More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0831 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0945  ABC transporter related  60.83 
 
 
580 aa  689    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0831  ABC transporter related  100 
 
 
577 aa  1140    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00618018  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0368  ABC transporter related  44 
 
 
606 aa  451  1e-125  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  32.91 
 
 
634 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  32.15 
 
 
639 aa  299  9e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  34.14 
 
 
666 aa  292  1e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  33.33 
 
 
668 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  31.83 
 
 
658 aa  286  5e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4007  ABC transporter related protein  32.3 
 
 
641 aa  286  5e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  31.83 
 
 
658 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  32.19 
 
 
640 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  31.83 
 
 
658 aa  286  7e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  31.83 
 
 
658 aa  286  8e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  31.99 
 
 
659 aa  286  8e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  31.52 
 
 
658 aa  281  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1237  ABC transporter ATPase  31.54 
 
 
639 aa  281  3e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0857839  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  32.36 
 
 
644 aa  281  3e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  32.05 
 
 
644 aa  280  7e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  31.94 
 
 
662 aa  280  7e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  33.1 
 
 
638 aa  279  1e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  34.32 
 
 
634 aa  278  2e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0024  ABC transporter related protein  33.01 
 
 
627 aa  277  3e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  32.1 
 
 
649 aa  277  4e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  34.52 
 
 
581 aa  276  5e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  31.45 
 
 
635 aa  276  5e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  33.21 
 
 
709 aa  276  6e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  33.21 
 
 
672 aa  276  7e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  32.55 
 
 
690 aa  276  8e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  31.62 
 
 
641 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  33.27 
 
 
643 aa  276  1.0000000000000001e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  30.72 
 
 
630 aa  275  2.0000000000000002e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0741  ABC transporter related  32.51 
 
 
545 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0595182  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  29.67 
 
 
643 aa  273  5.000000000000001e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1626  ABC transporter related  31.38 
 
 
619 aa  273  6e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  32.36 
 
 
649 aa  273  7e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  31.07 
 
 
659 aa  273  7e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  33.79 
 
 
767 aa  273  9e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  30.61 
 
 
637 aa  272  1e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0106  ABC transporter related  33.59 
 
 
544 aa  272  1e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  30.14 
 
 
642 aa  272  2e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  30.14 
 
 
642 aa  272  2e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000290627  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  30.98 
 
 
645 aa  270  5e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1174  ABC transporter related  33.21 
 
 
654 aa  270  7e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  33.84 
 
 
663 aa  268  1e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  33.84 
 
 
663 aa  268  2e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  34.29 
 
 
564 aa  266  8e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  32.06 
 
 
535 aa  265  1e-69  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  32.76 
 
 
685 aa  265  2e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  31.76 
 
 
620 aa  264  3e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2091  ABC transporter related  31.82 
 
 
627 aa  264  4e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.105315 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  30.31 
 
 
644 aa  264  4e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  31.13 
 
 
636 aa  263  4.999999999999999e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1799  ABC transporter related protein  33.64 
 
 
638 aa  263  4.999999999999999e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3835  ABC transporter ATP-binding protein  28.25 
 
 
622 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.551802 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3467  ABC transporter related  29.01 
 
 
625 aa  261  3e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0093  ABC transporter ATP-binding protein  35.27 
 
 
536 aa  261  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.785822  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  31.63 
 
 
646 aa  261  3e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14070  ABC transporter related  33.52 
 
 
640 aa  261  3e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0328486  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  30.08 
 
 
632 aa  261  3e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3997  ABC transporter related  29.1 
 
 
641 aa  261  3e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  32.25 
 
 
656 aa  260  5.0000000000000005e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0473  ABC transporter related  26.56 
 
 
648 aa  260  5.0000000000000005e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  29.84 
 
 
636 aa  259  7e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1075  ABC transporter related  29.83 
 
 
627 aa  259  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000840512 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1763  ABC transporter, ATP-binding protein  32.32 
 
 
546 aa  259  1e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.208486  normal  0.0362941 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1658  ABC transporter, ATP-binding protein  29.67 
 
 
644 aa  257  3e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0768628  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1027  ABC transporter related  29.67 
 
 
664 aa  258  3e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  29.22 
 
 
636 aa  257  3e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  34.48 
 
 
575 aa  258  3e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1642  ABC transporter related  30.29 
 
 
632 aa  257  4e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01041  ABC transporter, ATP binding component  33.77 
 
 
541 aa  256  6e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.15596  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  34.35 
 
 
567 aa  256  6e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.18 
 
 
637 aa  256  9e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0692  ABC transporter, ATP-binding protein  28.84 
 
 
627 aa  256  1.0000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.242868  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0961  ABC transporter related  31.05 
 
 
641 aa  256  1.0000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1743  ABC transporter related  27.63 
 
 
633 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0202205 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0405  ABC transporter related protein  32.7 
 
 
658 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224406  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0683  ABC transporter, ATP-binding protein  28.84 
 
 
640 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01021  ABC transporter, ATP binding component  33.9 
 
 
541 aa  255  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.663375  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1220  ABC transporter related  29.49 
 
 
627 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000289587 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.01 
 
 
637 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  28.01 
 
 
637 aa  254  3e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  28.01 
 
 
637 aa  254  3e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.01 
 
 
637 aa  254  3e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.01 
 
 
637 aa  254  3e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  28.01 
 
 
637 aa  254  3e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2727  ABC transporter related  30.06 
 
 
649 aa  254  3e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.26231  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3764  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.69 
 
 
635 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.460675 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.01 
 
 
637 aa  254  3e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.01 
 
 
637 aa  254  3e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3729  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.01 
 
 
635 aa  254  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83809  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0690  ABC transporter related protein  30.37 
 
 
648 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.185815  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2484  ABC transporter related  29.55 
 
 
625 aa  253  7e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.814906  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.84 
 
 
635 aa  253  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  34.37 
 
 
630 aa  253  9.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.84 
 
 
635 aa  253  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3827  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.01 
 
 
635 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1348  ABC transporter related  29.33 
 
 
625 aa  252  1e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2551  ABC transporter-like protein protein  33.08 
 
 
564 aa  252  1e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1449  ABC transporter  34.03 
 
 
643 aa  252  1e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.174197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>