More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1085 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1085  ABC transporter related  100 
 
 		 534 aa  1091    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000470508  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2270  ABC transporter related protein  44.01 
 
 		 540 aa  445  1.0000000000000001e-124  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.196548  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4972  ABC transporter related  41.62 
 
 		 544 aa  444  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5296  putative macrolide efflux pump  41.81 
 
 		 544 aa  437  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5028  macrolide efflux pump  42.18 
 
 		 544 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4858  MDR-type ABC transporter, ATP-binding protein  42 
 
 		 544 aa  428  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4873  MDR-type ABC transporter, ATP-binding protein  42.18 
 
 		 544 aa  428  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5409  macrolide efflux pump  42.18 
 
 		 544 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.952575  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5266  putative macrolide efflux pump  42 
 
 		 544 aa  423  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1435  ABC transporter-related protein  37.12 
 
 		 522 aa  356  6.999999999999999e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1598  ABC transporter related  39.43 
 
 		 476 aa  340  4e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2791  ABC transporter related  38.51 
 
 		 487 aa  315  9e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.741515 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0873  ABC transporter, ATP-binding protein  37.74 
 
 		 487 aa  313  2.9999999999999996e-84  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0018  ABC transporter related  38.51 
 
 		 488 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2346  ABC transporter ATP-binding protein  30.68 
 
 		 542 aa  259  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.574829  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2750  nucleotide-binding protein ExpZ  31.05 
 
 		 548 aa  258  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000173219 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2573  ABC transporter, ATP-binding protein  30.5 
 
 		 542 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.160568  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2381  ABC transporter, ATP-binding protein  30.07 
 
 		 543 aa  253  7e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.138547  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2617  ABC transporter, ATP-binding protein  29.76 
 
 		 548 aa  253  7e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000147161 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2620  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  29.94 
 
 		 542 aa  253  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00269042  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2658  ABC transporter, ATP-binding protein  30.49 
 
 		 548 aa  252  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000890134  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2534  ABC transporter related  30.87 
 
 		 542 aa  249  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165488  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14070  ABC transporter related  35.25 
 
 		 640 aa  241  2.9999999999999997e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0328486  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1626  ABC transporter related  31.43 
 
 		 619 aa  241  2.9999999999999997e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  35.09 
 
 		 636 aa  239  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1961  ABC transporter related  29.56 
 
 		 577 aa  238  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  36.27 
 
 		 634 aa  238  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0941  ATPase  31.84 
 
 		 569 aa  234  2.0000000000000002e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  34.47 
 
 		 644 aa  233  5e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  36.66 
 
 		 567 aa  233  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  28.31 
 
 		 630 aa  232  1e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2003  ABC transporter related  34 
 
 		 528 aa  230  4e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.118433  decreased coverage  0.00762466 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  35.37 
 
 		 564 aa  229  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4007  ABC transporter related protein  34.4 
 
 		 641 aa  228  1e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  33.06 
 
 		 767 aa  228  2e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1799  ABC transporter related protein  35.41 
 
 		 638 aa  226  5.0000000000000005e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0024  ABC transporter related protein  34.47 
 
 		 627 aa  227  5.0000000000000005e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2936  ABC transporter ATP-binding protein  33.5 
 
 		 528 aa  226  7e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.914866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2882  ABC transporter related  29.85 
 
 		 528 aa  226  7e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  33.01 
 
 		 620 aa  226  8e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2609  ABC transporter-like  33.5 
 
 		 528 aa  226  9e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195276 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2209  ABC transporter related  29.14 
 
 		 530 aa  225  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2084  ABC transporter related  29.14 
 
 		 530 aa  225  1e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1891  ABC transporter related  29.14 
 
 		 530 aa  225  1e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.12053 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  31.64 
 
 		 643 aa  225  2e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2750  ABC transporter related  32.92 
 
 		 528 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.742675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2755  ABC transporter related  32.92 
 
 		 528 aa  224  4e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  31.14 
 
 		 645 aa  224  4e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2836  ABC transporter related  32.92 
 
 		 528 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104102  normal  0.187196 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1517  ABC transporter related protein  35.34 
 
 		 530 aa  223  6e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1961  ABC transporter related  29.68 
 
 		 534 aa  223  7e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06614  hypothetical protein  28.92 
 
 		 526 aa  223  8e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  32.49 
 
 		 643 aa  223  8e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2495  ABC transporter  33.17 
 
 		 529 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3314  ABC transporter related  32.54 
 
 		 667 aa  222  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0368  ABC transporter related  31.91 
 
 		 606 aa  222  9.999999999999999e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2115  ABC transporter ATPase  29.03 
 
 		 549 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.199216  normal  0.196946 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2483  ABC transporter, ATP-binding protein  34.6 
 
 		 531 aa  222  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  31.39 
 
 		 663 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2999  ABC transporter ATP-binding protein  34.34 
 
 		 587 aa  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000839463 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2753  ABC transporter related  35.59 
 
 		 530 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1839  ABC transporter related  32.51 
 
 		 536 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.645779  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  32.72 
 
 		 641 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2293  ABC transporter related  34 
 
 		 613 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2581  ABC transporter related  34.34 
 
 		 531 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2288  ABC transporter related  29.22 
 
 		 536 aa  221  3e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1811  ABC transporter related  32.07 
 
 		 557 aa  221  3e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  33.42 
 
 		 630 aa  221  3e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2551  ABC transporter-like protein protein  35.59 
 
 		 564 aa  221  3e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2766  ABC transporter, ATP-binding protein  32.84 
 
 		 521 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0491169  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  36.05 
 
 		 581 aa  221  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2319  ATPase  29.85 
 
 		 574 aa  221  3.9999999999999997e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1063  ABC transporter related  30.62 
 
 		 530 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  34.99 
 
 		 575 aa  220  3.9999999999999997e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0945  ABC transporter, ATP-binding protein  30.62 
 
 		 530 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.638605  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1013  ABC transporter ATP-binding protein  28.46 
 
 		 522 aa  220  5e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  31.93 
 
 		 666 aa  220  5e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1545  ABC transporter-related protein  33.99 
 
 		 522 aa  220  6e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  30.39 
 
 		 663 aa  219  7e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2525  ABC transporter, ATP-binding protein  32.43 
 
 		 533 aa  218  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  31.72 
 
 		 658 aa  218  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  32.22 
 
 		 659 aa  218  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2512  ABC transporter related  28.76 
 
 		 620 aa  217  5e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.926021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2893  ABC transporter, ATP-binding protein  28.76 
 
 		 620 aa  217  5e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.669618  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1386  ABC transporter, ATP-binding protein  29.19 
 
 		 531 aa  216  7e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.65535  normal  0.0289108 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2480  ABC transporter related  27.98 
 
 		 529 aa  216  9e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0127  ABC transporter, ATP-binding protein  31.95 
 
 		 546 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  32.25 
 
 		 636 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2370  ABC transporter related  29.79 
 
 		 536 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  32.76 
 
 		 649 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0929  ABC transporter related  28.31 
 
 		 714 aa  215  9.999999999999999e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.526225  normal  0.675301 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1237  ABC transporter related  32.67 
 
 		 638 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000223212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1642  ABC transporter related  33.5 
 
 		 632 aa  216  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2822  ABC transporter related protein  34.33 
 
 		 530 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.596097  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5082  ABC transporter, ATP-binding protein  32.84 
 
 		 626 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0119916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0243  ABC transporter, ATP-binding protein  34.68 
 
 		 626 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.592514  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0245  ABC transporter, ATP-binding protein  34.62 
 
 		 626 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1559  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.09 
 
 		 531 aa  214  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0890  ABC transporter, ATP-binding protein  34.33 
 
 		 530 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.725571  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2823  ABC transporter related  34.33 
 
 		 530 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>