More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1374 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1374  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 610 aa  1251    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0143  ABC transporter-related protein  47.15 
 
 		 611 aa  560  1e-158  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.565871  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1170  ABC transporter related protein  46.14 
 
 		 610 aa  548  1e-154  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.187468  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  34.63 
 
 		 668 aa  343  7e-93  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1027  ABC transporter related  36.62 
 
 		 664 aa  337  2.9999999999999997e-91  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  33.55 
 
 		 630 aa  328  2.0000000000000001e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  36.55 
 
 		 690 aa  327  3e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  34.61 
 
 		 645 aa  326  8.000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  30.67 
 
 		 646 aa  324  3e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1220  ABC transporter related  33.56 
 
 		 627 aa  321  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289587 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1075  ABC transporter related  33.22 
 
 		 627 aa  320  5e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000840512 
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.83 
 
 		 645 aa  318  2e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  33.99 
 
 		 649 aa  318  2e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  30.22 
 
 		 632 aa  316  9e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  31.59 
 
 		 638 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  31.18 
 
 		 672 aa  315  1.9999999999999998e-84  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  33.13 
 
 		 645 aa  312  9e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0690  ABC transporter related  32.51 
 
 		 636 aa  313  9e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  35.96 
 
 		 545 aa  311  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  33.55 
 
 		 649 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  35.81 
 
 		 709 aa  311  2.9999999999999997e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0601  ABC transporter related  33.03 
 
 		 651 aa  310  5e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0701  ABC transporter related  34.55 
 
 		 648 aa  310  6.999999999999999e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000286992 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0250  ATPase  31.43 
 
 		 662 aa  309  9e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  35.06 
 
 		 540 aa  309  9e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  30.82 
 
 		 641 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  35.12 
 
 		 560 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2125  ABC transporter related  31.8 
 
 		 659 aa  307  3e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.457352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  34.25 
 
 		 540 aa  307  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  34.25 
 
 		 540 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0716  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  35 
 
 		 541 aa  306  7e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  33.89 
 
 		 540 aa  306  8.000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0661  ABC transporter-related protein  32.77 
 
 		 650 aa  306  8.000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0493  ATPase  35.08 
 
 		 653 aa  306  8.000000000000001e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.521292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  31.9 
 
 		 637 aa  306  9.000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4079  ABC transporter related  34.84 
 
 		 540 aa  306  9.000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2379  ABC transporter related  32.22 
 
 		 660 aa  306  9.000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0770  ABC transporter related  33.44 
 
 		 629 aa  306  1.0000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0943746 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0106  ABC transporter related  34.04 
 
 		 544 aa  305  2.0000000000000002e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0690  ABC transporter related protein  33.54 
 
 		 648 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.185815  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1626  ABC transporter related  34.91 
 
 		 619 aa  305  2.0000000000000002e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.68 
 
 		 637 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  32.68 
 
 		 637 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  32.68 
 
 		 637 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  33.46 
 
 		 540 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.68 
 
 		 637 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  31.32 
 
 		 643 aa  304  4.0000000000000003e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6573  ABC transporter related  33.95 
 
 		 623 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00902465 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.68 
 
 		 637 aa  304  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1539  ABC transporter related  35.65 
 
 		 615 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.176229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.68 
 
 		 637 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.68 
 
 		 637 aa  304  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.68 
 
 		 637 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  32.68 
 
 		 637 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  36.1 
 
 		 543 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2877  ABC transporter related  33.67 
 
 		 621 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.358823  normal  0.296098 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1948  ABC transporter related  33.28 
 
 		 650 aa  303  6.000000000000001e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2217  ABC transporter related  34.94 
 
 		 565 aa  303  6.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1649  ABC transporter related  32.84 
 
 		 642 aa  303  6.000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  35.19 
 
 		 549 aa  303  6.000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  33.94 
 
 		 540 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2895  putative ABC transporter, fused ATPase subunits  35.47 
 
 		 615 aa  302  9e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2596  ABC transporter related  32.01 
 
 		 627 aa  302  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  35.43 
 
 		 641 aa  302  1e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2216  ABC transporter related  34.07 
 
 		 540 aa  302  1e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5212  ABC transporter related  35.38 
 
 		 539 aa  302  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  31.12 
 
 		 644 aa  301  2e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4634  ABC transporter related  33.22 
 
 		 621 aa  300  4e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2091  ABC transporter related  32.97 
 
 		 627 aa  300  4e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105315 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  36.23 
 
 		 544 aa  300  4e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0949  ABC transporter related  35.01 
 
 		 540 aa  300  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4267  ABC transporter related  33.22 
 
 		 621 aa  300  5e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.183783  normal  0.517303 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  33.58 
 
 		 685 aa  300  6e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  34.31 
 
 		 540 aa  300  7e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  32.6 
 
 		 656 aa  299  9e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1754  ABC transporter related  31.7 
 
 		 625 aa  299  1e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.544165  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2203  ABC transporter related  31.66 
 
 		 669 aa  298  1e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  32.9 
 
 		 663 aa  298  2e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  35.44 
 
 		 548 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  35.44 
 
 		 548 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1126  ABC transporter related  35.12 
 
 		 642 aa  298  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0852453 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  35.3 
 
 		 543 aa  298  2e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0618  ABC transporter related  35.28 
 
 		 652 aa  298  3e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000236816  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2425  ABC transporter related  33.76 
 
 		 540 aa  297  4e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  34.77 
 
 		 545 aa  296  5e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0405  ABC transporter related protein  31.29 
 
 		 658 aa  296  8e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224406  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0840  ABC transporter related  34.88 
 
 		 540 aa  296  8e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  34.62 
 
 		 540 aa  296  1e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0692  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 627 aa  295  2e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.242868  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  34.81 
 
 		 542 aa  294  3e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0996  ABC transporter related  35.05 
 
 		 536 aa  294  3e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.99181  normal  0.725541 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  35.06 
 
 		 548 aa  294  3e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0719  ABC transporter related  35.12 
 
 		 540 aa  294  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.363919 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  32.9 
 
 		 663 aa  294  3e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0299  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.97 
 
 		 639 aa  294  3e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0334  ATPase  34.43 
 
 		 656 aa  294  4e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2484  ABC transporter related  32.62 
 
 		 625 aa  294  4e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.814906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1623  hypothetical protein  30.37 
 
 		 636 aa  294  4e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3764  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.37 
 
 		 635 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.460675 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.54 
 
 		 635 aa  293  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>