More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A2006 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_2282  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
548 aa  1065    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2006  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
548 aa  1065    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2836  ABC transporter related  73.18 
 
 
546 aa  719    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0092  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
548 aa  1065    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0421  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
548 aa  1065    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0583  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  99.64 
 
 
548 aa  1059    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6267  ABC transporter, fused ATPase subunits  71.27 
 
 
548 aa  726    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0348  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  94.71 
 
 
548 aa  986    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.860489  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2939  ABC transporter related  71.69 
 
 
550 aa  711    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2310  ABC transporter related  72.1 
 
 
551 aa  731    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2973  ABC transporter related  73.18 
 
 
546 aa  716    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2924  ABC transporter related  72.1 
 
 
551 aa  731    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0401  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
548 aa  1065    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15947  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3090  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
548 aa  1065    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2945  ABC transporter-like  55.03 
 
 
541 aa  527  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4308  ABC transporter-related protein  51.37 
 
 
539 aa  514  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5053  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.02 
 
 
536 aa  391  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3913  ABC transporter ATPase  45.13 
 
 
557 aa  391  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195461  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5740  ABC transporter related  46.37 
 
 
553 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0750761 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46010  putative ATP-binding component of ABC transporter  44.86 
 
 
538 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640378  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1995  ABC transporter-related protein  45.89 
 
 
532 aa  362  9e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  hitchhiker  0.000319079 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2265  ABC transporter related  41.76 
 
 
525 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2418  ABC transporter related  41.76 
 
 
525 aa  325  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.741222  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2411  ABC transporter related  38.36 
 
 
530 aa  317  4e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235484  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3169  ABC transporter related  40.04 
 
 
541 aa  316  8e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0400  ABC transporter related  40.56 
 
 
535 aa  311  2e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.132459  normal  0.738425 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2015  ABC transporter related  40.87 
 
 
525 aa  300  3e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.406124  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0047  ABC transporter component  37.93 
 
 
535 aa  298  1e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3596  ABC transporter related  37.38 
 
 
527 aa  296  7e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.737822  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0518  ABC transporter related  39.14 
 
 
533 aa  294  3e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0822  ABC transporter related  36.79 
 
 
531 aa  293  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0684569  normal  0.79375 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4514  ABC transporter-related protein  39.7 
 
 
535 aa  290  4e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577215  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5386  ABC transporter ATP-binding protein  37.75 
 
 
544 aa  289  7e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.221909  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7127  ABC transporter related  36.92 
 
 
541 aa  287  4e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.618924 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5328  ABC transporter related  37.93 
 
 
524 aa  286  9e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.862409 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0935  ABC transporter related  35.98 
 
 
530 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1888  ABC transporter related  37.87 
 
 
545 aa  283  8.000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2488  ABC transporter related  41.04 
 
 
534 aa  273  6e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0854  ABC transporter ATP-binding protein  29.57 
 
 
534 aa  273  8.000000000000001e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2147  ABC transporter related protein  36.61 
 
 
554 aa  271  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.168618  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2896  ABC transporter-like protein  37.03 
 
 
549 aa  271  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0461  ABC transporter related  37.04 
 
 
531 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4241  ABC transporter related  39.7 
 
 
537 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4011  ABC transporter related  39.7 
 
 
537 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.460893  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4085  ABC transporter related  39.7 
 
 
537 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425666  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2015  ABC transporter related  36.78 
 
 
553 aa  266  8.999999999999999e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.464297  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1436  ABC transporter ATPase  38.29 
 
 
527 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5951  ABC transporter related protein  34.73 
 
 
558 aa  265  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2987  ABC transporter related  36.4 
 
 
555 aa  259  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000223105 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4720  putative ABC transporter, ATP-binding protein  35.84 
 
 
524 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2095  ABC transporter related  40.91 
 
 
534 aa  254  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472904  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4684  ABC transporter related protein  36.03 
 
 
536 aa  254  4.0000000000000004e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0963  ABC transporter related  33.78 
 
 
526 aa  254  4.0000000000000004e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3837  ABC transporter related  36.33 
 
 
532 aa  250  4e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1526  ABC transporter related protein  34.72 
 
 
548 aa  249  8e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.373611  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3494  ABC transporter related  30.36 
 
 
529 aa  249  8e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2539  ABC transporter related  33.15 
 
 
531 aa  247  4e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.552748 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7142  ABC transporter related  29.01 
 
 
528 aa  246  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1807  putative ATP-binding component of ABC transporter  32.34 
 
 
531 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.451616  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0218  ABC transporter, ATP-binding protein  29.17 
 
 
529 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.902745  normal  0.428381 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1472  ABC transporter related protein  36.62 
 
 
520 aa  244  3e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2097  ABC transporter related  30.09 
 
 
530 aa  243  5e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0494627 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2144  ABC transporter related  27.8 
 
 
529 aa  242  1e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1859  ABC transporter related protein  36.13 
 
 
535 aa  241  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0744608  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3586  ABC transporter related protein  36.38 
 
 
530 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001382  ABC-type transport system ATPase component  30.95 
 
 
523 aa  231  3e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0479008  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2181  ABC transporter related  37.95 
 
 
565 aa  229  8e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163034  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3386  ABC transporter related  36.16 
 
 
516 aa  227  6e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.409428  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5557  ABC transporter related  29.55 
 
 
529 aa  220  6e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06389  hypothetical protein  30.71 
 
 
436 aa  211  3e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  31.46 
 
 
644 aa  207  5e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0217  ABC transporter related protein  35.09 
 
 
511 aa  204  3e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.928543  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  27.06 
 
 
634 aa  203  6e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2772  ABC transporter related  30.8 
 
 
519 aa  202  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  31.64 
 
 
641 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  31.72 
 
 
659 aa  198  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15950  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  35.17 
 
 
550 aa  197  4.0000000000000005e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  30.36 
 
 
659 aa  195  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  27.38 
 
 
634 aa  195  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  29.12 
 
 
636 aa  194  4e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  29.12 
 
 
636 aa  194  5e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0961  ABC transporter related  27.68 
 
 
641 aa  192  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  26.12 
 
 
643 aa  192  1e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  27.81 
 
 
630 aa  192  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0368  ABC transporter related  25.23 
 
 
606 aa  191  2e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  29.93 
 
 
644 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  30.18 
 
 
581 aa  191  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  29.13 
 
 
644 aa  190  5e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  29.31 
 
 
659 aa  189  8e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  29.13 
 
 
662 aa  189  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  28.94 
 
 
658 aa  189  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1644  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.54 
 
 
559 aa  188  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2551  ABC transporter ATPase component  30.99 
 
 
637 aa  188  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  28.94 
 
 
658 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  29.25 
 
 
658 aa  189  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  28.94 
 
 
658 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2640  ABC transporter ATPase component  30.99 
 
 
637 aa  188  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  28.94 
 
 
640 aa  189  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1642  ABC transporter related  33.51 
 
 
632 aa  189  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1988  ABC transporter ATPase component  30.99 
 
 
637 aa  188  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>