More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2270 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2270  ABC transporter related protein  100 
 
 		 540 aa  1097    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.196548  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1085  ABC transporter related  44.01 
 
 		 534 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000470508  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4972  ABC transporter related  42.64 
 
 		 544 aa  422  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5296  putative macrolide efflux pump  42.27 
 
 		 544 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5028  macrolide efflux pump  42.64 
 
 		 544 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4858  MDR-type ABC transporter, ATP-binding protein  42.46 
 
 		 544 aa  388  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4873  MDR-type ABC transporter, ATP-binding protein  42.64 
 
 		 544 aa  387  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5409  macrolide efflux pump  42.64 
 
 		 544 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.952575  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1435  ABC transporter-related protein  41.76 
 
 		 522 aa  388  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5266  putative macrolide efflux pump  42.46 
 
 		 544 aa  386  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1598  ABC transporter related  42.17 
 
 		 476 aa  373  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2791  ABC transporter related  34.63 
 
 		 487 aa  292  1e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.741515 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0873  ABC transporter, ATP-binding protein  35.2 
 
 		 487 aa  292  1e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1961  ABC transporter related  33.79 
 
 		 577 aa  281  1e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0018  ABC transporter related  35.82 
 
 		 488 aa  273  9e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  31.17 
 
 		 641 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  31.7 
 
 		 644 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14070  ABC transporter related  36.7 
 
 		 640 aa  231  2e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0328486  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1626  ABC transporter related  30.11 
 
 		 619 aa  229  7e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2658  ABC transporter, ATP-binding protein  30.35 
 
 		 548 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000890134  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2620  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  30 
 
 		 542 aa  226  6e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00269042  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0024  ABC transporter related protein  33.01 
 
 		 627 aa  224  2e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2573  ABC transporter, ATP-binding protein  30.43 
 
 		 542 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.160568  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  29.36 
 
 		 636 aa  223  9e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2750  nucleotide-binding protein ExpZ  30.11 
 
 		 548 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000173219 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2617  ABC transporter, ATP-binding protein  29.87 
 
 		 548 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000147161 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  34.59 
 
 		 634 aa  221  3.9999999999999997e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2346  ABC transporter ATP-binding protein  29.68 
 
 		 542 aa  219  7e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.574829  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2534  ABC transporter related  30.3 
 
 		 542 aa  218  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165488  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  28.81 
 
 		 659 aa  218  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  29.5 
 
 		 630 aa  217  4e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2381  ABC transporter, ATP-binding protein  29.35 
 
 		 543 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.138547  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  28.52 
 
 		 644 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4007  ABC transporter related protein  32.79 
 
 		 641 aa  214  4.9999999999999996e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2727  ABC transporter related  34.98 
 
 		 649 aa  213  4.9999999999999996e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.26231  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  32.78 
 
 		 639 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  29.23 
 
 		 666 aa  212  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  27.98 
 
 		 656 aa  211  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  28.67 
 
 		 658 aa  211  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  34.85 
 
 		 535 aa  211  2e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  27.32 
 
 		 668 aa  212  2e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1642  ABC transporter related  28.29 
 
 		 632 aa  211  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  34.76 
 
 		 767 aa  210  5e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  28.35 
 
 		 545 aa  209  7e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2910  ABC transporter related  30.48 
 
 		 537 aa  209  9e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  29.26 
 
 		 643 aa  209  2e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  30.78 
 
 		 638 aa  207  3e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  30.63 
 
 		 567 aa  207  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  33.57 
 
 		 630 aa  207  4e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  34 
 
 		 636 aa  206  9e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13460  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  28.49 
 
 		 532 aa  205  1e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.576158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1237  ABC transporter related  28.62 
 
 		 638 aa  206  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000223212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  28.26 
 
 		 632 aa  205  1e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  29.66 
 
 		 637 aa  205  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  28.55 
 
 		 645 aa  205  1e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  27.87 
 
 		 659 aa  206  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0368  ABC transporter related  30.21 
 
 		 606 aa  204  3e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  28.65 
 
 		 643 aa  204  3e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2125  ABC transporter related  32.61 
 
 		 659 aa  203  6e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.457352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  29.66 
 
 		 581 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1374  ABC transporter-related protein  30.33 
 
 		 610 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1799  ABC transporter related protein  34.8 
 
 		 638 aa  201  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0996  ABC transporter related  27.75 
 
 		 536 aa  201  3.9999999999999996e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.99181  normal  0.725541 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0506  ABC transporter related  28.18 
 
 		 691 aa  200  3.9999999999999996e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  32.47 
 
 		 709 aa  200  5e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2495  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.92 
 
 		 558 aa  199  9e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290369 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2293  ABC transporter related  33.75 
 
 		 613 aa  199  9e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00070  ABC transporter, ATP-binding subunit  27.54 
 
 		 639 aa  199  9e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1361  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.63 
 
 		 561 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127735  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  29.71 
 
 		 631 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01571  ABC transporter, ATP binding component  28.47 
 
 		 572 aa  199  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2115  ABC transporter related  27.94 
 
 		 621 aa  198  2.0000000000000003e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0255573  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07215  ABC transporter ATP-binding protein  30.04 
 
 		 622 aa  198  2.0000000000000003e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0831  ABC transporter related  30.62 
 
 		 577 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00618018  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2441  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.67 
 
 		 558 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00204105  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1721  ABC transporter, ATP-binding protein  28.47 
 
 		 643 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269264  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  32.66 
 
 		 540 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  28.72 
 
 		 635 aa  198  2.0000000000000003e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  28.17 
 
 		 542 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4406  ABC transporter related protein  27.24 
 
 		 630 aa  197  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2319  ATPase  29.51 
 
 		 574 aa  197  3e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2008  ABC transporter, ATPase subunit  33.25 
 
 		 641 aa  197  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  33.01 
 
 		 690 aa  197  3e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1613  ABC transporter-related protein  28.5 
 
 		 630 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050504  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002284  glutathione-regulated potassium-efflux system ATP-binding protein  27.7 
 
 		 659 aa  197  4.0000000000000005e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.43126  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0941  ATPase  33.41 
 
 		 569 aa  197  4.0000000000000005e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  31.55 
 
 		 646 aa  196  8.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3241  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.26 
 
 		 561 aa  196  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000308971  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1455  ABC transporter ATP-binding protein  28.12 
 
 		 572 aa  196  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5234  ABC transporter related protein  28.6 
 
 		 555 aa  195  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1449  ABC transporter  28.24 
 
 		 643 aa  196  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.174197  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1880  ABC transporter ATPase  28.31 
 
 		 532 aa  195  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.548476  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7137  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.22 
 
 		 550 aa  195  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2563  ABC transporter related  27.68 
 
 		 532 aa  195  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0199173  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  29.12 
 
 		 564 aa  194  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0373  ABC transporter related  27.1 
 
 		 657 aa  194  3e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1961  ABC transporter-like protein  30.15 
 
 		 532 aa  194  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.346167 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6251  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.37 
 
 		 549 aa  194  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.223769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0112  ABC transporter related  28.35 
 
 		 650 aa  194  4e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.339786  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3897  ABC transporter related  29.17 
 
 		 613 aa  193  5e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>