More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06389 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001382  ABC-type transport system ATPase component  75.12 
 
 		 523 aa  651    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0479008  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06389  hypothetical protein  100 
 
 		 436 aa  891    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1807  putative ATP-binding component of ABC transporter  41.59 
 
 		 531 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.451616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2418  ABC transporter related  34.55 
 
 		 525 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.741222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5053  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.18 
 
 		 536 aa  219  8.999999999999998e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6267  ABC transporter, fused ATPase subunits  31.49 
 
 		 548 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0935  ABC transporter related  31.81 
 
 		 530 aa  211  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0822  ABC transporter related  30.9 
 
 		 531 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0684569  normal  0.79375 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2411  ABC transporter related  33.98 
 
 		 530 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3596  ABC transporter related  32.55 
 
 		 527 aa  207  3e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.737822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4308  ABC transporter-related protein  33.03 
 
 		 539 aa  206  5e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2945  ABC transporter-like  31.12 
 
 		 541 aa  205  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2265  ABC transporter related  34.09 
 
 		 525 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1436  ABC transporter ATPase  31.86 
 
 		 527 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0518  ABC transporter related  32.79 
 
 		 533 aa  204  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2310  ABC transporter related  31.28 
 
 		 551 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2924  ABC transporter related  31.28 
 
 		 551 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2836  ABC transporter related  31.89 
 
 		 546 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2939  ABC transporter related  30.66 
 
 		 550 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0963  ABC transporter related  30.68 
 
 		 526 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0348  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  29.43 
 
 		 548 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.860489  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2973  ABC transporter related  31.91 
 
 		 546 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5740  ABC transporter related  33.86 
 
 		 553 aa  195  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0750761 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3090  ABC transporter, ATP-binding protein  30.71 
 
 		 548 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2006  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  30.71 
 
 		 548 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0092  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  30.71 
 
 		 548 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3913  ABC transporter ATPase  33.48 
 
 		 557 aa  195  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195461  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0401  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  30.71 
 
 		 548 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15947  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0421  ABC transporter, ATP-binding protein  30.71 
 
 		 548 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2282  ABC transporter, ATP-binding protein  30.71 
 
 		 548 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0583  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  30.71 
 
 		 548 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0047  ABC transporter component  29.89 
 
 		 535 aa  192  7e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1888  ABC transporter related  30.14 
 
 		 545 aa  192  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0400  ABC transporter related  34.49 
 
 		 535 aa  187  3e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.132459  normal  0.738425 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2015  ABC transporter related  31.67 
 
 		 525 aa  185  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.406124  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2488  ABC transporter related  30.75 
 
 		 534 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1995  ABC transporter-related protein  33.02 
 
 		 532 aa  181  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  hitchhiker  0.000319079 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2772  ABC transporter related  28.67 
 
 		 519 aa  181  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3169  ABC transporter related  30.72 
 
 		 541 aa  181  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2144  ABC transporter related  28.6 
 
 		 529 aa  181  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46010  putative ATP-binding component of ABC transporter  34.31 
 
 		 538 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5328  ABC transporter related  28.73 
 
 		 524 aa  177  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.862409 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0854  ABC transporter ATP-binding protein  29.21 
 
 		 534 aa  176  6e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3837  ABC transporter related  31.16 
 
 		 532 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7127  ABC transporter related  28.97 
 
 		 541 aa  175  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.618924 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7142  ABC transporter related  26.87 
 
 		 528 aa  172  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3494  ABC transporter related  30.44 
 
 		 529 aa  169  7e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2095  ABC transporter related  30.27 
 
 		 534 aa  168  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4241  ABC transporter related  29.27 
 
 		 537 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4011  ABC transporter related  29.27 
 
 		 537 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.460893  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5557  ABC transporter related  28 
 
 		 529 aa  167  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4085  ABC transporter related  29.27 
 
 		 537 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4514  ABC transporter-related protein  28.83 
 
 		 535 aa  166  8e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577215  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2147  ABC transporter related protein  28.35 
 
 		 554 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.168618  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5386  ABC transporter ATP-binding protein  29.8 
 
 		 544 aa  164  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.221909  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2896  ABC transporter-like protein  29.98 
 
 		 549 aa  163  6e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5951  ABC transporter related protein  29.86 
 
 		 558 aa  162  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2015  ABC transporter related  28.47 
 
 		 553 aa  159  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.464297  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4684  ABC transporter related protein  29.38 
 
 		 536 aa  158  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0461  ABC transporter related  28.24 
 
 		 531 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2539  ABC transporter related  29.11 
 
 		 531 aa  155  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.552748 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2097  ABC transporter related  27.84 
 
 		 530 aa  155  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0494627 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3586  ABC transporter related protein  29.93 
 
 		 530 aa  153  5e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0218  ABC transporter, ATP-binding protein  27.9 
 
 		 529 aa  152  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.902745  normal  0.428381 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2987  ABC transporter related  29.06 
 
 		 555 aa  152  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000223105 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1859  ABC transporter related protein  28.9 
 
 		 535 aa  150  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0744608  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4720  putative ABC transporter, ATP-binding protein  28.78 
 
 		 524 aa  149  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2181  ABC transporter related  29.88 
 
 		 565 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163034  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2170  ABC transporter ATPase component  31.16 
 
 		 635 aa  147  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000710719  normal  0.220785 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  29.14 
 
 		 636 aa  146  8.000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1792  ABC transporter ATPase component  31.52 
 
 		 642 aa  145  9e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2232.1  ABC transporter  39.06 
 
 		 289 aa  145  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1461  ABC transporter ATPase component  30.29 
 
 		 635 aa  143  5e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.185296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3386  ABC transporter related  26.79 
 
 		 516 aa  139  7e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.409428  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2065  ABC transporter ATPase component  31.89 
 
 		 636 aa  139  7.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1103  ABC transporter ATPase component  31.23 
 
 		 635 aa  139  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1124  ABC transporter ATPase component  31.23 
 
 		 635 aa  139  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.915369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1171  ABC transporter ATPase component  31.23 
 
 		 635 aa  139  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1988  ABC transporter ATPase component  31.18 
 
 		 637 aa  139  7.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1137  ABC transporter ATPase component  31.23 
 
 		 635 aa  139  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1744  ABC transporter ATPase component  30.29 
 
 		 634 aa  139  8.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.30913  hitchhiker  0.0000434555 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1020  ABC transporter ATPase component  31.23 
 
 		 635 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00168337  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2551  ABC transporter ATPase component  31.18 
 
 		 637 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2000  ABC transporter related  27.65 
 
 		 631 aa  139  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000123424  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2640  ABC transporter ATPase component  31.18 
 
 		 637 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00953  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  31.16 
 
 		 635 aa  138  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000475773  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2694  ABC transporter related protein  31.16 
 
 		 635 aa  138  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.562851  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2647  ABC transporter ATPase component  31.16 
 
 		 635 aa  138  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0437839  hitchhiker  0.000617984 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1526  ABC transporter related protein  27.1 
 
 		 548 aa  138  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.373611  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1113  ABC transporter ATPase component  31.16 
 
 		 635 aa  138  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00085111  normal  0.933236 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1064  ABC transporter ATPase component  31.16 
 
 		 635 aa  138  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000187784  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  29.41 
 
 		 644 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00960  hypothetical protein  31.16 
 
 		 635 aa  138  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000554098  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1058  ABC transporter ATPase component  31.16 
 
 		 635 aa  138  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000977813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3145  ABC transporter, ATP-binding protein  28.08 
 
 		 631 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000568363  normal  0.0176571 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1237  ABC transporter ATPase  28.35 
 
 		 639 aa  137  4e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0857839  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2368  ABC transporter ATPase component  30.92 
 
 		 635 aa  137  5e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.561386  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1650  ABC transporter ATPase component  28.74 
 
 		 637 aa  136  7.000000000000001e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2173  ABC transporter, ATP-binding protein  27.43 
 
 		 631 aa  136  8e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00208736  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0368  ABC transporter related  25.55 
 
 		 606 aa  135  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>