 
 
 
550 aa  259  6e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001382  ABC-type transport system ATPase component  34.45 
 
 
523 aa  259  1e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0479008  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2411  ABC transporter related  35.29 
 
 
530 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235484  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1807  putative ATP-binding component of ABC transporter  31.97 
 
 
531 aa  258  3e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.451616  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0400  ABC transporter related  35.98 
 
 
535 aa  256  9e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.132459  normal  0.738425 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2418  ABC transporter related  35.47 
 
 
525 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.741222  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2097  ABC transporter related  30.81 
 
 
530 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0494627 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0217  ABC transporter related protein  36.09 
 
 
511 aa  252  1e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.928543  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2265  ABC transporter related  35.18 
 
 
525 aa  249  6e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3494  ABC transporter related  31.63 
 
 
529 aa  246  6.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2539  ABC transporter related  35.2 
 
 
531 aa  246  9e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.552748 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1472  ABC transporter related protein  35.99 
 
 
520 aa  235  2.0000000000000002e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1859  ABC transporter related protein  34.15 
 
 
535 aa  233  8.000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0744608  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3586  ABC transporter related protein  34.83 
 
 
530 aa  225  1e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2772  ABC transporter related  30.74 
 
 
519 aa  218  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2596  ABC transporter related  34.19 
 
 
627 aa  212  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0945  ABC transporter related  29.67 
 
 
580 aa  208  2e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0809  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.41 
 
 
560 aa  208  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06389  hypothetical protein  32.55 
 
 
436 aa  207  3e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1926  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.09 
 
 
559 aa  207  4e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000896956  normal  0.905041 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3480  ABC transporter related  33.85 
 
 
634 aa  206  7e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00549576 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2091  ABC transporter related  33.07 
 
 
627 aa  206  8e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.105315 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0831  ABC transporter related  31.24 
 
 
577 aa  205  2e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00618018  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1644  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.9 
 
 
559 aa  204  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1220  ABC transporter related  34.19 
 
 
627 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000289587 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1075  ABC transporter related  33.6 
 
 
627 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000840512 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0834  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.1 
 
 
561 aa  204  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00294599  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0692  ABC transporter, ATP-binding protein  32.48 
 
 
627 aa  202  9e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.242868  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2428  ABC transporter related  33.66 
 
 
625 aa  202  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4119  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.64 
 
 
555 aa  202  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0168  ABC transporter ATP-binding protein  31.07 
 
 
532 aa  202  9.999999999999999e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.508364  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2156  ABC transporter, ATP-binding protein  31.25 
 
 
532 aa  202  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0683  ABC transporter, ATP-binding protein  32.48 
 
 
640 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  31.17 
 
 
581 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.72 
 
 
558 aa  201  3e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.406197  hitchhiker  0.00000247304 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1126  ABC transporter related  32.37 
 
 
642 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0852453 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  36.06 
 
 
642 aa  200  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3426  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.74 
 
 
561 aa  200  7e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1549  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  32.65 
 
 
639 aa  199  7e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  29.06 
 
 
639 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1539  ABC transporter related  32.19 
 
 
615 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.176229  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  35.32 
 
 
641 aa  198  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3241  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.63 
 
 
561 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000308971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>