More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2194 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2194  ABC transporter related  100 
 
 
464 aa  925    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0066  hypothetical protein  42.79 
 
 
491 aa  375  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1407  hypothetical protein  40.62 
 
 
486 aa  358  1.9999999999999998e-97  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1586  hypothetical protein  40.72 
 
 
486 aa  353  4e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0281  ABC transporter related  38.9 
 
 
469 aa  351  2e-95  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.756116  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0368  ABC transporter related  29.33 
 
 
606 aa  211  2e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2346  ABC transporter ATP-binding protein  26.6 
 
 
542 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.574829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2381  ABC transporter, ATP-binding protein  26.75 
 
 
543 aa  190  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.138547  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2617  ABC transporter, ATP-binding protein  26.39 
 
 
548 aa  189  8e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000147161 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2573  ABC transporter, ATP-binding protein  26.75 
 
 
542 aa  189  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.160568  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4972  ABC transporter related  28.16 
 
 
544 aa  188  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2534  ABC transporter related  26.21 
 
 
542 aa  187  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165488  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2750  nucleotide-binding protein ExpZ  26.34 
 
 
548 aa  186  7e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000173219 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1145  ABC transporter related  31.4 
 
 
605 aa  183  6e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2658  ABC transporter, ATP-binding protein  26.19 
 
 
548 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000890134  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2620  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  26.19 
 
 
542 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00269042  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1626  ABC transporter related  29.94 
 
 
619 aa  180  5.999999999999999e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1435  ABC transporter-related protein  28.63 
 
 
522 aa  179  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4858  MDR-type ABC transporter, ATP-binding protein  28.54 
 
 
544 aa  178  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1753  ABC transporter, ATP-binding protein  30.42 
 
 
605 aa  177  3e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1692  ABC transporter, ATP-binding protein  30.42 
 
 
605 aa  177  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  32.78 
 
 
564 aa  177  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0349  ABC transporter related  30.83 
 
 
602 aa  177  5e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0287299 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5296  putative macrolide efflux pump  27.2 
 
 
544 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2270  ABC transporter related protein  28.87 
 
 
540 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.196548  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0831  ABC transporter related  26.04 
 
 
577 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00618018  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2153  ABC transporter, ATPase subunit  30.6 
 
 
602 aa  173  5e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0873  ABC transporter, ATP-binding protein  28.11 
 
 
487 aa  173  6.999999999999999e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0945  ABC transporter related  27.37 
 
 
580 aa  173  6.999999999999999e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3997  ABC transporter related  32.99 
 
 
641 aa  172  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  33.1 
 
 
767 aa  172  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  29.19 
 
 
533 aa  172  1e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0690  ABC transporter related  33.93 
 
 
636 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4873  MDR-type ABC transporter, ATP-binding protein  26.92 
 
 
544 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1374  ABC transporter-related protein  29.26 
 
 
610 aa  171  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  32.64 
 
 
575 aa  172  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  32.99 
 
 
581 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1027  ABC transporter related  34.38 
 
 
664 aa  171  3e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5028  macrolide efflux pump  27.12 
 
 
544 aa  170  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5409  macrolide efflux pump  27.12 
 
 
544 aa  170  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.952575  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2170  ABC transporter component  33.69 
 
 
645 aa  171  4e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4514  ABC transporter-related protein  35 
 
 
535 aa  171  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577215  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4261  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  28.94 
 
 
609 aa  170  5e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1649  ABC transporter related  34.87 
 
 
642 aa  169  8e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5266  putative macrolide efflux pump  27.12 
 
 
544 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3808  ABC transporter related  29.45 
 
 
606 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.53425  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0650  ABC transporter related  32.73 
 
 
590 aa  168  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2181  ABC transporter related  32.38 
 
 
565 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163034  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2895  putative ABC transporter, fused ATPase subunits  29.62 
 
 
615 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0131  ABC transporter, ATP-binding protein  28.83 
 
 
609 aa  167  4e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1539  ABC transporter related  29.62 
 
 
615 aa  167  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.176229  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3104  ABC transporter related  30.86 
 
 
608 aa  167  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.73656  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3202  ABC transporter related  29.44 
 
 
603 aa  167  5e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  31.33 
 
 
641 aa  167  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0672  ABC transporter related  31.08 
 
 
609 aa  167  5e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.276337  normal  0.341528 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  33.16 
 
 
630 aa  166  5.9999999999999996e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0415  ABC transporter ATPase  29.85 
 
 
533 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.238248  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1170  ABC transporter related protein  26.55 
 
 
610 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.187468  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3520  ABC transporter related  31.44 
 
 
602 aa  166  6.9999999999999995e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2552  ABC transporter related  29.57 
 
 
604 aa  166  9e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  32.81 
 
 
643 aa  166  1.0000000000000001e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1126  ABC transporter related  29.62 
 
 
642 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0852453 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0018  ABC transporter related  28.75 
 
 
488 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  29.77 
 
 
658 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2015  ABC transporter related  37.02 
 
 
525 aa  164  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.406124  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  32.14 
 
 
540 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4137  ABC transporter related  29.16 
 
 
605 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.245336 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1455  ABC transporter ATP-binding protein  32.81 
 
 
572 aa  163  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0961  ABC transporter related  30.93 
 
 
641 aa  163  5.0000000000000005e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01001  ABC transporter, ATP binding component  34.64 
 
 
575 aa  163  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01571  ABC transporter, ATP binding component  32.81 
 
 
572 aa  164  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3086  ABC transporter related  29.53 
 
 
609 aa  163  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.395233  normal  0.156942 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3169  ABC transporter related  35.66 
 
 
541 aa  163  7e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2727  ABC transporter related  32.47 
 
 
649 aa  163  8.000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.26231  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  29.95 
 
 
658 aa  162  9e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1472  ABC transporter related protein  35.94 
 
 
520 aa  162  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  29.95 
 
 
662 aa  162  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  27.23 
 
 
639 aa  162  1e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  29.95 
 
 
658 aa  162  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  29.95 
 
 
658 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  29.95 
 
 
640 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  33.75 
 
 
668 aa  162  1e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2253  ABC transporter related  29.64 
 
 
607 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0543985 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  29.95 
 
 
658 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  29.95 
 
 
644 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1598  ABC transporter related  25.16 
 
 
476 aa  162  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  32.11 
 
 
637 aa  162  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1950  ABC transporter related  31.81 
 
 
653 aa  161  2e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1013  ABC transporter component  32.23 
 
 
610 aa  162  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1714  ABC-transporter ATP-binding protein  31.54 
 
 
614 aa  161  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0650863 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1572  ABC transporter related  30.8 
 
 
603 aa  162  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  33.16 
 
 
645 aa  160  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  29.52 
 
 
644 aa  161  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0181  ferric-enterobactin ABC transporter ATPase  35.51 
 
 
626 aa  161  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.530164  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1404  ABC transporter-related protein  33.67 
 
 
640 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0880457  normal  0.193066 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0334  ABC transporter related protein  26.64 
 
 
606 aa  160  3e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136705  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  29.02 
 
 
666 aa  160  4e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  29.52 
 
 
659 aa  160  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01001  ABC transporter, ATP binding component  30.16 
 
 
540 aa  160  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0896  ABC transporter related  32.52 
 
 
599 aa  160  5e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.286143 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>