More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0506 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0506  ABC transporter related  100 
 
 		 691 aa  1339    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0929  ABC transporter related  39.09 
 
 		 714 aa  320  7e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.526225  normal  0.675301 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0024  ABC transporter related protein  30.95 
 
 		 627 aa  288  2.9999999999999996e-76  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  34.22 
 
 		 767 aa  287  4e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  29.13 
 
 		 634 aa  287  5e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  35.63 
 
 		 640 aa  271  2.9999999999999997e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  30.49 
 
 		 643 aa  270  5.9999999999999995e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  35.06 
 
 		 632 aa  270  8.999999999999999e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  34.66 
 
 		 690 aa  268  2.9999999999999995e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1799  ABC transporter related protein  29.66 
 
 		 638 aa  268  2.9999999999999995e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  29.19 
 
 		 639 aa  266  8.999999999999999e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  30.7 
 
 		 644 aa  266  1e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4007  ABC transporter related protein  31.11 
 
 		 641 aa  266  1e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  32.39 
 
 		 641 aa  265  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  35.77 
 
 		 672 aa  265  3e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14070  ABC transporter related  31.34 
 
 		 640 aa  262  2e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0328486  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0776  ABC transporter-like protein  36.57 
 
 		 626 aa  260  6e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.740868 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1338  ABC transporter-like protein  41.48 
 
 		 690 aa  260  7e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.212929 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3740  ABC transporter related  32.75 
 
 		 667 aa  258  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.345281  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  31.87 
 
 		 636 aa  259  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2398  ABC transporter related  35.04 
 
 		 650 aa  258  3e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  34.89 
 
 		 620 aa  257  4e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0123  ABC transporter related  33.15 
 
 		 643 aa  257  4e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0878  ABC transporter component  32.61 
 
 		 540 aa  257  5e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  33.46 
 
 		 668 aa  256  8e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2293  ABC transporter related  37.85 
 
 		 613 aa  256  9e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  28.52 
 
 		 632 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0167  ABC transporter related protein  33.28 
 
 		 624 aa  256  1.0000000000000001e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692888  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4634  ABC transporter related  36.48 
 
 		 621 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  31.53 
 
 		 636 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  33.85 
 
 		 560 aa  254  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4267  ABC transporter related  36.48 
 
 		 621 aa  254  3e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.183783  normal  0.517303 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2860  ABC transporter related  33.6 
 
 		 530 aa  254  3e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3059  ABC transporter related  36.01 
 
 		 628 aa  254  4.0000000000000004e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  30.89 
 
 		 646 aa  254  4.0000000000000004e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1433  ABC transporter related protein  28.86 
 
 		 649 aa  254  5.000000000000001e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  32.37 
 
 		 540 aa  254  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5212  ABC transporter related  32.55 
 
 		 539 aa  253  6e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3785  ABC transporter related  36.01 
 
 		 628 aa  253  6e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  31.77 
 
 		 540 aa  253  8.000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  31.46 
 
 		 663 aa  252  1e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  31.26 
 
 		 535 aa  253  1e-65  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  36.36 
 
 		 641 aa  253  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01021  ABC transporter, ATP binding component  29.48 
 
 		 541 aa  252  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.663375  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  30.04 
 
 		 666 aa  252  1e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  33.14 
 
 		 540 aa  253  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  30.99 
 
 		 540 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49454  ABC(ATP-binding) family transporter  33.4 
 
 		 649 aa  252  2e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00209815  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1027  ABC transporter related  32.5 
 
 		 664 aa  252  2e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  33.14 
 
 		 709 aa  252  2e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  31.93 
 
 		 663 aa  251  2e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0719  ABC transporter related  32.75 
 
 		 540 aa  252  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.363919 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  29 
 
 		 638 aa  251  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  31.25 
 
 		 685 aa  251  3e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  32.95 
 
 		 540 aa  251  3e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0897  ABC transporter, ATP-binding protein  29.61 
 
 		 643 aa  251  3e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0093  ABC transporter ATP-binding protein  29.66 
 
 		 536 aa  251  4e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.785822  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  32.95 
 
 		 540 aa  251  4e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  31.58 
 
 		 540 aa  251  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  34.11 
 
 		 548 aa  250  6e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01041  ABC transporter, ATP binding component  29.96 
 
 		 541 aa  250  6e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.15596  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  35.99 
 
 		 642 aa  250  8e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  31.8 
 
 		 659 aa  249  9e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0840  ABC transporter related  32.16 
 
 		 540 aa  249  9e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0716  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  31.77 
 
 		 541 aa  249  9e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  31.61 
 
 		 662 aa  249  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2216  ABC transporter related  33.67 
 
 		 540 aa  249  1e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  31.61 
 
 		 644 aa  249  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0925  ABC transporter, ATP-binding protein  29.42 
 
 		 643 aa  249  1e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.511016  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1642  ABC transporter related  34.22 
 
 		 632 aa  248  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  33.92 
 
 		 548 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2217  ABC transporter related  31.71 
 
 		 565 aa  248  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0780  ATPase  33.21 
 
 		 630 aa  248  3e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.989868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1008  Fis family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 629 aa  248  3e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50537  predicted protein  33.64 
 
 		 879 aa  248  4e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.437528  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  29.96 
 
 		 656 aa  247  4.9999999999999997e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  31.66 
 
 		 644 aa  247  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2115  ABC transporter related  30.59 
 
 		 621 aa  247  4.9999999999999997e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0255573  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.17 
 
 		 558 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.406197  hitchhiker  0.00000247304 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  31.8 
 
 		 658 aa  247  6e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0181  ferric-enterobactin ABC transporter ATPase  37.12 
 
 		 626 aa  247  6e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.530164  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  31.61 
 
 		 658 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  33.53 
 
 		 548 aa  246  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1673  ABC transporter, ATPase subunit  33.6 
 
 		 625 aa  246  8e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07215  ABC transporter ATP-binding protein  29.61 
 
 		 622 aa  246  8e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  30.62 
 
 		 634 aa  246  8e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0967  ABC transporter, ATP-binding protein  29.68 
 
 		 643 aa  246  9.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  33.53 
 
 		 545 aa  246  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  31.61 
 
 		 658 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  31.61 
 
 		 658 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  31.61 
 
 		 640 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1528  ABC transporter related protein  38.6 
 
 		 632 aa  245  1.9999999999999999e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.319656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3334  ABC transporter related  36.12 
 
 		 637 aa  245  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115349 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  31.68 
 
 		 659 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0949  ABC transporter related  32.16 
 
 		 540 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5234  ABC transporter related protein  33.92 
 
 		 555 aa  245  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1845  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.77 
 
 		 556 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000460921 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2425  ABC transporter related  31.58 
 
 		 540 aa  245  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  31.47 
 
 		 658 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2877  ABC transporter related  35.47 
 
 		 621 aa  244  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.358823  normal  0.296098 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>