More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03121 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00787  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  65.09 
 
 		 530 aa  729    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2822  ABC transporter related protein  65.09 
 
 		 530 aa  729    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.596097  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2483  ABC transporter, ATP-binding protein  65.28 
 
 		 531 aa  722    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1839  ABC transporter related  71.35 
 
 		 536 aa  809    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.645779  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0218  ABC transporter, ATP-binding protein  71.68 
 
 		 525 aa  797    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.307752  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1409  ABC transporter related  67.55 
 
 		 546 aa  753    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0180506  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  59.09 
 
 		 599 aa  650    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.58247  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0878  ABC transporter, ATP-binding protein  64.71 
 
 		 530 aa  721    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.720445  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2936  ABC transporter ATP-binding protein  65.27 
 
 		 528 aa  716    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.914866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1676  ABC transporter-related protein  67.36 
 
 		 531 aa  754    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.762171  unclonable  0.00000352126 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1500  ABC transporter related  60.08 
 
 		 530 aa  654    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0377572 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0906  ABC transporter ATP-binding protein  64.71 
 
 		 530 aa  721    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.753314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2750  ABC transporter related  65.08 
 
 		 528 aa  715    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.742675  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0127  ABC transporter, ATP-binding protein  63.74 
 
 		 546 aa  689    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1453  ABC transporter ATP-binding protein  59.93 
 
 		 540 aa  662    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.657517  normal  0.782574 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1285  ABC transporter related  59.89 
 
 		 530 aa  657    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.143824  normal  0.818875 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1366  ABC transporter, ATP-binding protein  70.23 
 
 		 534 aa  786    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3204  ABC transporter, ATP-binding protein  62.76 
 
 		 530 aa  704    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.305557  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1536  ABC transporter related  67.36 
 
 		 530 aa  755    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.211854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0100  ABC transporter, ATP-binding protein  59.09 
 
 		 599 aa  650    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.388339  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3190  ABC transporter related  66.6 
 
 		 531 aa  746    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1545  ABC transporter-related protein  65.5 
 
 		 522 aa  717    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1690  ABC transporter, ATP-binding protein  66.98 
 
 		 530 aa  749    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2525  ABC transporter, ATP-binding protein  72 
 
 		 533 aa  812    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1386  ABC transporter, ATP-binding protein  66.22 
 
 		 531 aa  737    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.65535  normal  0.0289108 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2766  ABC transporter, ATP-binding protein  62.79 
 
 		 521 aa  666    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0491169  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06614  hypothetical protein  74.23 
 
 		 526 aa  825    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0990  ABC transporter ATP-binding protein  64.71 
 
 		 531 aa  721    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.166125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0969  ABC transporter ATP-binding protein  64.71 
 
 		 531 aa  722    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03121  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 530 aa  1101    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1308  ABC transporter, ATP-binding protein  59.28 
 
 		 530 aa  652    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1013  ABC transporter ATP-binding protein  69.16 
 
 		 522 aa  775    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2495  ABC transporter  63.17 
 
 		 529 aa  676    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0911  ABC transporter ATP-binding protein  63.76 
 
 		 523 aa  691    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.759416  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1500  ABC transporter related  66.86 
 
 		 522 aa  739    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130097  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1844  ABC transporter related  60.49 
 
 		 540 aa  669    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0969  ABC transporter, ATP-binding protein  65.09 
 
 		 530 aa  729    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.12537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2771  ABC transporter related  65.7 
 
 		 522 aa  724    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2318  putative ABC transport system, ATP-binding protein  59.09 
 
 		 555 aa  652    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2581  ABC transporter related  65.46 
 
 		 531 aa  723    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2609  ABC transporter-like  64.31 
 
 		 528 aa  707    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195276 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2122  ABC transporter related  70.78 
 
 		 536 aa  788    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.282545  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3260  ABC transporter ATP-binding protein, two fused  65.5 
 
 		 523 aa  707    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0410854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2836  ABC transporter related  64.89 
 
 		 528 aa  713    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104102  normal  0.187196 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2823  ABC transporter related  65.09 
 
 		 530 aa  729    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5068  ABC transporter, fused ATPase subunits  58.94 
 
 		 530 aa  644    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.882741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2173  ABC transporter related  63.85 
 
 		 520 aa  700    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453186  normal  0.189659 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2186  ABC transporter, ATP-binding protein  59.09 
 
 		 555 aa  652    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1063  ABC transporter related  64.31 
 
 		 530 aa  712    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1606  ABC transporter related  66.03 
 
 		 528 aa  724    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2760  ABC transporter related  66.98 
 
 		 546 aa  748    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.120146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1333  ABC transporter related  60.3 
 
 		 560 aa  675    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.858749  normal  0.306045 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1486  ABC transporter-related protein  64.74 
 
 		 524 aa  722    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2370  ABC transporter related  73.06 
 
 		 536 aa  829    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1811  ABC transporter related  63.26 
 
 		 557 aa  703    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2269  ABC transporter, ATP-binding protein  59.47 
 
 		 530 aa  654    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0820  ABC transporter related  59.5 
 
 		 527 aa  644    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.354226  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2288  ABC transporter related  71.16 
 
 		 536 aa  810    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02269  hypothetical protein  65.28 
 
 		 530 aa  722    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1559  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  72.59 
 
 		 531 aa  819    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2209  ABC transporter related  69.81 
 
 		 530 aa  797    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1127  ABC transporter, ATP-binding protein  65.46 
 
 		 530 aa  724    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1135  ABC transporter related  59.96 
 
 		 531 aa  657    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.521044  normal  0.0732961 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1943  ABC transporter, fused ATPase subunits  59.81 
 
 		 530 aa  653    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.002693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1961  ABC transporter related  71.32 
 
 		 534 aa  810    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2240  ABC transporter related  64.74 
 
 		 522 aa  723    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2755  ABC transporter related  65.08 
 
 		 528 aa  716    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2480  ABC transporter related  64.31 
 
 		 529 aa  693    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2882  ABC transporter related  63.55 
 
 		 528 aa  694    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2003  ABC transporter related  65.08 
 
 		 528 aa  714    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.118433  decreased coverage  0.00762466 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1575  ABC transporter-related protein  58.8 
 
 		 540 aa  659    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.830365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2237  ABC transporter related  70.78 
 
 		 536 aa  785    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2115  ABC transporter ATPase  71.21 
 
 		 549 aa  811    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.199216  normal  0.196946 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3332  ABC transporter ATP-binding protein  64.89 
 
 		 529 aa  713    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6309  ABC transporter related  59.09 
 
 		 530 aa  648    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1712  ABC transporter related  63.76 
 
 		 520 aa  699    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4180  ABC transporter related  74.43 
 
 		 534 aa  847    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0101186  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2528  ABC transporter, ATP-binding protein  64.9 
 
 		 530 aa  729    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.138533  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0844  ABC transporter, ATP-binding protein  65.09 
 
 		 530 aa  729    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0890  ABC transporter, ATP-binding protein  65.09 
 
 		 530 aa  729    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.725571  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0877  ABC transporter, ATP-binding protein  65.09 
 
 		 530 aa  729    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3311  ABC transporter related  74 
 
 		 527 aa  833    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.819079 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2084  ABC transporter related  69.81 
 
 		 530 aa  797    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2586  ABC transporter related  66.98 
 
 		 546 aa  748    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.109376 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1891  ABC transporter related  69.81 
 
 		 530 aa  797    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.12053 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2653  ABC transporter related  66.98 
 
 		 546 aa  749    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.498071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1349  ABC transporter related  65.51 
 
 		 522 aa  724    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2077  ABC transporter related  71.51 
 
 		 553 aa  808    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1795  ABC transporter, ATP-binding protein  59.09 
 
 		 599 aa  650    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0657845  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1709  ABC transporter related  58.9 
 
 		 530 aa  648    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39130  putative ATP-binding component of ABC transporter  64.15 
 
 		 521 aa  693    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.288914 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2999  ABC transporter ATP-binding protein  65.09 
 
 		 587 aa  719    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000839463 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2150  ABC transporter ATPase  59.32 
 
 		 599 aa  650    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.911921  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2315  ABC transporter related  59.62 
 
 		 530 aa  651    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.751632  normal  0.0855999 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2353  ABC transporter related  70.59 
 
 		 536 aa  784    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.524444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0936  ABC transporter ATP-binding protein  64.52 
 
 		 530 aa  719    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1795  ABC transporter related  58.9 
 
 		 530 aa  647    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.348279 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1770  ABC transporter related  59.09 
 
 		 530 aa  648    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210956  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1311  ABC transporter related  65.65 
 
 		 531 aa  726    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1506  ABC transporter related  66.86 
 
 		 522 aa  738    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>