More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1526 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1526  ABC transporter related protein  100 
 
 		 548 aa  1080    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.373611  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0217  ABC transporter related protein  56.3 
 
 		 511 aa  493  9.999999999999999e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.928543  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2147  ABC transporter related protein  46.88 
 
 		 554 aa  436  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.168618  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5951  ABC transporter related protein  45.96 
 
 		 558 aa  417  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3386  ABC transporter related  48.95 
 
 		 516 aa  418  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.409428  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4684  ABC transporter related protein  45.72 
 
 		 536 aa  413  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2015  ABC transporter related  46.65 
 
 		 553 aa  412  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.464297  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2987  ABC transporter related  47.8 
 
 		 555 aa  404  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000223105 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2896  ABC transporter-like protein  44.72 
 
 		 549 aa  397  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1859  ABC transporter related protein  45.52 
 
 		 535 aa  389  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0744608  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4514  ABC transporter-related protein  43.54 
 
 		 535 aa  388  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577215  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5386  ABC transporter ATP-binding protein  43.88 
 
 		 544 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.221909  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7127  ABC transporter related  42.04 
 
 		 541 aa  378  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.618924 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3169  ABC transporter related  42.88 
 
 		 541 aa  366  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2539  ABC transporter related  41.29 
 
 		 531 aa  359  8e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.552748 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4241  ABC transporter related  42.23 
 
 		 537 aa  357  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4011  ABC transporter related  42.23 
 
 		 537 aa  357  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.460893  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4085  ABC transporter related  42.23 
 
 		 537 aa  357  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1472  ABC transporter related protein  42.29 
 
 		 520 aa  343  2.9999999999999997e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3586  ABC transporter related protein  44.91 
 
 		 530 aa  339  7e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2181  ABC transporter related  40.53 
 
 		 565 aa  318  1e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163034  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3596  ABC transporter related  38.19 
 
 		 527 aa  295  2e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.737822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0047  ABC transporter component  37.08 
 
 		 535 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0854  ABC transporter ATP-binding protein  32.51 
 
 		 534 aa  280  3e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2015  ABC transporter related  38.37 
 
 		 525 aa  277  4e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.406124  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0822  ABC transporter related  35.03 
 
 		 531 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0684569  normal  0.79375 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1888  ABC transporter related  35.07 
 
 		 545 aa  272  9e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0935  ABC transporter related  35.2 
 
 		 530 aa  268  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1436  ABC transporter ATPase  37.62 
 
 		 527 aa  264  3e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3837  ABC transporter related  35.47 
 
 		 532 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0518  ABC transporter related  35.39 
 
 		 533 aa  259  8e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2488  ABC transporter related  38.15 
 
 		 534 aa  259  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0218  ABC transporter, ATP-binding protein  30.34 
 
 		 529 aa  258  3e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.902745  normal  0.428381 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0963  ABC transporter related  33.9 
 
 		 526 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0400  ABC transporter related  34.73 
 
 		 535 aa  254  3e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.132459  normal  0.738425 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0461  ABC transporter related  34.27 
 
 		 531 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4308  ABC transporter-related protein  32.88 
 
 		 539 aa  248  3e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5740  ABC transporter related  33.02 
 
 		 553 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0750761 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3494  ABC transporter related  30.1 
 
 		 529 aa  244  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3913  ABC transporter ATPase  33.21 
 
 		 557 aa  242  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195461  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5557  ABC transporter related  31.26 
 
 		 529 aa  241  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2144  ABC transporter related  30.52 
 
 		 529 aa  240  5.999999999999999e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0348  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  34.09 
 
 		 548 aa  240  5.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.860489  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6267  ABC transporter, fused ATPase subunits  34.9 
 
 		 548 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5328  ABC transporter related  32.96 
 
 		 524 aa  238  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.862409 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46010  putative ATP-binding component of ABC transporter  33.71 
 
 		 538 aa  236  7e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5053  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.84 
 
 		 536 aa  236  8e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0401  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  34.78 
 
 		 548 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15947  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0092  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  34.78 
 
 		 548 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2006  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  34.78 
 
 		 548 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0421  ABC transporter, ATP-binding protein  34.78 
 
 		 548 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2282  ABC transporter, ATP-binding protein  34.78 
 
 		 548 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3090  ABC transporter, ATP-binding protein  34.78 
 
 		 548 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0583  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  34.93 
 
 		 548 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2097  ABC transporter related  28.44 
 
 		 530 aa  233  5e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0494627 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2310  ABC transporter related  34.02 
 
 		 551 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2924  ABC transporter related  34.02 
 
 		 551 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7142  ABC transporter related  29.55 
 
 		 528 aa  230  6e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2939  ABC transporter related  34.83 
 
 		 550 aa  230  6e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4720  putative ABC transporter, ATP-binding protein  35.29 
 
 		 524 aa  229  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2836  ABC transporter related  35.35 
 
 		 546 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2945  ABC transporter-like  33.2 
 
 		 541 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2973  ABC transporter related  35.65 
 
 		 546 aa  226  9e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2095  ABC transporter related  35.77 
 
 		 534 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2265  ABC transporter related  31.79 
 
 		 525 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2411  ABC transporter related  29.6 
 
 		 530 aa  210  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1995  ABC transporter-related protein  32.82 
 
 		 532 aa  204  4e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  hitchhiker  0.000319079 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001382  ABC-type transport system ATPase component  28.44 
 
 		 523 aa  204  5e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0479008  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2418  ABC transporter related  31.63 
 
 		 525 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.741222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1807  putative ATP-binding component of ABC transporter  28.63 
 
 		 531 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.451616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  29.23 
 
 		 643 aa  193  6e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19010  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  34.59 
 
 		 555 aa  193  9e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0660652 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2910  ABC transporter related  29.53 
 
 		 537 aa  187  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  29.98 
 
 		 646 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  28.18 
 
 		 634 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0945  ABC transporter related  29.62 
 
 		 580 aa  183  5.0000000000000004e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5841  ABC transporter-related protein  34.08 
 
 		 548 aa  183  9.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.334221  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5678  ABC transporter related  33.27 
 
 		 553 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5299  ABC transporter related  33.27 
 
 		 553 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.121259  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  30.23 
 
 		 666 aa  182  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5388  ABC transporter related  33.27 
 
 		 553 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.378232 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  29.77 
 
 		 653 aa  181  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1407  hypothetical protein  33 
 
 		 486 aa  180  7e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  30.68 
 
 		 644 aa  179  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3420  ABC transporter related protein  33.09 
 
 		 554 aa  178  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.859354  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  31.35 
 
 		 626 aa  178  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2473  ABC transporter related  32.88 
 
 		 650 aa  178  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000325943 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  29.5 
 
 		 658 aa  178  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1664  ABC transporter ATP-binding protein  32.5 
 
 		 657 aa  177  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0247067 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  30.19 
 
 		 662 aa  177  5e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  26.95 
 
 		 635 aa  177  5e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1237  ABC transporter ATPase  30.35 
 
 		 639 aa  177  5e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0857839  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0961  ABC transporter related  27.66 
 
 		 641 aa  177  6e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  29.94 
 
 		 644 aa  176  9e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  30.19 
 
 		 644 aa  176  9e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0923  ABC transporter related  33.97 
 
 		 553 aa  176  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15950  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  32.96 
 
 		 550 aa  176  9.999999999999999e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1284  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.52 
 
 		 670 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  27.17 
 
 		 645 aa  176  9.999999999999999e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  29.08 
 
 		 656 aa  176  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>