More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND00300 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001307  ANIA_02210  ABC transporter (Eurofung)  53.01 
 
 		 610 aa  642    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.177403  normal  0.0978549 
 
 
-
 
NC_006686  CND00300  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  100 
 
 		 625 aa  1281    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.681189  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89162  ABC transporter  55.45 
 
 		 609 aa  674    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12543  predicted protein  49.82 
 
 		 557 aa  579  1e-164  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0560437  normal  0.0167575 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12095  frustulin 5  48.19 
 
 		 521 aa  510  1e-143  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16090  predicted protein  47.54 
 
 		 524 aa  481  1e-134  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00292057  hitchhiker  0.00726349 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41659  predicted protein  43.49 
 
 		 645 aa  474  1e-132  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.666462  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43066  predicted protein  43.35 
 
 		 631 aa  413  1e-114  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0251063  normal  0.287268 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_51174  predicted protein  39.39 
 
 		 623 aa  388  1e-106  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00520  regulation of translational elongation-related protein, putative  37.46 
 
 		 732 aa  381  1e-104  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10367  predicted protein  40.27 
 
 		 527 aa  371  1e-101  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04315  ABC transporter, putative (Eurofung)  36.77 
 
 		 751 aa  367  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.21831 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68683  ATP-binding cassette (ABC) family, regulator of translational elongation  35.32 
 
 		 752 aa  360  6e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.525981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_89200  predicted protein  35.39 
 
 		 685 aa  355  1e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.564175 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2170  ABC transporter component  36.86 
 
 		 645 aa  347  5e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1747  ABC transporter related  35.51 
 
 		 615 aa  334  3e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219257  normal  0.123618 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3847  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.38 
 
 		 635 aa  330  7e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1126  ABC transporter related  35.56 
 
 		 642 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0852453 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1539  ABC transporter related  35.37 
 
 		 615 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.176229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2895  putative ABC transporter, fused ATPase subunits  35.37 
 
 		 615 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4027  putative ABC transporter ATP-binding protein  36 
 
 		 635 aa  326  6e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.963749  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  35.48 
 
 		 637 aa  326  8.000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  35.48 
 
 		 637 aa  326  8.000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.48 
 
 		 637 aa  326  8.000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.48 
 
 		 637 aa  326  8.000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  35.48 
 
 		 637 aa  326  8.000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.48 
 
 		 637 aa  326  8.000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.48 
 
 		 637 aa  326  8.000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.48 
 
 		 637 aa  326  9e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.48 
 
 		 637 aa  325  1e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.48 
 
 		 635 aa  323  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3764  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.29 
 
 		 635 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.460675 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3729  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.29 
 
 		 635 aa  322  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83809  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.29 
 
 		 635 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3827  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.29 
 
 		 635 aa  321  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.59 
 
 		 637 aa  319  1e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1349  ABC transporter related  35.52 
 
 		 618 aa  318  2e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.238944 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3689  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.99 
 
 		 640 aa  317  3e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3932  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.99 
 
 		 640 aa  317  3e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0264  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.8 
 
 		 640 aa  317  4e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1820  ABC transporter related  36.27 
 
 		 615 aa  316  6e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.273612  normal  0.489617 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3770  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.11 
 
 		 634 aa  316  8e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.605767  hitchhiker  0.00540958 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0299  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.86 
 
 		 639 aa  310  5e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3334  ABC transporter related  36.75 
 
 		 637 aa  310  5.9999999999999995e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115349 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0954  ABC transporter related  33.91 
 
 		 633 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4562  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.71 
 
 		 637 aa  306  7e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.673665 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2596  ABC transporter related  34.56 
 
 		 627 aa  306  7e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45085  predicted protein  36.9 
 
 		 533 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.11187 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0770  ABC transporter related  34.06 
 
 		 629 aa  304  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0943746 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0238  ABC transporter related  36.49 
 
 		 625 aa  304  4.0000000000000003e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.773221  normal  0.692019 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0168  ABC transporter ATP-binding protein  33.27 
 
 		 532 aa  303  5.000000000000001e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.508364  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0167  ABC transporter related protein  33.21 
 
 		 624 aa  303  7.000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692888  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3138  ABC transporter related  34.67 
 
 		 621 aa  302  1e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00577211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0279  ABC transporter related  32.39 
 
 		 673 aa  302  1e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01943  ABC transporter ATP-binding protein  32.91 
 
 		 630 aa  302  1e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1075  ABC transporter related  34.25 
 
 		 627 aa  301  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000840512 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2091  ABC transporter related  34.81 
 
 		 627 aa  300  4e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105315 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3197  ABC transporter ATP-binding protein  34.39 
 
 		 638 aa  300  5e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.79023  normal  0.0446478 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2156  ABC transporter, ATP-binding protein  33.08 
 
 		 532 aa  299  1e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1894  ABC transporter related  33.15 
 
 		 656 aa  298  2e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2071  ABC transporter related  33.15 
 
 		 656 aa  298  2e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.144058 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1623  hypothetical protein  34.2 
 
 		 636 aa  298  2e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2877  ABC transporter related  34.13 
 
 		 621 aa  298  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.358823  normal  0.296098 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2351  ABC transpoter ATPase  33.82 
 
 		 650 aa  297  3e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.683326 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1220  ABC transporter related  35.16 
 
 		 627 aa  297  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289587 
 
 
-
 
NC_004310  BR0692  ABC transporter, ATP-binding protein  35.33 
 
 		 627 aa  296  6e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.242868  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2729  ABC transporter, ATPase subunit  34.07 
 
 		 635 aa  296  6e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1754  ABC transporter related  35.38 
 
 		 625 aa  296  8e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.544165  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0683  ABC transporter, ATP-binding protein  35.33 
 
 		 640 aa  296  8e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2480  ABC transporter-related protein  32.79 
 
 		 676 aa  296  9e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.404041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1673  ABC transporter, ATPase subunit  34.39 
 
 		 625 aa  296  1e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00070  ABC transporter, ATP-binding subunit  33.15 
 
 		 639 aa  295  1e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4634  ABC transporter related  34.52 
 
 		 621 aa  296  1e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3480  ABC transporter related  34.8 
 
 		 634 aa  295  1e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549576 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2336  ABC transporter related  34.95 
 
 		 625 aa  295  1e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.590481  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0196  ABC transporter ATP-binding protein  34.55 
 
 		 636 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4267  ABC transporter related  34.33 
 
 		 621 aa  295  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.183783  normal  0.517303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0217  ABC transporter related  34.55 
 
 		 636 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.631932  normal  0.82416 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1348  ABC transporter related  34.07 
 
 		 625 aa  295  2e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1249  ABC transporter related  35.77 
 
 		 645 aa  295  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0840692  normal  0.705767 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4782  ABC transporter related  34.9 
 
 		 620 aa  295  2e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1232  ABC transporter related  34.07 
 
 		 626 aa  295  2e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.072507  normal  0.215663 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3467  ABC transporter related  35.35 
 
 		 625 aa  294  3e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1315  ABC transporter related  34.75 
 
 		 692 aa  294  3e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.199616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1992  ABC transporter related  33.45 
 
 		 678 aa  294  3e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1367  ABC transporter, ATP-binding protein  34.5 
 
 		 634 aa  293  5e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1549  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  35 
 
 		 639 aa  293  5e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1174  ABC transporter related  32.96 
 
 		 654 aa  293  5e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0690  ABC transporter related  31.54 
 
 		 636 aa  293  5e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0265  ABC transporter related  34.75 
 
 		 636 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2041  ABC transporter related  33.63 
 
 		 651 aa  293  8e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2317  ABC transporter related  34.01 
 
 		 627 aa  293  9e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.359814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2186  ABC transporter, ATP-binding protein  33.71 
 
 		 638 aa  293  9e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151795  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1743  ABC transporter related  33.21 
 
 		 633 aa  292  1e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0202205 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1930  ABC transporter related  33.65 
 
 		 643 aa  291  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002284  glutathione-regulated potassium-efflux system ATP-binding protein  32.49 
 
 		 659 aa  291  2e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.43126  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0741  ABC transporter related  33.76 
 
 		 637 aa  291  2e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3281  ABC transporter related  33.76 
 
 		 637 aa  291  2e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3284  ABC transporter related  34.01 
 
 		 636 aa  291  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3393  ABC transporter related  33.76 
 
 		 637 aa  291  2e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>