More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1598 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1598  ABC transporter related  100 
 
 		 476 aa  970    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2270  ABC transporter related protein  42.17 
 
 		 540 aa  379  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.196548  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4972  ABC transporter related  40.59 
 
 		 544 aa  365  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1085  ABC transporter related  39.22 
 
 		 534 aa  349  5e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000470508  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5296  putative macrolide efflux pump  41.01 
 
 		 544 aa  348  1e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4873  MDR-type ABC transporter, ATP-binding protein  41.44 
 
 		 544 aa  342  7e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5266  putative macrolide efflux pump  41.23 
 
 		 544 aa  339  7e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5028  macrolide efflux pump  41.23 
 
 		 544 aa  339  8e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5409  macrolide efflux pump  41.23 
 
 		 544 aa  339  8e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.952575  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4858  MDR-type ABC transporter, ATP-binding protein  40.8 
 
 		 544 aa  333  6e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1435  ABC transporter-related protein  39.16 
 
 		 522 aa  311  1e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0873  ABC transporter, ATP-binding protein  36.17 
 
 		 487 aa  292  9e-78  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2791  ABC transporter related  34.72 
 
 		 487 aa  280  3e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.741515 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0018  ABC transporter related  34.51 
 
 		 488 aa  258  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1961  ABC transporter related  30.57 
 
 		 577 aa  226  6e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14070  ABC transporter related  29.85 
 
 		 640 aa  218  1e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0328486  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  29.98 
 
 		 626 aa  212  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2617  ABC transporter, ATP-binding protein  30.44 
 
 		 548 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000147161 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  30.83 
 
 		 636 aa  211  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2750  nucleotide-binding protein ExpZ  29.81 
 
 		 548 aa  210  4e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000173219 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  32.26 
 
 		 639 aa  209  6e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2346  ABC transporter ATP-binding protein  29.81 
 
 		 542 aa  208  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.574829  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1799  ABC transporter related protein  34.55 
 
 		 638 aa  207  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  34.38 
 
 		 637 aa  207  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2381  ABC transporter, ATP-binding protein  31 
 
 		 543 aa  206  9e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.138547  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2658  ABC transporter, ATP-binding protein  28.96 
 
 		 548 aa  205  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000890134  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2620  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  29.24 
 
 		 542 aa  204  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00269042  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2534  ABC transporter related  28.63 
 
 		 542 aa  204  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165488  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  34.46 
 
 		 634 aa  204  4e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  32.81 
 
 		 620 aa  203  5e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  28.91 
 
 		 638 aa  203  6e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0642  ABC transporter related  30.69 
 
 		 629 aa  202  9e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.64323  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4373  ABC transporter-related protein  31.68 
 
 		 629 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0223118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2573  ABC transporter, ATP-binding protein  28.75 
 
 		 542 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.160568  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3785  ABC transporter related  29.67 
 
 		 628 aa  201  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3059  ABC transporter related  29.67 
 
 		 628 aa  201  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  33.5 
 
 		 630 aa  201  3e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0650  ABC transporter related  30.6 
 
 		 590 aa  199  7.999999999999999e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  31.94 
 
 		 636 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0368  ABC transporter related  30.54 
 
 		 606 aa  199  1.0000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  28.31 
 
 		 535 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1930  ABC transporter related  28.9 
 
 		 643 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1404  ABC transporter-related protein  28.41 
 
 		 640 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0880457  normal  0.193066 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3830  ABC transporter-related protein  29.26 
 
 		 632 aa  196  6e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.457691 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0784  ABC transporter related  30.63 
 
 		 598 aa  196  6e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1626  ABC transporter related  28.38 
 
 		 619 aa  195  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  31.09 
 
 		 643 aa  195  1e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2893  ABC transporter, ATP-binding protein  29.16 
 
 		 620 aa  194  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.669618  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  32.58 
 
 		 641 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.17 
 
 		 635 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3847  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.84 
 
 		 635 aa  194  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  29.22 
 
 		 632 aa  195  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  31.95 
 
 		 644 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2512  ABC transporter related  29.16 
 
 		 620 aa  194  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.926021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  32.45 
 
 		 659 aa  194  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3729  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.17 
 
 		 635 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83809  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3764  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.17 
 
 		 635 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.460675 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0413  ABC transporter related  30.62 
 
 		 641 aa  194  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00715783  hitchhiker  0.000000249616 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.17 
 
 		 635 aa  194  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2171  ABC transporter related  30.25 
 
 		 645 aa  193  5e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  28.91 
 
 		 540 aa  193  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3827  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.17 
 
 		 635 aa  193  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4027  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.52 
 
 		 635 aa  192  8e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.963749  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  29.56 
 
 		 643 aa  192  8e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  28.84 
 
 		 540 aa  192  9e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  28.84 
 
 		 540 aa  192  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0181  ferric-enterobactin ABC transporter ATPase  29.59 
 
 		 626 aa  192  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.530164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4007  ABC transporter related protein  30.05 
 
 		 641 aa  191  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2722  ABC transporter related protein  29.73 
 
 		 631 aa  192  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3959  ABC transporter related  28.68 
 
 		 612 aa  191  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3897  ABC transporter related  29.61 
 
 		 613 aa  191  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  28.41 
 
 		 635 aa  191  2e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2288  ABC transporter related  27.88 
 
 		 536 aa  191  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.84 
 
 		 637 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0024  ABC transporter related protein  32.28 
 
 		 627 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0945  ABC transporter related  29.54 
 
 		 580 aa  191  2.9999999999999997e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0334  ABC transporter related protein  28.66 
 
 		 606 aa  191  2.9999999999999997e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136705  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  31.93 
 
 		 644 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  31.93 
 
 		 659 aa  190  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  33.68 
 
 		 636 aa  190  5.999999999999999e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2727  ABC transporter related  30.59 
 
 		 649 aa  190  5.999999999999999e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.26231  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  28.52 
 
 		 634 aa  190  5.999999999999999e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  31.66 
 
 		 658 aa  189  7e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  29.64 
 
 		 666 aa  189  7e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0106  ABC transporter related  31.11 
 
 		 544 aa  189  7e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1648  ABC transporter related protein  28.63 
 
 		 594 aa  189  7e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.372378  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2293  ABC transporter related  30.26 
 
 		 613 aa  189  7e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.03 
 
 		 637 aa  189  7e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1721  ABC transporter, ATP-binding protein  32.9 
 
 		 643 aa  189  8e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269264  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.84 
 
 		 637 aa  189  9e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  27.84 
 
 		 637 aa  189  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  32.02 
 
 		 658 aa  188  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4771  ABC transporter related  28.85 
 
 		 635 aa  189  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  32.02 
 
 		 658 aa  189  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  32.02 
 
 		 640 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.84 
 
 		 637 aa  189  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.84 
 
 		 637 aa  189  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03121  ABC transporter ATP-binding protein  26.35 
 
 		 530 aa  189  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2125  ABC transporter related  31.01 
 
 		 659 aa  189  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.457352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  27.84 
 
 		 637 aa  189  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>