More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0334 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0334  ABC transporter related protein  100 
 
 
606 aa  1226    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136705  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1648  ABC transporter related protein  37.9 
 
 
594 aa  428  1e-118  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.372378  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  31.12 
 
 
668 aa  342  2e-92  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  31.12 
 
 
672 aa  320  3e-86  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2125  ABC transporter related  31.55 
 
 
659 aa  321  3e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.457352  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  33.33 
 
 
690 aa  320  5e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  34.05 
 
 
709 aa  316  9.999999999999999e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2008  ABC transporter, ATPase subunit  37.97 
 
 
641 aa  313  4.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198836  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  34.07 
 
 
630 aa  313  5.999999999999999e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  32.98 
 
 
637 aa  313  7.999999999999999e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  33.16 
 
 
646 aa  311  2e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1626  ABC transporter related  32.74 
 
 
619 aa  305  1.0000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6057  ABC transporter related protein  31.02 
 
 
688 aa  305  1.0000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  32.65 
 
 
663 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  30.82 
 
 
685 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  32.34 
 
 
641 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1135  ABC transporter related  33.91 
 
 
531 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.521044  normal  0.0732961 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0167  ABC transporter related protein  30.52 
 
 
624 aa  303  5.000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692888  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.36 
 
 
645 aa  302  1e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3729  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.23 
 
 
635 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83809  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  32.64 
 
 
663 aa  301  2e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  32.72 
 
 
545 aa  301  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3827  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.07 
 
 
635 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  32.98 
 
 
641 aa  301  3e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3847  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.19 
 
 
635 aa  300  4e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0264  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.77 
 
 
640 aa  300  4e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2003  ABC transporter related  32.95 
 
 
528 aa  300  7e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.118433  decreased coverage  0.00762466 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3932  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.61 
 
 
640 aa  300  8e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.07 
 
 
635 aa  299  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3689  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.61 
 
 
640 aa  300  8e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2480  ABC transporter related  32.19 
 
 
529 aa  299  8e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3764  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.07 
 
 
635 aa  299  9e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.460675 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.75 
 
 
635 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4562  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.17 
 
 
637 aa  298  1e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.673665 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  29.05 
 
 
645 aa  298  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  31.54 
 
 
645 aa  298  2e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  33.21 
 
 
540 aa  298  2e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4027  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.78 
 
 
635 aa  297  4e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.963749  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.23 
 
 
637 aa  297  4e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  31.5 
 
 
767 aa  296  5e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  35.31 
 
 
644 aa  296  8e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1355  ABC transporter related  29.64 
 
 
646 aa  296  9e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.195008  normal  0.583297 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.23 
 
 
637 aa  296  9e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  29.23 
 
 
637 aa  295  1e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  29.23 
 
 
637 aa  295  1e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.23 
 
 
637 aa  295  1e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  29.23 
 
 
637 aa  295  1e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.23 
 
 
637 aa  296  1e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.23 
 
 
637 aa  295  1e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.23 
 
 
637 aa  295  1e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  35.09 
 
 
575 aa  295  2e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2473  ABC transporter related  29.49 
 
 
650 aa  293  9e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000325943 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  32.16 
 
 
560 aa  293  9e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  30.36 
 
 
643 aa  293  9e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  31.11 
 
 
643 aa  292  1e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0878  ABC transporter component  32.66 
 
 
540 aa  292  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2882  ABC transporter related  33.08 
 
 
528 aa  292  1e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  34.06 
 
 
564 aa  291  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  32.78 
 
 
540 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0719  ABC transporter related  31.91 
 
 
540 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.363919 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.78 
 
 
637 aa  291  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1241  ABC transporter related  29.91 
 
 
643 aa  291  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1930  ABC transporter related  28.84 
 
 
643 aa  291  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  34.34 
 
 
656 aa  291  3e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0127  ABC transporter, ATP-binding protein  32.76 
 
 
546 aa  290  4e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  32.27 
 
 
632 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0716  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  32.59 
 
 
541 aa  290  6e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0299  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.46 
 
 
639 aa  290  7e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2217  ABC transporter related  32.6 
 
 
565 aa  290  7e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1127  ABC transporter, ATP-binding protein  32.7 
 
 
530 aa  289  8e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  33.21 
 
 
540 aa  290  8e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1404  ABC transporter-related protein  28.75 
 
 
640 aa  289  9e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0880457  normal  0.193066 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2750  ABC transporter related  32.38 
 
 
528 aa  289  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.742675  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  33.5 
 
 
659 aa  288  2e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2936  ABC transporter ATP-binding protein  32.38 
 
 
528 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.914866  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2755  ABC transporter related  32.19 
 
 
528 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1237  ABC transporter ATPase  33.33 
 
 
639 aa  287  2.9999999999999996e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0857839  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2729  ABC transporter, ATPase subunit  29.04 
 
 
635 aa  287  4e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2836  ABC transporter related  32.19 
 
 
528 aa  287  4e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104102  normal  0.187196 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003501  ABC transporter ATP-binding protein  32.33 
 
 
530 aa  287  4e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1709  ABC transporter related  32.83 
 
 
530 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2269  ABC transporter, ATP-binding protein  32.64 
 
 
530 aa  286  8e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  31.41 
 
 
543 aa  286  8e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1027  ABC transporter related  31.09 
 
 
664 aa  286  9e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6309  ABC transporter related  32.45 
 
 
530 aa  286  9e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1770  ABC transporter related  32.45 
 
 
530 aa  286  9e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210956  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2495  ABC transporter  32.32 
 
 
529 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02269  hypothetical protein  32.02 
 
 
530 aa  285  1.0000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1943  ABC transporter, fused ATPase subunits  32.45 
 
 
530 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.002693  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  34.2 
 
 
581 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1795  ABC transporter related  32.26 
 
 
530 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.348279 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  32.48 
 
 
636 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1386  ABC transporter, ATP-binding protein  32.4 
 
 
531 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.65535  normal  0.0289108 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  31.78 
 
 
635 aa  285  2.0000000000000002e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  31.91 
 
 
540 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2609  ABC transporter-like  32.7 
 
 
528 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.195276 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  31.17 
 
 
540 aa  284  3.0000000000000004e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  32.47 
 
 
542 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0945  ABC transporter, ATP-binding protein  32.45 
 
 
530 aa  284  4.0000000000000003e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.638605  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1063  ABC transporter related  32.45 
 
 
530 aa  284  4.0000000000000003e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>