More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4180 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00787  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  63.38 
 
 		 530 aa  715    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2822  ABC transporter related protein  63.38 
 
 		 530 aa  715    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.596097  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2483  ABC transporter, ATP-binding protein  64.9 
 
 		 531 aa  728    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2122  ABC transporter related  78.57 
 
 		 536 aa  870    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.282545  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0969  ABC transporter, ATP-binding protein  63.38 
 
 		 530 aa  715    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.12537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1013  ABC transporter ATP-binding protein  76.15 
 
 		 522 aa  851    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1386  ABC transporter, ATP-binding protein  65.65 
 
 		 531 aa  743    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.65535  normal  0.0289108 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2936  ABC transporter ATP-binding protein  63.38 
 
 		 528 aa  714    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.914866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2750  ABC transporter related  63.38 
 
 		 528 aa  714    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.742675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2353  ABC transporter related  78.95 
 
 		 536 aa  874    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.524444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2823  ABC transporter related  63.38 
 
 		 530 aa  715    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1795  ABC transporter related  58.33 
 
 		 530 aa  641    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.348279 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0127  ABC transporter, ATP-binding protein  63 
 
 		 546 aa  691    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1453  ABC transporter ATP-binding protein  59.4 
 
 		 540 aa  655    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.657517  normal  0.782574 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1409  ABC transporter related  66.79 
 
 		 546 aa  751    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0180506  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0906  ABC transporter ATP-binding protein  63.95 
 
 		 530 aa  718    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.753314  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1366  ABC transporter, ATP-binding protein  74.16 
 
 		 534 aa  840    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3204  ABC transporter, ATP-binding protein  63.89 
 
 		 530 aa  719    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.305557  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02269  hypothetical protein  64.14 
 
 		 530 aa  717    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  58.33 
 
 		 599 aa  642    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.58247  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1063  ABC transporter related  62.62 
 
 		 530 aa  704    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1795  ABC transporter, ATP-binding protein  58.33 
 
 		 599 aa  642    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0657845  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1690  ABC transporter, ATP-binding protein  66.98 
 
 		 530 aa  750    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2525  ABC transporter, ATP-binding protein  78.9 
 
 		 533 aa  893    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2760  ABC transporter related  66.22 
 
 		 546 aa  743    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.120146  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2766  ABC transporter, ATP-binding protein  63.58 
 
 		 521 aa  682    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0491169  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2003  ABC transporter related  63.57 
 
 		 528 aa  709    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.118433  decreased coverage  0.00762466 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2315  ABC transporter related  59.66 
 
 		 530 aa  651    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.751632  normal  0.0855999 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0936  ABC transporter ATP-binding protein  63.76 
 
 		 530 aa  716    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0878  ABC transporter, ATP-binding protein  63.95 
 
 		 530 aa  718    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.720445  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0820  ABC transporter related  58.59 
 
 		 527 aa  635    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.354226  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0969  ABC transporter ATP-binding protein  63.95 
 
 		 531 aa  718    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138083  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1308  ABC transporter, ATP-binding protein  58.52 
 
 		 530 aa  644    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1486  ABC transporter-related protein  63.97 
 
 		 524 aa  717    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2495  ABC transporter  63.57 
 
 		 529 aa  692    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0911  ABC transporter ATP-binding protein  60.66 
 
 		 523 aa  659    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.759416  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1770  ABC transporter related  58.14 
 
 		 530 aa  639    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210956  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1844  ABC transporter related  59.22 
 
 		 540 aa  660    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2115  ABC transporter ATPase  79.14 
 
 		 549 aa  904    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.199216  normal  0.196946 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2318  putative ABC transport system, ATP-binding protein  58.33 
 
 		 555 aa  643    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2882  ABC transporter related  62.43 
 
 		 528 aa  689    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2609  ABC transporter-like  63.76 
 
 		 528 aa  714    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195276 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3332  ABC transporter ATP-binding protein  64.14 
 
 		 529 aa  717    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2581  ABC transporter related  65.09 
 
 		 531 aa  729    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1500  ABC transporter related  58.71 
 
 		 530 aa  642    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0377572 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5068  ABC transporter, fused ATPase subunits  57.95 
 
 		 530 aa  635    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.882741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2173  ABC transporter related  62.67 
 
 		 520 aa  701    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453186  normal  0.189659 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0100  ABC transporter, ATP-binding protein  58.33 
 
 		 599 aa  642    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.388339  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2755  ABC transporter related  63.19 
 
 		 528 aa  712    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2209  ABC transporter related  77.95 
 
 		 530 aa  884    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1285  ABC transporter related  59.85 
 
 		 530 aa  655    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.143824  normal  0.818875 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1606  ABC transporter related  64.31 
 
 		 528 aa  712    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1839  ABC transporter related  78.38 
 
 		 536 aa  890    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.645779  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2528  ABC transporter, ATP-binding protein  63.19 
 
 		 530 aa  714    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.138533  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1545  ABC transporter-related protein  63.97 
 
 		 522 aa  704    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0890  ABC transporter, ATP-binding protein  63.38 
 
 		 530 aa  715    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.725571  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1311  ABC transporter related  63.57 
 
 		 531 aa  716    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1811  ABC transporter related  61.96 
 
 		 557 aa  700    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3190  ABC transporter related  64.9 
 
 		 531 aa  738    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2269  ABC transporter, ATP-binding protein  58.71 
 
 		 530 aa  646    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2186  ABC transporter, ATP-binding protein  58.33 
 
 		 555 aa  643    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2771  ABC transporter related  64.74 
 
 		 522 aa  721    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0990  ABC transporter ATP-binding protein  63.95 
 
 		 531 aa  718    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.166125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1559  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  74.05 
 
 		 531 aa  835    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1127  ABC transporter, ATP-binding protein  64.71 
 
 		 530 aa  722    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1135  ABC transporter related  59.55 
 
 		 531 aa  662    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.521044  normal  0.0732961 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1943  ABC transporter, fused ATPase subunits  58.71 
 
 		 530 aa  645    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.002693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1961  ABC transporter related  77.34 
 
 		 534 aa  875    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2240  ABC transporter related  65.9 
 
 		 522 aa  736    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3311  ABC transporter related  81.97 
 
 		 527 aa  918    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.819079 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2480  ABC transporter related  61.1 
 
 		 529 aa  669    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3260  ABC transporter ATP-binding protein, two fused  63.55 
 
 		 523 aa  703    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0410854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0844  ABC transporter, ATP-binding protein  63.38 
 
 		 530 aa  715    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1575  ABC transporter-related protein  57.91 
 
 		 540 aa  654    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.830365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2150  ABC transporter ATPase  58.52 
 
 		 599 aa  643    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.911921  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1536  ABC transporter related  65.65 
 
 		 530 aa  743    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.211854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2237  ABC transporter related  78.95 
 
 		 536 aa  874    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6309  ABC transporter related  58.14 
 
 		 530 aa  639    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1712  ABC transporter related  61.58 
 
 		 520 aa  698    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4180  ABC transporter related  100 
 
 		 534 aa  1108    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0101186  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1500  ABC transporter related  65.51 
 
 		 522 aa  730    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130097  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2370  ABC transporter related  78.38 
 
 		 536 aa  894    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0877  ABC transporter, ATP-binding protein  63.38 
 
 		 530 aa  715    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06614  hypothetical protein  77.76 
 
 		 526 aa  868    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2288  ABC transporter related  79.17 
 
 		 536 aa  908    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2084  ABC transporter related  77.95 
 
 		 530 aa  884    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2586  ABC transporter related  66.22 
 
 		 546 aa  743    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.109376 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1891  ABC transporter related  77.95 
 
 		 530 aa  884    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.12053 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2653  ABC transporter related  66.22 
 
 		 546 aa  746    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.498071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1349  ABC transporter related  65.7 
 
 		 522 aa  732    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2077  ABC transporter related  78.57 
 
 		 553 aa  882    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03121  ABC transporter ATP-binding protein  74.43 
 
 		 530 aa  847    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1709  ABC transporter related  58.14 
 
 		 530 aa  639    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39130  putative ATP-binding component of ABC transporter  63.2 
 
 		 521 aa  697    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.288914 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2836  ABC transporter related  63.19 
 
 		 528 aa  713    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104102  normal  0.187196 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1676  ABC transporter-related protein  66.41 
 
 		 531 aa  751    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.762171  unclonable  0.00000352126 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1506  ABC transporter related  65.32 
 
 		 522 aa  729    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0218  ABC transporter, ATP-binding protein  75.81 
 
 		 525 aa  856    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.307752  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2999  ABC transporter ATP-binding protein  64.71 
 
 		 587 aa  724    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000839463 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1333  ABC transporter related  59.03 
 
 		 560 aa  663    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.858749  normal  0.306045 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>