More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2265 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2411  ABC transporter related  72.38 
 
 		 530 aa  732    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2265  ABC transporter related  100 
 
 		 525 aa  1036    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2418  ABC transporter related  93.14 
 
 		 525 aa  927    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.741222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5053  putative ABC transporter ATP-binding protein  51.42 
 
 		 536 aa  478  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46010  putative ATP-binding component of ABC transporter  53.15 
 
 		 538 aa  458  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3913  ABC transporter ATPase  51.33 
 
 		 557 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195461  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5740  ABC transporter related  50.09 
 
 		 553 aa  433  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0750761 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0400  ABC transporter related  48.07 
 
 		 535 aa  387  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.132459  normal  0.738425 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2973  ABC transporter related  44.32 
 
 		 546 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2836  ABC transporter related  43.93 
 
 		 546 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6267  ABC transporter, fused ATPase subunits  42.03 
 
 		 548 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2939  ABC transporter related  42.26 
 
 		 550 aa  362  1e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2310  ABC transporter related  41.98 
 
 		 551 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2924  ABC transporter related  41.98 
 
 		 551 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4308  ABC transporter-related protein  42.66 
 
 		 539 aa  351  2e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0348  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.15 
 
 		 548 aa  350  3e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.860489  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0583  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.76 
 
 		 548 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0092  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.76 
 
 		 548 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3090  ABC transporter, ATP-binding protein  41.76 
 
 		 548 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2006  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.76 
 
 		 548 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0401  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.76 
 
 		 548 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15947  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0421  ABC transporter, ATP-binding protein  41.76 
 
 		 548 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2282  ABC transporter, ATP-binding protein  41.76 
 
 		 548 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2945  ABC transporter-like  39.62 
 
 		 541 aa  325  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7127  ABC transporter related  36.23 
 
 		 541 aa  303  6.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.618924 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4011  ABC transporter related  38.87 
 
 		 537 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.460893  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4085  ABC transporter related  38.87 
 
 		 537 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4241  ABC transporter related  38.87 
 
 		 537 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3169  ABC transporter related  36.79 
 
 		 541 aa  296  5e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5386  ABC transporter ATP-binding protein  36.55 
 
 		 544 aa  296  5e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.221909  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1995  ABC transporter-related protein  40.63 
 
 		 532 aa  292  1e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  hitchhiker  0.000319079 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2896  ABC transporter-like protein  35.62 
 
 		 549 aa  282  9e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4514  ABC transporter-related protein  37.22 
 
 		 535 aa  281  3e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577215  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2015  ABC transporter related  36.62 
 
 		 525 aa  279  8e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.406124  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001382  ABC-type transport system ATPase component  37.33 
 
 		 523 aa  276  9e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0479008  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3596  ABC transporter related  36.14 
 
 		 527 aa  273  5.000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.737822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5951  ABC transporter related protein  34.62 
 
 		 558 aa  271  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0822  ABC transporter related  34.41 
 
 		 531 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0684569  normal  0.79375 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1888  ABC transporter related  35.96 
 
 		 545 aa  269  1e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2147  ABC transporter related protein  35.08 
 
 		 554 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.168618  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0935  ABC transporter related  33.97 
 
 		 530 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1807  putative ATP-binding component of ABC transporter  35.48 
 
 		 531 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.451616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0518  ABC transporter related  36.04 
 
 		 533 aa  261  3e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4684  ABC transporter related protein  35.9 
 
 		 536 aa  260  5.0000000000000005e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0047  ABC transporter component  34.23 
 
 		 535 aa  259  7e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0461  ABC transporter related  37.24 
 
 		 531 aa  257  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5328  ABC transporter related  34.72 
 
 		 524 aa  256  5e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.862409 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4720  putative ABC transporter, ATP-binding protein  34.23 
 
 		 524 aa  253  9.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2181  ABC transporter related  36.43 
 
 		 565 aa  252  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163034  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1436  ABC transporter ATPase  35.18 
 
 		 527 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1859  ABC transporter related protein  34.35 
 
 		 535 aa  251  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0744608  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0963  ABC transporter related  33.46 
 
 		 526 aa  249  7e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2539  ABC transporter related  35.32 
 
 		 531 aa  248  2e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.552748 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3837  ABC transporter related  35.12 
 
 		 532 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0854  ABC transporter ATP-binding protein  29.81 
 
 		 534 aa  244  3.9999999999999997e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3586  ABC transporter related protein  35.36 
 
 		 530 aa  243  7.999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2488  ABC transporter related  35.48 
 
 		 534 aa  241  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7142  ABC transporter related  30.13 
 
 		 528 aa  239  9e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3386  ABC transporter related  33.71 
 
 		 516 aa  233  6e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.409428  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1526  ABC transporter related protein  31.79 
 
 		 548 aa  233  7.000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.373611  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3494  ABC transporter related  29.78 
 
 		 529 aa  230  6e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2144  ABC transporter related  28.28 
 
 		 529 aa  228  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1472  ABC transporter related protein  34.39 
 
 		 520 aa  228  3e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0218  ABC transporter, ATP-binding protein  27.95 
 
 		 529 aa  226  7e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.902745  normal  0.428381 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2095  ABC transporter related  35.45 
 
 		 534 aa  224  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2097  ABC transporter related  30.11 
 
 		 530 aa  224  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0494627 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2015  ABC transporter related  32.9 
 
 		 553 aa  223  7e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.464297  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5557  ABC transporter related  29.76 
 
 		 529 aa  221  3e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2987  ABC transporter related  33.27 
 
 		 555 aa  219  8.999999999999998e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000223105 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06389  hypothetical protein  34.09 
 
 		 436 aa  218  2.9999999999999998e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2772  ABC transporter related  32.23 
 
 		 519 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0217  ABC transporter related protein  33.46 
 
 		 511 aa  208  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.928543  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  29.57 
 
 		 636 aa  196  9e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0945  ABC transporter related  26.16 
 
 		 580 aa  191  2e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  31.65 
 
 		 656 aa  189  7e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  30.13 
 
 		 644 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  30.43 
 
 		 540 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  30.67 
 
 		 645 aa  184  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  31.66 
 
 		 767 aa  184  5.0000000000000004e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  31.11 
 
 		 641 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0168  ABC transporter ATP-binding protein  29.41 
 
 		 532 aa  182  2e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.508364  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  29.15 
 
 		 540 aa  182  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0831  ABC transporter related  26.83 
 
 		 577 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00618018  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  28.75 
 
 		 632 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  27.98 
 
 		 643 aa  181  2.9999999999999997e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  29.02 
 
 		 668 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  28.76 
 
 		 636 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  30.35 
 
 		 620 aa  181  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0690  ABC transporter related  32.11 
 
 		 636 aa  181  4e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  29.42 
 
 		 646 aa  180  4.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4079  ABC transporter related  30.04 
 
 		 540 aa  179  8e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.67 
 
 		 637 aa  179  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  28.31 
 
 		 581 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  29.58 
 
 		 543 aa  179  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  28.99 
 
 		 634 aa  178  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.35 
 
 		 637 aa  177  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  26.56 
 
 		 639 aa  177  3e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  30.04 
 
 		 540 aa  177  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.566668 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  30.35 
 
 		 637 aa  177  4e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.35 
 
 		 637 aa  177  4e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>