More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2368 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_2368  Shikimate kinase  100 
 
 		 165 aa  323  7e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0733676  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0792  Shikimate kinase  41.25 
 
 		 180 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.5919e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01390  shikimate kinase  39.63 
 
 		 185 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0536542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0694  shikimate kinase  39.39 
 
 		 167 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00295001  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0694  shikimate kinase  38.79 
 
 		 167 aa  106  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.233345  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06600  shikimate kinase  40.67 
 
 		 188 aa  105  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1754  Shikimate kinase  42.11 
 
 		 184 aa  102  3e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0528  shikimate kinase  38.65 
 
 		 168 aa  102  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.361692  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2925  shikimate kinase  35.19 
 
 		 179 aa  101  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0528  Shikimate kinase  39.13 
 
 		 166 aa  101  6e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.276227  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2922  shikimate kinase  39.16 
 
 		 165 aa  100  7e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0441  shikimate kinase  37.11 
 
 		 176 aa  99  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.567872  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4137  shikimate kinase  37.72 
 
 		 165 aa  98.6  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.151576  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2345  shikimate kinase  33.93 
 
 		 199 aa  99  3e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4457  shikimate kinase  37.72 
 
 		 165 aa  98.6  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745283  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0024  shikimate kinase I  39.24 
 
 		 173 aa  98.6  3e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1517  shikimate kinase  37.2 
 
 		 171 aa  99  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00028  shikimate kinase I  37.5 
 
 		 172 aa  98.2  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3803  shikimate kinase I  37.97 
 
 		 173 aa  98.2  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00268813  normal  0.803666 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0731  shikimate kinase  40.82 
 
 		 170 aa  97.8  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000355155  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0678  shikimate kinase  33.73 
 
 		 182 aa  97.4  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.211914 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3759  shikimate kinase I  37.34 
 
 		 173 aa  97.1  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00136839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3686  shikimate kinase I  37.34 
 
 		 173 aa  97.1  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000028278  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3684  shikimate kinase I  37.34 
 
 		 173 aa  97.1  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000504262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3793  shikimate kinase I  37.34 
 
 		 173 aa  97.1  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.013782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3855  shikimate kinase I  37.34 
 
 		 173 aa  97.1  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.0000716125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2549  Shikimate kinase  32.93 
 
 		 189 aa  96.7  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0372  shikimate kinase  33.94 
 
 		 167 aa  95.9  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0374428  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0436  shikimate kinase  34.15 
 
 		 165 aa  96.3  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3987  shikimate kinase  38.92 
 
 		 165 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3267  shikimate kinase  35.12 
 
 		 229 aa  96.3  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_407  shikimate kinase  35.85 
 
 		 176 aa  95.9  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1563  shikimate 5-dehydrogenase  34.34 
 
 		 462 aa  95.9  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4605  shikimate kinase I  36.69 
 
 		 173 aa  95.5  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000116276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0392  shikimate kinase  35.33 
 
 		 184 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3883  shikimate kinase I  36.69 
 
 		 173 aa  94.7  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000719849  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0346  shikimate kinase  34.94 
 
 		 191 aa  95.1  4e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1700  Shikimate kinase  41.84 
 
 		 172 aa  94.7  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1571  shikimate kinase  33.94 
 
 		 165 aa  95.1  4e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0893  shikimate kinase  36.75 
 
 		 165 aa  94.7  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3966  shikimate kinase I  36.09 
 
 		 173 aa  94.7  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  1.60057e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2255  shikimate kinase  35 
 
 		 166 aa  94.7  5e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0410  shikimate kinase  33.54 
 
 		 165 aa  94.7  5e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0225  shikimate kinase I  36.09 
 
 		 173 aa  94.7  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000752096  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3727  shikimate kinase I  36.09 
 
 		 173 aa  94.7  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000014395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3108  shikimate kinase  32.52 
 
 		 184 aa  94.7  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0973333 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3489  shikimate kinase  35.37 
 
 		 184 aa  94  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0311  shikimate kinase  36 
 
 		 184 aa  94  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0776  shikimate kinase  42.38 
 
 		 173 aa  93.6  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3130  shikimate kinase  35.76 
 
 		 192 aa  93.6  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1899  Shikimate kinase  31.82 
 
 		 184 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431404 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4089  shikimate kinase  37.5 
 
 		 165 aa  93.6  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03242  shikimate kinase I  36.71 
 
 		 173 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00034661  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0323  Shikimate kinase  36.71 
 
 		 225 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000263169  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0464  shikimate kinase  36.2 
 
 		 176 aa  92.4  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3666  shikimate kinase I  36.71 
 
 		 225 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000538429  normal  0.0827574 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3977  shikimate kinase  38.32 
 
 		 165 aa  92.8  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.537604  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4543  shikimate kinase  32.35 
 
 		 176 aa  92.8  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.715983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3880  shikimate kinase  35.33 
 
 		 170 aa  92.4  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3586  shikimate kinase I  36.71 
 
 		 173 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  2.9305899999999995e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4694  shikimate kinase I  36.71 
 
 		 225 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000528588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4255  shikimate kinase  38.32 
 
 		 165 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3860  shikimate kinase I  36.71 
 
 		 173 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000504187  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0323  shikimate kinase I  36.71 
 
 		 173 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000129228  normal  0.10404 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3767  shikimate kinase I  36.71 
 
 		 173 aa  92.8  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000106668  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03194  hypothetical protein  36.71 
 
 		 173 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000404125  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4366  shikimate kinase  37.72 
 
 		 165 aa  92  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2206  shikimate kinase I  35.93 
 
 		 174 aa  92  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184461  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2426  shikimate kinase  35.19 
 
 		 167 aa  91.7  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00106596  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1002  shikimate kinase  36.81 
 
 		 183 aa  91.7  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1020  shikimate kinase  40 
 
 		 177 aa  91.3  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1850  shikimate kinase  31.93 
 
 		 174 aa  91.3  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.620898 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2014  shikimate kinase  33.12 
 
 		 169 aa  91.3  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0666  shikimate kinase I  37.72 
 
 		 171 aa  90.9  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000317623  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0220  Shikimate kinase  32.93 
 
 		 167 aa  90.5  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000013813  normal  0.0131612 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4313  shikimate kinase  37.35 
 
 		 170 aa  90.9  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3024  shikimate kinase  34 
 
 		 199 aa  90.5  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02051  shikimate kinase  36.43 
 
 		 192 aa  90.9  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3226  shikimate kinase  39.16 
 
 		 172 aa  90.9  8e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0013  shikimate kinase  31.1 
 
 		 175 aa  90.5  9e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.668155  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2747  shikimate kinase  33.55 
 
 		 177 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2797  shikimate kinase  33.55 
 
 		 177 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135069  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3206  shikimate kinase  34 
 
 		 209 aa  90.1  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289523  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1757  shikimate kinase  33.55 
 
 		 177 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0052  shikimate kinase  37.43 
 
 		 170 aa  90.1  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0535  shikimate kinase  31.33 
 
 		 205 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.74412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0786  shikimate kinase  32.52 
 
 		 174 aa  90.1  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.549744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3700  shikimate kinase  33.55 
 
 		 177 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.049823  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3758  shikimate kinase  33.55 
 
 		 177 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485321  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3729  shikimate kinase  33.55 
 
 		 184 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2794  shikimate kinase  33.33 
 
 		 183 aa  89  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0359  shikimate kinase  34.69 
 
 		 183 aa  88.6  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471264 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2715  shikimate kinase  35.92 
 
 		 169 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0246166  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2722  shikimate kinase I  34.73 
 
 		 172 aa  89  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2970  shikimate kinase  29.59 
 
 		 190 aa  88.2  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0994  shikimate kinase I  38.18 
 
 		 175 aa  88.2  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0963  shikimate kinase I  38.18 
 
 		 175 aa  88.2  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1256  shikimate kinase  32.73 
 
 		 166 aa  88.2  5e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2168  shikimate kinase  35.48 
 
 		 186 aa  88.2  5e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.157663  normal  0.699838 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0912  shikimate kinase  28.05 
 
 		 173 aa  88.2  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>