More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2313 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2313  Shikimate kinase  100 
 
 		 168 aa  346  8e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0915782  hitchhiker  0.00353016 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0220  Shikimate kinase  48.77 
 
 		 167 aa  167  5e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000013813  normal  0.0131612 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3226  shikimate kinase  38.67 
 
 		 172 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3659  Shikimate kinase  38.96 
 
 		 169 aa  121  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0528  Shikimate kinase  40.24 
 
 		 166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.276227  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1899  Shikimate kinase  38.1 
 
 		 184 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431404 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0894  shikimate kinase  39.63 
 
 		 190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00120765  hitchhiker  0.000836884 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1529  shikimate kinase  41.07 
 
 		 180 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.140024  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6268  Shikimate kinase  36.36 
 
 		 170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00441949  normal  0.76442 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0253  3-dehydroquinate synthase  38.27 
 
 		 551 aa  111  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0553  shikimate kinase  39.02 
 
 		 181 aa  111  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.387005  normal  0.100064 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1855  shikimate kinase  39.76 
 
 		 181 aa  110  7.000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1799  shikimate kinase  39.87 
 
 		 191 aa  110  8.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.279615  normal  0.998322 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2817  shikimate kinase  40.48 
 
 		 181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.248239  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1479  shikimate kinase  40.48 
 
 		 193 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.298287  normal  0.404477 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1506  shikimate kinase  40 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_002950  PG1593  shikimate kinase  34.62 
 
 		 186 aa  107  9.000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0532  shikimate kinase  39.87 
 
 		 206 aa  103  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1900  shikimate kinase  38.64 
 
 		 216 aa  103  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.976916  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1467  3-dehydroquinate synthase  39.49 
 
 		 552 aa  102  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0403  3-dehydroquinate synthase  38.65 
 
 		 591 aa  101  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.831997 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0952  Shikimate kinase  38.41 
 
 		 187 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0979  Shikimate kinase  38.41 
 
 		 187 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0506883 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4543  shikimate kinase  37.65 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.715983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1534  Shikimate kinase  35.71 
 
 		 170 aa  99.4  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0792  Shikimate kinase  36.25 
 
 		 180 aa  99.8  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.5919e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2486  Shikimate kinase  38.1 
 
 		 192 aa  99  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01791  shikimate kinase  35.95 
 
 		 198 aa  99.4  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0539701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2345  shikimate kinase  36.05 
 
 		 199 aa  99.4  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1589  Shikimate kinase, 3-dehydroquinate synthase  37.5 
 
 		 579 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.025257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3596  shikimate kinase  36.88 
 
 		 196 aa  99  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3740  shikimate kinase  37.01 
 
 		 188 aa  98.6  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.695476  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0091  shikimate kinase  37.42 
 
 		 173 aa  98.6  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.10625 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3889  shikimate kinase  36.25 
 
 		 196 aa  98.2  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.090563  decreased coverage  0.00239824 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1476  shikimate kinase  35.29 
 
 		 198 aa  97.8  6e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0912  shikimate kinase  35.5 
 
 		 173 aa  97.8  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1220  shikimate kinase  36.11 
 
 		 190 aa  97.4  7e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.455019  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1406  shikimate kinase  37.13 
 
 		 202 aa  97.4  8e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.812389  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1718  shikimate kinase  35.26 
 
 		 208 aa  97.1  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.825758  normal  0.851225 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0960  shikimate kinase  35.8 
 
 		 199 aa  97.1  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0679  shikimate kinase  35.33 
 
 		 203 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.528323 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2092  shikimate kinase II  36.84 
 
 		 175 aa  95.9  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.300334  normal  0.0606791 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2168  shikimate kinase  34.87 
 
 		 186 aa  94.7  5e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.157663  normal  0.699838 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0354  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  36.67 
 
 		 593 aa  94.7  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3987  shikimate kinase  34.76 
 
 		 165 aa  94.4  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02051  shikimate kinase  37.16 
 
 		 192 aa  94.4  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1633  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  36.84 
 
 		 594 aa  94.4  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.364457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2170  shikimate kinase  35.54 
 
 		 201 aa  94.4  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal  0.0949629 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1923  Shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  35.71 
 
 		 579 aa  94  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0886542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1641  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  35.98 
 
 		 604 aa  94  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.124892 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3524  Shikimate kinase  39.22 
 
 		 169 aa  94  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.236256  normal  0.835023 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2137  shikimate kinase  36.31 
 
 		 174 aa  94  9e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.628527  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1763  shikimate kinase  33.15 
 
 		 264 aa  94  9e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1132  shikimate kinase  35.54 
 
 		 200 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220163  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0346  shikimate kinase  37.33 
 
 		 191 aa  93.6  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1951  shikimate kinase  31.87 
 
 		 217 aa  93.2  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4313  shikimate kinase  36.59 
 
 		 170 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2029  shikimate kinase  33.54 
 
 		 200 aa  93.2  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4137  shikimate kinase  34.76 
 
 		 165 aa  93.2  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.151576  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3977  shikimate kinase  34.76 
 
 		 165 aa  92.8  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.537604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4457  shikimate kinase  34.76 
 
 		 165 aa  93.2  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745283  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0658  shikimate kinase  36.09 
 
 		 178 aa  92.8  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0722  shikimate kinase  33.72 
 
 		 198 aa  93.2  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1819  shikimate kinase  39.63 
 
 		 169 aa  92.4  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4255  shikimate kinase  34.76 
 
 		 165 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0008  shikimate kinase  37.91 
 
 		 187 aa  92  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.780526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1517  shikimate kinase  33.53 
 
 		 171 aa  92.4  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2745  shikimate kinase  32.74 
 
 		 173 aa  92.4  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.164945  normal  0.272805 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1282  shikimate kinase  39.22 
 
 		 178 aa  92  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1878  shikimate kinase  33.55 
 
 		 186 aa  92  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0893  shikimate kinase  34.76 
 
 		 165 aa  91.7  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0038  shikimate kinase  31.95 
 
 		 181 aa  91.3  5e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0535  shikimate kinase  34.38 
 
 		 205 aa  91.3  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.74412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_10503  predicted protein  36.31 
 
 		 170 aa  91.3  6e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0837  shikimate kinase  34.44 
 
 		 190 aa  91.3  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.8297  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1700  Shikimate kinase  35 
 
 		 172 aa  90.9  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4020  shikimate kinase  34.48 
 
 		 181 aa  90.9  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.263055  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1516  shikimate kinase  34.09 
 
 		 197 aa  90.5  9e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.681098 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4053  shikimate kinase  36.67 
 
 		 197 aa  90.5  9e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.477248  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1609  shikimate kinase  36.36 
 
 		 185 aa  90.1  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.451303 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01201  shikimate kinase  35.22 
 
 		 185 aa  90.1  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4366  shikimate kinase  35.98 
 
 		 165 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2565  shikimate kinase  33.13 
 
 		 192 aa  90.1  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.412267 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1431  shikimate kinase  34.55 
 
 		 196 aa  90.1  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.373345  normal  0.0895571 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2532  shikimate kinase  37.93 
 
 		 173 aa  89.7  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884272  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0505  shikimate kinase  34.38 
 
 		 200 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0909  shikimate kinase  33.75 
 
 		 206 aa  89  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0490  shikimate kinase  36 
 
 		 224 aa  89  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2273  shikimate kinase  33.73 
 
 		 179 aa  89  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.787718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0294  shikimate kinase  34.81 
 
 		 204 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01241  shikimate kinase  33.11 
 
 		 185 aa  88.6  4e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2318  3-dehydroquinate synthase  38.1 
 
 		 615 aa  88.2  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0070259 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2728  shikimate kinase II  38.13 
 
 		 180 aa  88.2  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.255147  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1230  shikimate kinase  34.3 
 
 		 171 aa  88.2  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49363  predicted protein  36.84 
 
 		 277 aa  87.8  6e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.130562  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3064  shikimate kinase  33.72 
 
 		 195 aa  87.8  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0839  shikimate kinase  35.71 
 
 		 176 aa  87.8  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.657447  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3368  shikimate kinase I  32.94 
 
 		 171 aa  87.4  8e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000011554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2368  Shikimate kinase  40.59 
 
 		 165 aa  87.4  9e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0733676  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01231  shikimate kinase  32.7 
 
 		 185 aa  86.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>