More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4720 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4720  putative ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 524 aa  1024    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0822  ABC transporter related  46.67 
 
 		 531 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0684569  normal  0.79375 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0935  ABC transporter related  46.58 
 
 		 530 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1888  ABC transporter related  44.76 
 
 		 545 aa  394  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2015  ABC transporter related  46.85 
 
 		 525 aa  391  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.406124  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0461  ABC transporter related  46.67 
 
 		 531 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3596  ABC transporter related  45.12 
 
 		 527 aa  385  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.737822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0047  ABC transporter component  45.37 
 
 		 535 aa  372  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0963  ABC transporter related  42.67 
 
 		 526 aa  370  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2488  ABC transporter related  46.53 
 
 		 534 aa  370  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3837  ABC transporter related  43.02 
 
 		 532 aa  360  3e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1436  ABC transporter ATPase  44.21 
 
 		 527 aa  360  3e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0518  ABC transporter related  41.71 
 
 		 533 aa  356  5e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5328  ABC transporter related  43.4 
 
 		 524 aa  350  4e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.862409 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7127  ABC transporter related  41.28 
 
 		 541 aa  336  5e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.618924 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0854  ABC transporter ATP-binding protein  34.15 
 
 		 534 aa  328  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4514  ABC transporter-related protein  42.97 
 
 		 535 aa  323  7e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577215  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2095  ABC transporter related  43.81 
 
 		 534 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5386  ABC transporter ATP-binding protein  39.27 
 
 		 544 aa  321  3e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.221909  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4011  ABC transporter related  39.66 
 
 		 537 aa  310  5e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.460893  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4085  ABC transporter related  39.66 
 
 		 537 aa  310  5e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4241  ABC transporter related  39.66 
 
 		 537 aa  310  5e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3169  ABC transporter related  40.27 
 
 		 541 aa  306  7e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2181  ABC transporter related  41.78 
 
 		 565 aa  294  3e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163034  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2896  ABC transporter-like protein  38.99 
 
 		 549 aa  286  5.999999999999999e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2147  ABC transporter related protein  36.45 
 
 		 554 aa  278  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.168618  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5740  ABC transporter related  36.47 
 
 		 553 aa  278  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0750761 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2144  ABC transporter related  30.21 
 
 		 529 aa  273  5.000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3913  ABC transporter ATPase  36.61 
 
 		 557 aa  272  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195461  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5951  ABC transporter related protein  35.35 
 
 		 558 aa  270  2.9999999999999997e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4308  ABC transporter-related protein  35.95 
 
 		 539 aa  269  8e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5053  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.05 
 
 		 536 aa  265  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2411  ABC transporter related  34.92 
 
 		 530 aa  264  4e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2015  ABC transporter related  39.12 
 
 		 553 aa  257  4e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.464297  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0217  ABC transporter related protein  39.14 
 
 		 511 aa  256  6e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.928543  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46010  putative ATP-binding component of ABC transporter  36.33 
 
 		 538 aa  256  6e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0348  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.59 
 
 		 548 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.860489  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7142  ABC transporter related  29.76 
 
 		 528 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2987  ABC transporter related  38.54 
 
 		 555 aa  253  8.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000223105 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4684  ABC transporter related protein  35.74 
 
 		 536 aa  251  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6267  ABC transporter, fused ATPase subunits  35.47 
 
 		 548 aa  250  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2418  ABC transporter related  35.55 
 
 		 525 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.741222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0218  ABC transporter, ATP-binding protein  28.71 
 
 		 529 aa  246  8e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.902745  normal  0.428381 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2836  ABC transporter related  36.75 
 
 		 546 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2310  ABC transporter related  35.85 
 
 		 551 aa  243  6e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2924  ABC transporter related  35.85 
 
 		 551 aa  243  6e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0400  ABC transporter related  36.81 
 
 		 535 aa  242  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.132459  normal  0.738425 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3494  ABC transporter related  29.28 
 
 		 529 aa  240  5.999999999999999e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0092  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.54 
 
 		 548 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0583  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.54 
 
 		 548 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3090  ABC transporter, ATP-binding protein  36.54 
 
 		 548 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2006  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.54 
 
 		 548 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0401  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.54 
 
 		 548 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15947  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0421  ABC transporter, ATP-binding protein  36.54 
 
 		 548 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2282  ABC transporter, ATP-binding protein  36.54 
 
 		 548 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2973  ABC transporter related  36.56 
 
 		 546 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1526  ABC transporter related protein  35.29 
 
 		 548 aa  236  5.0000000000000005e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.373611  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5557  ABC transporter related  30.3 
 
 		 529 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3586  ABC transporter related protein  37.12 
 
 		 530 aa  234  3e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1859  ABC transporter related protein  35.7 
 
 		 535 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0744608  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2265  ABC transporter related  34.23 
 
 		 525 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2939  ABC transporter related  36.24 
 
 		 550 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2539  ABC transporter related  33.85 
 
 		 531 aa  232  2e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.552748 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3386  ABC transporter related  37.55 
 
 		 516 aa  227  3e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.409428  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2945  ABC transporter-like  33.4 
 
 		 541 aa  226  6e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1995  ABC transporter-related protein  36.98 
 
 		 532 aa  223  7e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  hitchhiker  0.000319079 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2097  ABC transporter related  29.38 
 
 		 530 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0494627 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  28.87 
 
 		 639 aa  211  2e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1472  ABC transporter related protein  34.82 
 
 		 520 aa  211  3e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1807  putative ATP-binding component of ABC transporter  30.33 
 
 		 531 aa  206  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.451616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0897  ABC transporter, ATP-binding protein  28.34 
 
 		 643 aa  204  2e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0077  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  28.15 
 
 		 644 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0439155  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  27.24 
 
 		 643 aa  202  9.999999999999999e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0945  ABC transporter related  28.65 
 
 		 580 aa  201  3e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  30.55 
 
 		 636 aa  201  3.9999999999999996e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0925  ABC transporter, ATP-binding protein  28.2 
 
 		 643 aa  200  5e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.511016  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0967  ABC transporter, ATP-binding protein  28.15 
 
 		 643 aa  199  9e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2215  ABC transporter related  33.7 
 
 		 545 aa  197  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242507  normal  0.0157835 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1433  ABC transporter related protein  28.07 
 
 		 649 aa  195  2e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1055  ABC transporter related  34.23 
 
 		 542 aa  195  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242614  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0571  ABC transporter, ATP-binding protein  28.2 
 
 		 645 aa  194  3e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.940937  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  27.7 
 
 		 666 aa  193  8e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6901  ABC transporter, ATP-binding protein  34.06 
 
 		 545 aa  193  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0831  ABC transporter related  27.43 
 
 		 577 aa  193  8e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00618018  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  29.11 
 
 		 635 aa  192  2e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  32.07 
 
 		 641 aa  192  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  27.74 
 
 		 634 aa  191  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001382  ABC-type transport system ATPase component  30.31 
 
 		 523 aa  189  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0479008  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  31.29 
 
 		 620 aa  188  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  29.09 
 
 		 644 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1262  ABC transporter, ATPase subunit  31.02 
 
 		 598 aa  187  3e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  28.92 
 
 		 646 aa  187  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15950  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  31.93 
 
 		 550 aa  187  3e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  27.5 
 
 		 645 aa  187  4e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  29.09 
 
 		 656 aa  187  5e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1268  ABC transporter-related protein  28.22 
 
 		 646 aa  186  8e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  27.75 
 
 		 637 aa  186  8e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  29.2 
 
 		 668 aa  186  9e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2860  ABC transporter related  31.09 
 
 		 530 aa  185  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0750  ABC transporter related  32.95 
 
 		 537 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>