More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0217 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0217  ABC transporter related protein  100 
 
 		 511 aa  1004    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.928543  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1526  ABC transporter related protein  56.3 
 
 		 548 aa  511  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.373611  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2147  ABC transporter related protein  48.23 
 
 		 554 aa  432  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.168618  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4684  ABC transporter related protein  48.76 
 
 		 536 aa  421  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1859  ABC transporter related protein  47.9 
 
 		 535 aa  401  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0744608  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5951  ABC transporter related protein  46.36 
 
 		 558 aa  395  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3386  ABC transporter related  47.44 
 
 		 516 aa  391  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.409428  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4514  ABC transporter-related protein  45.32 
 
 		 535 aa  385  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577215  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2539  ABC transporter related  43.76 
 
 		 531 aa  380  1e-104  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.552748 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2896  ABC transporter-like protein  45.83 
 
 		 549 aa  380  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3169  ABC transporter related  43.76 
 
 		 541 aa  373  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2015  ABC transporter related  45.19 
 
 		 553 aa  370  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.464297  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2987  ABC transporter related  45.58 
 
 		 555 aa  367  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000223105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5386  ABC transporter ATP-binding protein  42.45 
 
 		 544 aa  363  5.0000000000000005e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.221909  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7127  ABC transporter related  40.94 
 
 		 541 aa  353  2.9999999999999997e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.618924 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4241  ABC transporter related  43.31 
 
 		 537 aa  351  2e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4011  ABC transporter related  43.31 
 
 		 537 aa  351  2e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.460893  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4085  ABC transporter related  43.31 
 
 		 537 aa  351  2e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1472  ABC transporter related protein  44.66 
 
 		 520 aa  345  8.999999999999999e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3586  ABC transporter related protein  47.32 
 
 		 530 aa  339  5.9999999999999996e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2181  ABC transporter related  41.6 
 
 		 565 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163034  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1888  ABC transporter related  40.04 
 
 		 545 aa  300  4e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0854  ABC transporter ATP-binding protein  31.06 
 
 		 534 aa  283  4.0000000000000003e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3596  ABC transporter related  36.47 
 
 		 527 aa  276  4e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.737822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0935  ABC transporter related  36.53 
 
 		 530 aa  274  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0963  ABC transporter related  35.09 
 
 		 526 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0822  ABC transporter related  35.85 
 
 		 531 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0684569  normal  0.79375 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7142  ABC transporter related  32.83 
 
 		 528 aa  268  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2015  ABC transporter related  38.68 
 
 		 525 aa  265  1e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.406124  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0047  ABC transporter component  36.31 
 
 		 535 aa  265  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0461  ABC transporter related  36.23 
 
 		 531 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0218  ABC transporter, ATP-binding protein  30.38 
 
 		 529 aa  258  1e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.902745  normal  0.428381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4720  putative ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 		 524 aa  258  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3494  ABC transporter related  32.02 
 
 		 529 aa  257  3e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5557  ABC transporter related  33.52 
 
 		 529 aa  257  3e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2144  ABC transporter related  30.64 
 
 		 529 aa  253  7e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3837  ABC transporter related  35.6 
 
 		 532 aa  250  4e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1436  ABC transporter ATPase  36.72 
 
 		 527 aa  250  5e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0518  ABC transporter related  36.02 
 
 		 533 aa  248  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5328  ABC transporter related  37.15 
 
 		 524 aa  248  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.862409 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0400  ABC transporter related  34.92 
 
 		 535 aa  238  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.132459  normal  0.738425 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2097  ABC transporter related  30.71 
 
 		 530 aa  238  3e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0494627 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5053  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.78 
 
 		 536 aa  236  8e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2488  ABC transporter related  35.91 
 
 		 534 aa  236  9e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4308  ABC transporter-related protein  33.08 
 
 		 539 aa  233  6e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3913  ABC transporter ATPase  34.63 
 
 		 557 aa  232  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195461  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5740  ABC transporter related  34.1 
 
 		 553 aa  228  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0750761 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  32.37 
 
 		 643 aa  228  3e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46010  putative ATP-binding component of ABC transporter  34.91 
 
 		 538 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2411  ABC transporter related  33.14 
 
 		 530 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2095  ABC transporter related  36.48 
 
 		 534 aa  218  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0348  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.39 
 
 		 548 aa  217  4e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.860489  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1995  ABC transporter-related protein  33.91 
 
 		 532 aa  216  5e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  hitchhiker  0.000319079 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0889  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.85 
 
 		 554 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1027  ABC transporter related  31.68 
 
 		 664 aa  214  3.9999999999999995e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6267  ABC transporter, fused ATPase subunits  34.21 
 
 		 548 aa  213  7e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2418  ABC transporter related  33.64 
 
 		 525 aa  213  9e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.741222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2945  ABC transporter-like  32.12 
 
 		 541 aa  211  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0092  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.28 
 
 		 548 aa  210  6e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2282  ABC transporter, ATP-binding protein  35.28 
 
 		 548 aa  210  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0583  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.28 
 
 		 548 aa  210  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3090  ABC transporter, ATP-binding protein  35.28 
 
 		 548 aa  210  6e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0401  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.28 
 
 		 548 aa  210  6e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15947  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2006  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.28 
 
 		 548 aa  210  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0421  ABC transporter, ATP-binding protein  35.28 
 
 		 548 aa  210  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2265  ABC transporter related  33.46 
 
 		 525 aa  209  9e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0453  ABC transporter related protein  31.81 
 
 		 552 aa  207  5e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  33.96 
 
 		 767 aa  206  7e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2084  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.9 
 
 		 555 aa  204  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.695655  normal  0.261341 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2310  ABC transporter related  32.65 
 
 		 551 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2924  ABC transporter related  32.65 
 
 		 551 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2939  ABC transporter related  34.25 
 
 		 550 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  28.87 
 
 		 634 aa  200  3.9999999999999996e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2903  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.94 
 
 		 553 aa  200  5e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0207119 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  33.66 
 
 		 626 aa  198  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  29.75 
 
 		 630 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2836  ABC transporter related  35.06 
 
 		 546 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0299  ABC transporter related  30.37 
 
 		 642 aa  198  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3547  ABC transporter-like protein protein  33.77 
 
 		 640 aa  198  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  32.69 
 
 		 653 aa  197  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3514  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.41 
 
 		 554 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0491494  normal  0.117692 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4057  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.05 
 
 		 554 aa  196  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4758  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.31 
 
 		 553 aa  195  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.45011  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  30.65 
 
 		 564 aa  195  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4024  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.86 
 
 		 554 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.640286  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2713  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.96 
 
 		 555 aa  195  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.776803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  29.76 
 
 		 635 aa  194  2e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4062  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.91 
 
 		 554 aa  195  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.247157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1801  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.44 
 
 		 553 aa  195  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.124805  normal  0.0665876 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2913  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.98 
 
 		 555 aa  194  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.010089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2587  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.92 
 
 		 705 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0489  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.65 
 
 		 555 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.890406 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0421  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.42 
 
 		 555 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2973  ABC transporter related  33.83 
 
 		 546 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0517  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.65 
 
 		 555 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.817295  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07215  ABC transporter ATP-binding protein  30.86 
 
 		 622 aa  194  4e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0780  ATPase  32.31 
 
 		 630 aa  194  4e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.989868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  32.75 
 
 		 630 aa  193  5e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2171  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.03 
 
 		 553 aa  193  5e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2686  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.45 
 
 		 549 aa  193  5e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0530992  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>