More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0218 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5557  ABC transporter related  62.19 
 
 		 529 aa  695    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7142  ABC transporter related  64.39 
 
 		 528 aa  722    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2097  ABC transporter related  60.11 
 
 		 530 aa  661    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0494627 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0218  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 529 aa  1091    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.902745  normal  0.428381 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2144  ABC transporter related  64.58 
 
 		 529 aa  723    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3494  ABC transporter related  41.06 
 
 		 529 aa  429  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5386  ABC transporter ATP-binding protein  32.14 
 
 		 544 aa  318  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.221909  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4514  ABC transporter-related protein  30.74 
 
 		 535 aa  312  1e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577215  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0854  ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 		 534 aa  308  2.0000000000000002e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3169  ABC transporter related  31.69 
 
 		 541 aa  306  8.000000000000001e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7127  ABC transporter related  31.44 
 
 		 541 aa  305  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.618924 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4241  ABC transporter related  31.82 
 
 		 537 aa  300  6e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4011  ABC transporter related  31.82 
 
 		 537 aa  300  6e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.460893  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4085  ABC transporter related  31.82 
 
 		 537 aa  300  6e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0963  ABC transporter related  32.33 
 
 		 526 aa  297  3e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2147  ABC transporter related protein  32.41 
 
 		 554 aa  296  7e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.168618  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0935  ABC transporter related  32.02 
 
 		 530 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2181  ABC transporter related  32.23 
 
 		 565 aa  291  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163034  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0518  ABC transporter related  31.57 
 
 		 533 aa  276  7e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0822  ABC transporter related  31.12 
 
 		 531 aa  276  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0684569  normal  0.79375 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2015  ABC transporter related  32.8 
 
 		 525 aa  272  9e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.406124  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5951  ABC transporter related protein  32.05 
 
 		 558 aa  270  4e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4684  ABC transporter related protein  32.46 
 
 		 536 aa  268  2.9999999999999995e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2488  ABC transporter related  30.36 
 
 		 534 aa  264  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3596  ABC transporter related  31.44 
 
 		 527 aa  262  1e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.737822  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2896  ABC transporter-like protein  30.75 
 
 		 549 aa  258  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5053  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.05 
 
 		 536 aa  258  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3837  ABC transporter related  32.08 
 
 		 532 aa  258  3e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0461  ABC transporter related  30.42 
 
 		 531 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1859  ABC transporter related protein  28.84 
 
 		 535 aa  251  3e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0744608  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1526  ABC transporter related protein  30.34 
 
 		 548 aa  248  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.373611  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1472  ABC transporter related protein  30.38 
 
 		 520 aa  247  3e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2015  ABC transporter related  30 
 
 		 553 aa  243  7.999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.464297  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3913  ABC transporter ATPase  30.41 
 
 		 557 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195461  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1888  ABC transporter related  28.46 
 
 		 545 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2095  ABC transporter related  29.6 
 
 		 534 aa  240  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3386  ABC transporter related  30.52 
 
 		 516 aa  240  5.999999999999999e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.409428  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0047  ABC transporter component  28.84 
 
 		 535 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0217  ABC transporter related protein  30.21 
 
 		 511 aa  238  3e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.928543  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2987  ABC transporter related  30.2 
 
 		 555 aa  236  6e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000223105 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0348  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  27.7 
 
 		 548 aa  236  8e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.860489  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2539  ABC transporter related  28.95 
 
 		 531 aa  234  2.0000000000000002e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.552748 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4720  putative ABC transporter, ATP-binding protein  28.3 
 
 		 524 aa  234  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2945  ABC transporter-like  26.82 
 
 		 541 aa  231  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5328  ABC transporter related  29.19 
 
 		 524 aa  231  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.862409 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0401  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  28.01 
 
 		 548 aa  229  8e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15947  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0092  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  28.01 
 
 		 548 aa  229  8e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0421  ABC transporter, ATP-binding protein  28.01 
 
 		 548 aa  229  8e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2006  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  28.01 
 
 		 548 aa  229  8e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2282  ABC transporter, ATP-binding protein  28.01 
 
 		 548 aa  229  8e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3090  ABC transporter, ATP-binding protein  28.01 
 
 		 548 aa  229  8e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0583  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  28.01 
 
 		 548 aa  229  9e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4308  ABC transporter-related protein  27.19 
 
 		 539 aa  228  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6267  ABC transporter, fused ATPase subunits  28.15 
 
 		 548 aa  227  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5740  ABC transporter related  30.38 
 
 		 553 aa  227  5.0000000000000005e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0750761 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46010  putative ATP-binding component of ABC transporter  30.29 
 
 		 538 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2310  ABC transporter related  26.83 
 
 		 551 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2924  ABC transporter related  26.83 
 
 		 551 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  29.8 
 
 		 540 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  29.8 
 
 		 540 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3586  ABC transporter related protein  29.62 
 
 		 530 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2836  ABC transporter related  28.02 
 
 		 546 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  31.28 
 
 		 634 aa  219  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0400  ABC transporter related  28.41 
 
 		 535 aa  219  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.132459  normal  0.738425 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  32.77 
 
 		 635 aa  218  2e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  29.29 
 
 		 540 aa  216  7e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1436  ABC transporter ATPase  28.28 
 
 		 527 aa  216  8e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2973  ABC transporter related  28.02 
 
 		 546 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2939  ABC transporter related  26.52 
 
 		 550 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  29.31 
 
 		 560 aa  212  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2418  ABC transporter related  27.68 
 
 		 525 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.741222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2425  ABC transporter related  28.96 
 
 		 540 aa  209  7e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0961  ABC transporter related  29.41 
 
 		 641 aa  209  9e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1807  putative ATP-binding component of ABC transporter  29.23 
 
 		 531 aa  208  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.451616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  30.18 
 
 		 545 aa  208  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  29.35 
 
 		 639 aa  208  2e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2217  ABC transporter related  28.67 
 
 		 565 aa  207  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  27.93 
 
 		 690 aa  207  3e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2411  ABC transporter related  26.04 
 
 		 530 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0644  peptidase T (tripeptide aminopeptidase; aminotripeptidase; tripeptidase)  29.3 
 
 		 643 aa  206  7e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4079  ABC transporter related  28.08 
 
 		 540 aa  206  7e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0716  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  28.6 
 
 		 541 aa  206  8e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0840  ABC transporter related  30.2 
 
 		 540 aa  206  8e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  28.46 
 
 		 620 aa  205  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  28.85 
 
 		 545 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  30.32 
 
 		 632 aa  205  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  29.87 
 
 		 643 aa  204  2e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12061  ABC transporter ATPase  31.21 
 
 		 644 aa  205  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.393632  normal  0.504812 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  29.89 
 
 		 564 aa  204  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0405  ABC transporter related protein  28.36 
 
 		 658 aa  204  3e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224406  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0540  ABC transporter ATP-binding protein uup  30.83 
 
 		 644 aa  204  3e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.692263  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  30.49 
 
 		 767 aa  204  4e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3897  ABC transporter related  31.59 
 
 		 613 aa  203  5e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  29.07 
 
 		 634 aa  202  8e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  28.01 
 
 		 540 aa  203  8e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2265  ABC transporter related  28.14 
 
 		 525 aa  202  9e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  30.21 
 
 		 666 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  28.8 
 
 		 540 aa  202  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001382  ABC-type transport system ATPase component  30.88 
 
 		 523 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0479008  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03991  ABC transporter ATP-binding protein  29.23 
 
 		 652 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>