More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0497 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0497  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 523 aa  1062    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.208057 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2220  ABC transporter related  52.44 
 
 		 492 aa  551  1e-156  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2313  ABC transporter, ATP-binding protein  53.47 
 
 		 492 aa  535  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000196397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2271  ABC transporter, ATP-binding protein  53.67 
 
 		 492 aa  536  1e-151  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.11466  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2546  ABC transporter, ATP-binding protein  53.06 
 
 		 492 aa  531  1e-149  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.55199e-45 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2355  ABC transporter ATP-binding protein  52.65 
 
 		 492 aa  526  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0376605  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1690  ABC transporter, ATP-binding protein  52.86 
 
 		 492 aa  528  1e-148  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.359726  hitchhiker  0.0000000000000525976 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2531  ABC transporter ATP-binding protein  52.65 
 
 		 492 aa  526  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1612  ABC transporter related  51.63 
 
 		 495 aa  523  1e-147  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.052092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3162  ABC transporter related protein  54.69 
 
 		 488 aa  509  1e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0458111  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3229  ABC transporter related  50.3 
 
 		 495 aa  507  9.999999999999999e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736702  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0044  ABC transporter, ATP-binding protein  47.14 
 
 		 490 aa  469  1.0000000000000001e-131  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3631  ABC transporter, ATP-binding protein  52.81 
 
 		 460 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2109  ABC transporter related  46.34 
 
 		 492 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0818  ABC transporter ATPase  37.92 
 
 		 501 aa  349  6e-95  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000307399  normal  0.444871 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0976  ABC transporter ATPase  39.16 
 
 		 516 aa  347  3e-94  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2020  ABC transporter related  32.83 
 
 		 522 aa  281  3e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1961  ABC transporter related  29.46 
 
 		 577 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1548  ABC transporter related  35.06 
 
 		 305 aa  175  9.999999999999999e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  30.18 
 
 		 630 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  28.55 
 
 		 634 aa  171  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4782  ABC transporter related  24.29 
 
 		 620 aa  172  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2877  ABC transporter related  24.48 
 
 		 621 aa  171  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.358823  normal  0.296098 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6763  ABC transporter related  24.72 
 
 		 623 aa  169  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.260757  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0873  ABC transporter, ATP-binding protein  27.18 
 
 		 487 aa  168  2.9999999999999998e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  27.84 
 
 		 635 aa  168  2.9999999999999998e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  25.46 
 
 		 620 aa  167  5.9999999999999996e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4634  ABC transporter related  24.34 
 
 		 621 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4267  ABC transporter related  24.34 
 
 		 621 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.183783  normal  0.517303 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6573  ABC transporter related  23.84 
 
 		 623 aa  166  8e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00902465 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4972  ABC transporter related  28.48 
 
 		 544 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2170  ABC transporter component  25.8 
 
 		 645 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2270  ABC transporter related protein  29 
 
 		 540 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.196548  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0690  ABC transporter related  24.34 
 
 		 636 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4007  ABC transporter related protein  25.76 
 
 		 641 aa  163  7e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1673  ABC transporter, ATPase subunit  24.65 
 
 		 625 aa  162  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1085  ABC transporter related  28.12 
 
 		 534 aa  162  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000470508  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  26.29 
 
 		 636 aa  162  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3835  ABC transporter ATP-binding protein  26.19 
 
 		 622 aa  161  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.551802 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2242  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.95 
 
 		 553 aa  161  3e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2346  ABC transporter ATP-binding protein  28.54 
 
 		 542 aa  160  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.574829  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2791  ABC transporter related  27.54 
 
 		 487 aa  160  5e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.741515 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0368  ABC transporter related  27.56 
 
 		 606 aa  160  7e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4261  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  26.13 
 
 		 609 aa  160  7e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1367  ABC transporter, ATP-binding protein  23.65 
 
 		 634 aa  159  8e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  23.66 
 
 		 641 aa  159  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  23.44 
 
 		 649 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2617  ABC transporter, ATP-binding protein  28.33 
 
 		 548 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000147161 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  23.55 
 
 		 661 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  23.38 
 
 		 649 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  23.55 
 
 		 661 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2750  nucleotide-binding protein ExpZ  28.23 
 
 		 548 aa  158  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000173219 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4858  MDR-type ABC transporter, ATP-binding protein  26.51 
 
 		 544 aa  158  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  23.2 
 
 		 649 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1687  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.98 
 
 		 557 aa  158  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00296418  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  23.26 
 
 		 649 aa  158  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0904  ABC transporter related  24.57 
 
 		 527 aa  159  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.467195  decreased coverage  0.00659199 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2910  ABC transporter related  26.81 
 
 		 537 aa  158  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1598  ABC transporter related  25.1 
 
 		 476 aa  157  4e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2381  ABC transporter, ATP-binding protein  28.48 
 
 		 543 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.138547  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1374  ABC transporter-related protein  26.08 
 
 		 610 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49454  ABC(ATP-binding) family transporter  25.14 
 
 		 649 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00209815  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0299  ABC transporter related  28.22 
 
 		 642 aa  157  5.0000000000000005e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2573  ABC transporter, ATP-binding protein  28.69 
 
 		 542 aa  157  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.160568  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2534  ABC transporter related  28.36 
 
 		 542 aa  157  7e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165488  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  25.24 
 
 		 632 aa  156  9e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3830  ABC transporter-related protein  24.26 
 
 		 632 aa  156  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.457691 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0061  ABC transporter related  25.09 
 
 		 635 aa  155  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.234701 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2658  ABC transporter, ATP-binding protein  28.96 
 
 		 548 aa  156  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000890134  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1183  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.4 
 
 		 554 aa  155  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.976373 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.45 
 
 		 559 aa  156  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1013  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.79 
 
 		 555 aa  155  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  25.09 
 
 		 630 aa  155  2e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  23.96 
 
 		 549 aa  155  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1284  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.17 
 
 		 670 aa  155  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0413  ABC transporter ATP-binding protein  28.02 
 
 		 527 aa  155  2e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0187168  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2620  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  28.33 
 
 		 542 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00269042  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4264  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.81 
 
 		 554 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2091  ABC transporter related  23.26 
 
 		 627 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105315 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4602  ABC transporter, ATP-binding protein  24.62 
 
 		 563 aa  154  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.29694  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1747  ABC transporter related  23.39 
 
 		 615 aa  154  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219257  normal  0.123618 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0918  ABC transporter related  23.09 
 
 		 688 aa  154  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.101083 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2916  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.77 
 
 		 563 aa  154  5e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0621526  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4875  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.72 
 
 		 554 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.54223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0935  ABC transporter related  25.91 
 
 		 530 aa  154  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  24.21 
 
 		 540 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5296  putative macrolide efflux pump  27.03 
 
 		 544 aa  153  7e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0506  ABC transporter related  23.36 
 
 		 691 aa  153  7e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0920  ABC transporter related  24.95 
 
 		 596 aa  153  8e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4510  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.39 
 
 		 555 aa  153  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29936  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  24.86 
 
 		 645 aa  152  1e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7142  ABC transporter related  26.49 
 
 		 528 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0181  ferric-enterobactin ABC transporter ATPase  25.09 
 
 		 626 aa  152  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.530164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  24.21 
 
 		 540 aa  152  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  23.97 
 
 		 540 aa  152  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2924  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.41 
 
 		 555 aa  152  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.570812  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3897  ABC transporter related  25.83 
 
 		 613 aa  152  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  23.46 
 
 		 548 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  24.09 
 
 		 540 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0413  ABC transporter related  25 
 
 		 641 aa  152  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00715783  hitchhiker  0.000000249616 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>