More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1548 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1548  ABC transporter related  100 
 
 		 305 aa  630  1e-180  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0976  ABC transporter ATPase  41.31 
 
 		 516 aa  233  2.0000000000000002e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0818  ABC transporter ATPase  40.71 
 
 		 501 aa  231  8.000000000000001e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000307399  normal  0.444871 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2271  ABC transporter, ATP-binding protein  38.93 
 
 		 492 aa  206  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.11466  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2313  ABC transporter, ATP-binding protein  38.59 
 
 		 492 aa  204  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000196397  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2220  ABC transporter related  37.01 
 
 		 492 aa  203  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2109  ABC transporter related  36.18 
 
 		 492 aa  203  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2546  ABC transporter, ATP-binding protein  37.92 
 
 		 492 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.55199e-45 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3229  ABC transporter related  37.83 
 
 		 495 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736702  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2355  ABC transporter ATP-binding protein  37.58 
 
 		 492 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0376605  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2531  ABC transporter ATP-binding protein  37.58 
 
 		 492 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1690  ABC transporter, ATP-binding protein  37.25 
 
 		 492 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.359726  hitchhiker  0.0000000000000525976 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0497  ABC transporter, ATP-binding protein  35.06 
 
 		 523 aa  193  3e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.208057 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1612  ABC transporter related  36.98 
 
 		 495 aa  192  6e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.052092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3162  ABC transporter related protein  40.07 
 
 		 488 aa  192  9e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0458111  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0044  ABC transporter, ATP-binding protein  34.54 
 
 		 490 aa  179  8e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3631  ABC transporter, ATP-binding protein  35.86 
 
 		 460 aa  147  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2020  ABC transporter related  26.44 
 
 		 522 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2573  ABC transporter, ATP-binding protein  26.13 
 
 		 542 aa  106  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.160568  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2750  nucleotide-binding protein ExpZ  25.57 
 
 		 548 aa  105  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000173219 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2534  ABC transporter related  25.57 
 
 		 542 aa  103  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165488  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2346  ABC transporter ATP-binding protein  24.59 
 
 		 542 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.574829  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2617  ABC transporter, ATP-binding protein  24.59 
 
 		 548 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000147161 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2620  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  24.59 
 
 		 542 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00269042  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2658  ABC transporter, ATP-binding protein  24.59 
 
 		 548 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000890134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2381  ABC transporter, ATP-binding protein  25.51 
 
 		 543 aa  96.3  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.138547  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1572  ABC transporter related  29.69 
 
 		 603 aa  92.4  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0945  ABC transporter related  30.1 
 
 		 580 aa  92  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1961  ABC transporter related  24.41 
 
 		 577 aa  89.7  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3350  ABC transporter related  26.32 
 
 		 547 aa  89  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0368  ABC transporter related  29.08 
 
 		 606 aa  87.4  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  24.09 
 
 		 620 aa  86.7  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1435  ABC transporter-related protein  27.21 
 
 		 522 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  26.18 
 
 		 634 aa  83.2  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0453  ABC transporter related protein  26.67 
 
 		 552 aa  83.2  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1754  ABC transporter related  24.09 
 
 		 625 aa  82.8  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.544165  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0831  ABC transporter related  25.76 
 
 		 577 aa  82.4  0.000000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00618018  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0409  ABC transporter, ATP-binding subunit  25.26 
 
 		 596 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.722245  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  33.5 
 
 		 261 aa  82  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1950  ABC transporter related  27.94 
 
 		 653 aa  82  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0106  ABC transporter related  25.75 
 
 		 544 aa  81.3  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  26.02 
 
 		 649 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49454  ABC(ATP-binding) family transporter  24.36 
 
 		 649 aa  80.5  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00209815  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  24.39 
 
 		 645 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4364  ABC transporter related  24.91 
 
 		 519 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1374  ABC transporter-related protein  26.05 
 
 		 610 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4771  ABC transporter related  26.29 
 
 		 635 aa  79.3  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0031  ABC transporter related  28.57 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2170  ABC transporter component  24.75 
 
 		 645 aa  79  0.00000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1521  ABC transporter related protein  26.87 
 
 		 601 aa  78.6  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0493324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5281  ABC transporter ATP-binding protein  27.65 
 
 		 517 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5125  ABC transporter, ATP-binding protein  27.65 
 
 		 517 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.525386  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0996  ABC transporter related  22.01 
 
 		 536 aa  77.8  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.99181  normal  0.725541 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1174  ABC transporter related  26.76 
 
 		 654 aa  78.2  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5678  ABC transporter ATP-binding protein  27.65 
 
 		 517 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2552  ABC transporter related  22.16 
 
 		 604 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5524  ABC transporter, ATP-binding protein  27.65 
 
 		 517 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  26.29 
 
 		 626 aa  77  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3161  ABC transporter-like protein  24.74 
 
 		 608 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.970833 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2424  ABC transporter ATP-binding protein  24.43 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3951  ABC transporter-related protein  26.97 
 
 		 517 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1776  ABC transporter ATPase component  29.32 
 
 		 641 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.205391  hitchhiker  0.000192841 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0349  ABC transporter related  25.63 
 
 		 602 aa  77  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0287299 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0899  ABC transporter related  26.84 
 
 		 663 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.998664  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2608  ABC transporter ATPase component  29.32 
 
 		 641 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00157626  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0548  ABC transporter-related protein  29.17 
 
 		 265 aa  77.4  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2568  ABC transporter ATPase component  29.32 
 
 		 641 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.452475  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2683  ABC transporter ATPase component  29.32 
 
 		 641 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0324813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1101  ABC transporter related  23.76 
 
 		 658 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0871053  normal  0.0818517 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2145  ABC transporter ATPase component  26.75 
 
 		 639 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.338763  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5108  ABC transporter, ATP-binding protein  27.65 
 
 		 517 aa  77  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0828  ABC transporter related  26.84 
 
 		 636 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  27.14 
 
 		 258 aa  77  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3959  ABC transporter related  23.83 
 
 		 612 aa  77  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3086  ABC transporter related  22.68 
 
 		 609 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.395233  normal  0.156942 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2194  ABC transporter related  24.66 
 
 		 464 aa  76.6  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3202  ABC transporter related  22.68 
 
 		 603 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2008  ABC transporter, ATPase subunit  28.93 
 
 		 641 aa  76.6  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0800  ABC transporter, ATP-binding protein  25.91 
 
 		 622 aa  76.6  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00285677 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0507  ABC transporter related protein  23.17 
 
 		 549 aa  76.6  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  25.57 
 
 		 630 aa  76.3  0.0000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1144  ABC transporter, ATPase subunit  25.89 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176868  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1853  ABC transporter ATPase component  28.8 
 
 		 640 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1419  ABC transporter:AAA ATPase  25.84 
 
 		 648 aa  76.3  0.0000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.148207 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  29.32 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1609  ABC transporter ATPase component  28.8 
 
 		 640 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  24.46 
 
 		 643 aa  76.3  0.0000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1603  ABC transporter ATPase component  28.8 
 
 		 640 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0251377  normal  0.331537 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0473  ABC transporter related  24.19 
 
 		 648 aa  75.9  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1634  ABC transporter ATPase component  28.8 
 
 		 641 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.202979  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  26.02 
 
 		 567 aa  75.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1542  ABC transporter ATPase component  28.8 
 
 		 640 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  25.51 
 
 		 649 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4873  MDR-type ABC transporter, ATP-binding protein  26.06 
 
 		 544 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3596  ABC transporter related  26.44 
 
 		 527 aa  75.9  0.0000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.737822  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND00300  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  25 
 
 		 625 aa  75.1  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.681189  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  29.32 
 
 		 249 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1170  ABC transporter related protein  24.19 
 
 		 610 aa  75.5  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.187468  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0123  ABC transporter related  26.64 
 
 		 643 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1814  ABC transporter ATPase component  29.84 
 
 		 639 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000485056  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>