More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0143 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0143  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 611 aa  1238    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.565871  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1170  ABC transporter related protein  56.44 
 
 		 610 aa  697    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.187468  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1374  ABC transporter-related protein  47.15 
 
 		 610 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  33.44 
 
 		 632 aa  340  5.9999999999999996e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0690  ABC transporter related  32.53 
 
 		 636 aa  334  3e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  31.14 
 
 		 690 aa  326  9e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1930  ABC transporter related  32.56 
 
 		 643 aa  325  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  32.85 
 
 		 630 aa  324  2e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2473  ABC transporter related  31.65 
 
 		 650 aa  324  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000325943 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.09 
 
 		 635 aa  323  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  33.15 
 
 		 668 aa  323  7e-87  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3729  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.09 
 
 		 635 aa  322  9.000000000000001e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83809  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4562  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.97 
 
 		 637 aa  322  9.999999999999999e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.673665 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1355  ABC transporter related  30.84 
 
 		 646 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.195008  normal  0.583297 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.09 
 
 		 635 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3764  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.09 
 
 		 635 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.460675 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  34.4 
 
 		 659 aa  321  3e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3827  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.55 
 
 		 635 aa  320  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  33.21 
 
 		 672 aa  320  6e-86  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3847  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.84 
 
 		 635 aa  318  1e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  31.94 
 
 		 641 aa  319  1e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0265  ABC transporter related  32.14 
 
 		 636 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1404  ABC transporter-related protein  33.59 
 
 		 640 aa  318  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0880457  normal  0.193066 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4027  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.27 
 
 		 635 aa  317  5e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.963749  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1743  ABC transporter related  31.87 
 
 		 633 aa  317  5e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0202205 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.21 
 
 		 637 aa  316  7e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1759  ABC transporter-related protein  34.27 
 
 		 554 aa  316  8e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.656937  normal  0.0503302 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.26 
 
 		 637 aa  316  8e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  34.51 
 
 		 644 aa  316  8e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  32.26 
 
 		 637 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  32.26 
 
 		 637 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.26 
 
 		 637 aa  315  9.999999999999999e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.26 
 
 		 637 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0052  ABC transporter  31.61 
 
 		 636 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.26 
 
 		 637 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0299  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.1 
 
 		 639 aa  315  9.999999999999999e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  32.26 
 
 		 637 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.26 
 
 		 637 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2600  ABC transporter, ATP-binding protein  32.42 
 
 		 646 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0562857  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3932  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.57 
 
 		 640 aa  315  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2511  ABC transporter, ATP-binding protein  33.5 
 
 		 646 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.271255  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1241  ABC transporter related  33.56 
 
 		 643 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3689  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.57 
 
 		 640 aa  315  1.9999999999999998e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1075  ABC transporter related  33.33 
 
 		 627 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000840512 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2455  ABC transporter, ATP-binding protein  33.84 
 
 		 646 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.242369  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47520  ABC transporter , ATP-binding protein  31.54 
 
 		 633 aa  314  2.9999999999999996e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  31.36 
 
 		 658 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  31.52 
 
 		 658 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  34.99 
 
 		 545 aa  313  5.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1572  ABC transporter, ATP-binding protein  33.84 
 
 		 646 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.50284  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1347  ABC transporter, ATP-binding protein  33.84 
 
 		 646 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2041  ABC transporter related  36.26 
 
 		 651 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2075  ABC transporter, ATP-binding protein  33.84 
 
 		 646 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.491633  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  34.38 
 
 		 542 aa  313  5.999999999999999e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3237  ABC transporter, ATP-binding protein  33.84 
 
 		 646 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660205  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0138  ABC transporter, ATP-binding protein  31.67 
 
 		 651 aa  313  6.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  31.36 
 
 		 658 aa  313  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  31.36 
 
 		 658 aa  313  9e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  31.36 
 
 		 640 aa  312  9e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0289  ABC transporter related  32.2 
 
 		 636 aa  312  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0264  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.26 
 
 		 640 aa  312  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1220  ABC transporter related  32.66 
 
 		 627 aa  311  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289587 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  35.44 
 
 		 543 aa  311  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  34.07 
 
 		 543 aa  311  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1664  ABC transporter ATP-binding protein  34.36 
 
 		 657 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0247067 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  30.72 
 
 		 646 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  31.73 
 
 		 659 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  32.77 
 
 		 637 aa  310  4e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.94 
 
 		 637 aa  310  4e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  31.35 
 
 		 658 aa  310  5e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1626  ABC transporter related  35.31 
 
 		 619 aa  310  5e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1027  ABC transporter related  34.2 
 
 		 664 aa  310  5.9999999999999995e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  33.73 
 
 		 709 aa  310  5.9999999999999995e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  32.16 
 
 		 638 aa  310  6.999999999999999e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  32.42 
 
 		 644 aa  310  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  31.91 
 
 		 644 aa  309  9e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0196  ABC transporter ATP-binding protein  32.17 
 
 		 636 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0217  ABC transporter related  32.01 
 
 		 636 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.631932  normal  0.82416 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  34.07 
 
 		 540 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  31.76 
 
 		 662 aa  307  3e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5478  ABC transporter-like  32.7 
 
 		 636 aa  307  3e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.882087 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3608  ABC transporter related  35.93 
 
 		 687 aa  307  3e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100909  normal  0.0123712 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  34.26 
 
 		 540 aa  307  3e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  34.63 
 
 		 544 aa  306  6e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3136  ABC transporter related  32.47 
 
 		 644 aa  306  6e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69340  putative ATP-binding component of ABC transporter  31.64 
 
 		 638 aa  306  6e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3997  ABC transporter related  31.48 
 
 		 641 aa  306  7e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  33.95 
 
 		 549 aa  306  8.000000000000001e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2010  ABC transporter, ATP-binding protein  32.54 
 
 		 646 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146801  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2480  ABC transporter-related protein  35.48 
 
 		 676 aa  306  9.000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.404041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2715  ABC transporter related  33.11 
 
 		 650 aa  306  9.000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00070  ABC transporter, ATP-binding subunit  32.19 
 
 		 639 aa  306  1.0000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  32.4 
 
 		 643 aa  305  2.0000000000000002e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0279  ABC transporter related  34.09 
 
 		 673 aa  305  2.0000000000000002e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  35 
 
 		 540 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  33.45 
 
 		 656 aa  303  5.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1992  ABC transporter related  31.89 
 
 		 678 aa  303  5.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1249  ABC transporter related  35.45 
 
 		 645 aa  303  6.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0840692  normal  0.705767 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0770  ABC transporter related  32.47 
 
 		 629 aa  303  6.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0943746 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1808  ABC transporter related  31.93 
 
 		 672 aa  303  8.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.762366 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>