More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1170 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1170  ABC transporter related protein  100 
 
 		 610 aa  1241    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.187468  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0143  ABC transporter-related protein  56.11 
 
 		 611 aa  680    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.565871  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1374  ABC transporter-related protein  46.14 
 
 		 610 aa  548  1e-154  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  33.65 
 
 		 668 aa  332  1e-89  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  29.24 
 
 		 690 aa  320  5e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  33.53 
 
 		 709 aa  319  1e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  33.39 
 
 		 643 aa  318  2e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  33.06 
 
 		 630 aa  318  2e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1075  ABC transporter related  32.82 
 
 		 627 aa  318  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000840512 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  33.44 
 
 		 649 aa  318  2e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1220  ABC transporter related  32.99 
 
 		 627 aa  317  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289587 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  32.71 
 
 		 672 aa  318  3e-85  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  33.11 
 
 		 632 aa  316  8e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3997  ABC transporter related  33.55 
 
 		 641 aa  314  2.9999999999999996e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0770  ABC transporter related  32.81 
 
 		 629 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0943746 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3467  ABC transporter related  32.08 
 
 		 625 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  34.14 
 
 		 540 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.17 
 
 		 645 aa  310  4e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4562  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.88 
 
 		 637 aa  310  5e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.673665 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  32.15 
 
 		 644 aa  309  8e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  34.36 
 
 		 645 aa  309  9e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  33.96 
 
 		 540 aa  309  9e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0433  ABC transporter, ATP-binding protein  31.91 
 
 		 641 aa  309  1.0000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0052  ABC transporter  32.48 
 
 		 636 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5478  ABC transporter-like  32.5 
 
 		 636 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.882087 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  33.4 
 
 		 543 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  32.99 
 
 		 638 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1626  ABC transporter related  32.98 
 
 		 619 aa  307  5.0000000000000004e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  32.26 
 
 		 637 aa  306  6e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  32.26 
 
 		 637 aa  306  6e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  32.26 
 
 		 637 aa  306  6e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.26 
 
 		 637 aa  306  6e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.26 
 
 		 637 aa  306  6e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.26 
 
 		 637 aa  306  6e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.26 
 
 		 637 aa  306  6e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.26 
 
 		 637 aa  306  6e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0138  ABC transporter, ATP-binding protein  32.31 
 
 		 651 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.43 
 
 		 637 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0473  ABC transporter related  31.65 
 
 		 648 aa  305  2.0000000000000002e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3764  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.66 
 
 		 635 aa  304  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.460675 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0690  ABC transporter related  30.77 
 
 		 636 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  31.09 
 
 		 641 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  29.97 
 
 		 663 aa  303  6.000000000000001e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  30.12 
 
 		 663 aa  303  6.000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2596  ABC transporter related  31.08 
 
 		 627 aa  303  7.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3729  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.49 
 
 		 635 aa  303  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83809  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.32 
 
 		 635 aa  303  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47520  ABC transporter , ATP-binding protein  32.48 
 
 		 633 aa  302  9e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3689  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.29 
 
 		 640 aa  302  1e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3932  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.29 
 
 		 640 aa  302  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  32.16 
 
 		 646 aa  301  2e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.32 
 
 		 635 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0264  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.13 
 
 		 640 aa  301  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1743  ABC transporter related  32.5 
 
 		 633 aa  301  2e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0202205 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  33.46 
 
 		 535 aa  302  2e-80  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  32.16 
 
 		 549 aa  301  3e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4027  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.42 
 
 		 635 aa  301  3e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.963749  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3847  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.2 
 
 		 635 aa  301  3e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3827  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.32 
 
 		 635 aa  301  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  32.72 
 
 		 637 aa  300  7e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  32.22 
 
 		 544 aa  299  9e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  33.21 
 
 		 543 aa  299  1e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2125  ABC transporter related  30.62 
 
 		 659 aa  299  1e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.457352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3136  ABC transporter related  32.49 
 
 		 644 aa  299  1e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  31.48 
 
 		 645 aa  298  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  33.21 
 
 		 545 aa  298  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  29.46 
 
 		 685 aa  298  3e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  33.33 
 
 		 542 aa  297  4e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0265  ABC transporter related  32.98 
 
 		 636 aa  297  4e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2484  ABC transporter related  32.2 
 
 		 625 aa  296  5e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.814906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  31.43 
 
 		 649 aa  297  5e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4782  ABC transporter related  32.13 
 
 		 620 aa  296  6e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0289  ABC transporter related  32.47 
 
 		 636 aa  296  8e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0167  ABC transporter related protein  30.4 
 
 		 624 aa  296  9e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692888  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0196  ABC transporter ATP-binding protein  32.29 
 
 		 636 aa  296  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6057  ABC transporter related protein  28.28 
 
 		 688 aa  296  1e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0217  ABC transporter related  32.29 
 
 		 636 aa  296  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.631932  normal  0.82416 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0299  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.96 
 
 		 639 aa  295  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6763  ABC transporter related  31.05 
 
 		 623 aa  295  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.260757  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5997  ABC transporter ATP-binding protein  34.11 
 
 		 638 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148625  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6573  ABC transporter related  31.05 
 
 		 623 aa  296  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00902465 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  32.51 
 
 		 658 aa  295  2e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  31.35 
 
 		 659 aa  295  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  32.4 
 
 		 656 aa  294  3e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  31.65 
 
 		 658 aa  294  3e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  32.68 
 
 		 658 aa  294  3e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0061  ABC transporter related  32.82 
 
 		 635 aa  294  3e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.234701 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  31.71 
 
 		 659 aa  294  3e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2877  ABC transporter related  32.42 
 
 		 621 aa  294  3e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.358823  normal  0.296098 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  31.65 
 
 		 640 aa  294  3e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69340  putative ATP-binding component of ABC transporter  31.88 
 
 		 638 aa  294  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  32.51 
 
 		 658 aa  294  4e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3770  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.88 
 
 		 634 aa  293  6e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.605767  hitchhiker  0.00540958 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  31.36 
 
 		 635 aa  293  6e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  30.9 
 
 		 644 aa  292  1e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1549  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  32.64 
 
 		 639 aa  292  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1930  ABC transporter related  31.46 
 
 		 643 aa  291  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  33.27 
 
 		 641 aa  291  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1027  ABC transporter related  32.9 
 
 		 664 aa  291  2e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3334  ABC transporter related  30.38 
 
 		 637 aa  291  3e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115349 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>