More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0822 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0935  ABC transporter related  87.15 
 
 
530 aa  926    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0822  ABC transporter related  100 
 
 
531 aa  1055    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0684569  normal  0.79375 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0461  ABC transporter related  64.19 
 
 
531 aa  632  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3837  ABC transporter related  61.79 
 
 
532 aa  622  1e-177  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3596  ABC transporter related  60.15 
 
 
527 aa  615  1e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.737822  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0047  ABC transporter component  61.52 
 
 
535 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2488  ABC transporter related  61.74 
 
 
534 aa  613  9.999999999999999e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5328  ABC transporter related  61.71 
 
 
524 aa  606  9.999999999999999e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.862409 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2015  ABC transporter related  58.78 
 
 
525 aa  580  1e-164  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.406124  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0518  ABC transporter related  55.05 
 
 
533 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1436  ABC transporter ATPase  59.51 
 
 
527 aa  570  1e-161  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1888  ABC transporter related  54.11 
 
 
545 aa  522  1e-147  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2095  ABC transporter related  56.38 
 
 
534 aa  525  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472904  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0963  ABC transporter related  50.38 
 
 
526 aa  488  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4720  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.67 
 
 
524 aa  400  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0854  ABC transporter ATP-binding protein  40.15 
 
 
534 aa  391  1e-107  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7127  ABC transporter related  41.05 
 
 
541 aa  359  8e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.618924 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2147  ABC transporter related protein  41.8 
 
 
554 aa  343  5e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.168618  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4241  ABC transporter related  41.34 
 
 
537 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4011  ABC transporter related  41.34 
 
 
537 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.460893  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4085  ABC transporter related  41.34 
 
 
537 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425666  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3169  ABC transporter related  39.63 
 
 
541 aa  326  7e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5386  ABC transporter ATP-binding protein  39.81 
 
 
544 aa  325  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.221909  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5053  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.51 
 
 
536 aa  324  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4514  ABC transporter-related protein  39.2 
 
 
535 aa  322  7e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577215  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4684  ABC transporter related protein  39.43 
 
 
536 aa  319  1e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2896  ABC transporter-like protein  41.01 
 
 
549 aa  318  1e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3913  ABC transporter ATPase  41.39 
 
 
557 aa  317  4e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195461  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2015  ABC transporter related  40.53 
 
 
553 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.464297  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4308  ABC transporter-related protein  37.5 
 
 
539 aa  301  1e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5951  ABC transporter related protein  38.6 
 
 
558 aa  300  5e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2987  ABC transporter related  39.62 
 
 
555 aa  298  1e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000223105 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5740  ABC transporter related  38.84 
 
 
553 aa  298  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0750761 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2181  ABC transporter related  39.7 
 
 
565 aa  292  1e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163034  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46010  putative ATP-binding component of ABC transporter  39.24 
 
 
538 aa  291  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640378  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2144  ABC transporter related  32.83 
 
 
529 aa  289  8e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3386  ABC transporter related  37.73 
 
 
516 aa  280  6e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.409428  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0583  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.12 
 
 
548 aa  277  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0401  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.12 
 
 
548 aa  277  4e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15947  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0092  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.12 
 
 
548 aa  277  4e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0421  ABC transporter, ATP-binding protein  36.12 
 
 
548 aa  277  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2282  ABC transporter, ATP-binding protein  36.12 
 
 
548 aa  277  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3090  ABC transporter, ATP-binding protein  36.12 
 
 
548 aa  277  4e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2006  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.12 
 
 
548 aa  277  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0218  ABC transporter, ATP-binding protein  31.12 
 
 
529 aa  276  7e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.902745  normal  0.428381 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0348  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.35 
 
 
548 aa  274  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.860489  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2310  ABC transporter related  34.92 
 
 
551 aa  273  6e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2924  ABC transporter related  34.92 
 
 
551 aa  273  6e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7142  ABC transporter related  32.41 
 
 
528 aa  269  7e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6267  ABC transporter, fused ATPase subunits  34.99 
 
 
548 aa  268  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1526  ABC transporter related protein  34.89 
 
 
548 aa  267  4e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.373611  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5557  ABC transporter related  32.89 
 
 
529 aa  267  4e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2836  ABC transporter related  36.3 
 
 
546 aa  266  5e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2939  ABC transporter related  35.16 
 
 
550 aa  266  5e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1807  putative ATP-binding component of ABC transporter  31.61 
 
 
531 aa  266  5e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.451616  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2411  ABC transporter related  33.96 
 
 
530 aa  266  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235484  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2973  ABC transporter related  35.44 
 
 
546 aa  264  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3494  ABC transporter related  31.48 
 
 
529 aa  263  4.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2097  ABC transporter related  32.2 
 
 
530 aa  258  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0494627 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1859  ABC transporter related protein  34.34 
 
 
535 aa  258  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0744608  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001382  ABC-type transport system ATPase component  32.76 
 
 
523 aa  257  3e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0479008  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1472  ABC transporter related protein  37.34 
 
 
520 aa  256  5e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2945  ABC transporter-like  33.52 
 
 
541 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0217  ABC transporter related protein  34.74 
 
 
511 aa  251  3e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.928543  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2539  ABC transporter related  34.21 
 
 
531 aa  248  2e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.552748 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2418  ABC transporter related  33.78 
 
 
525 aa  247  4e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.741222  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1995  ABC transporter-related protein  35.85 
 
 
532 aa  247  4e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  hitchhiker  0.000319079 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0400  ABC transporter related  35.02 
 
 
535 aa  240  5e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.132459  normal  0.738425 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2265  ABC transporter related  33.65 
 
 
525 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3586  ABC transporter related protein  35.34 
 
 
530 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0084  ABC transporter related  62.81 
 
 
209 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  31.07 
 
 
643 aa  210  5e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2140  ABC transporter related  33.08 
 
 
603 aa  209  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.419129  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1055  ABC transporter related  34.07 
 
 
542 aa  208  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242614  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19010  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  33.51 
 
 
555 aa  207  3e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0660652 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06389  hypothetical protein  30.9 
 
 
436 aa  207  3e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0945  ABC transporter related  30.26 
 
 
580 aa  207  6e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  31.25 
 
 
620 aa  206  8e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  27.09 
 
 
634 aa  204  4e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2717  putative UUP ATPase  32.52 
 
 
607 aa  204  5e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  30.26 
 
 
636 aa  203  5e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1375  ABC transporter related  32.52 
 
 
607 aa  204  5e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0588139 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  31.78 
 
 
641 aa  203  7e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15950  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  33.76 
 
 
550 aa  202  9.999999999999999e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2596  ABC transporter related  32.16 
 
 
627 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  30.98 
 
 
659 aa  201  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  31.48 
 
 
644 aa  201  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2215  ABC transporter related  31.78 
 
 
545 aa  200  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242507  normal  0.0157835 
 
 
-
 
NC_004310  BR0692  ABC transporter, ATP-binding protein  32.75 
 
 
627 aa  200  5e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.242868  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1466  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.3 
 
 
558 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000105508  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  31.29 
 
 
662 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  26.96 
 
 
639 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0683  ABC transporter, ATP-binding protein  32.75 
 
 
640 aa  199  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1220  ABC transporter related  32.02 
 
 
627 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000289587 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1237  ABC transporter related  31.7 
 
 
638 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000223212  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  31.29 
 
 
658 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  31.29 
 
 
658 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  31.29 
 
 
658 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2772  ABC transporter related  28.43 
 
 
519 aa  198  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  31.29 
 
 
658 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>