More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0528 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0528  Shikimate kinase  100 
 
 		 166 aa  328  3e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.276227  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1819  shikimate kinase  46.71 
 
 		 169 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2026  shikimate kinase  44.24 
 
 		 175 aa  136  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0977  shikimate kinase  40.48 
 
 		 168 aa  134  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.937224  normal  0.13223 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1506  shikimate kinase  39.76 
 
 		 184 aa  134  7.000000000000001e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0979  Shikimate kinase  43.9 
 
 		 187 aa  131  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0506883 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0952  Shikimate kinase  43.9 
 
 		 187 aa  131  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1517  shikimate kinase  40.12 
 
 		 171 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1039  Shikimate kinase  44.37 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0118821  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1700  Shikimate kinase  42.94 
 
 		 172 aa  129  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0528  shikimate kinase  40.96 
 
 		 168 aa  127  6e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.361692  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4089  shikimate kinase  40.24 
 
 		 165 aa  127  9.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1020  shikimate kinase  42.86 
 
 		 177 aa  127  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1555  shikimate kinase  35.98 
 
 		 170 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.436884  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0894  shikimate kinase  42.76 
 
 		 190 aa  126  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00120765  hitchhiker  0.000836884 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2661  Shikimate kinase  35.98 
 
 		 170 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000463113 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0893  shikimate kinase  40.24 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0464  shikimate kinase  39.63 
 
 		 176 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1556  shikimate kinase  39.02 
 
 		 173 aa  125  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4137  shikimate kinase  40.24 
 
 		 165 aa  125  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.151576  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3987  shikimate kinase  40.85 
 
 		 165 aa  125  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2345  shikimate kinase  40.12 
 
 		 199 aa  125  3e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4457  shikimate kinase  40.24 
 
 		 165 aa  125  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745283  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2922  shikimate kinase  39.02 
 
 		 165 aa  125  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4020  shikimate kinase  36.97 
 
 		 181 aa  124  6e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.263055  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4313  shikimate kinase  39.63 
 
 		 170 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1799  shikimate kinase  39.13 
 
 		 191 aa  124  8.000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.279615  normal  0.998322 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4366  shikimate kinase  39.63 
 
 		 165 aa  123  9e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0346  shikimate kinase  38.89 
 
 		 191 aa  121  6e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45250  shikimate kinase  38.32 
 
 		 172 aa  120  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1220  shikimate kinase  40.12 
 
 		 190 aa  120  8e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.455019  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2137  shikimate kinase  38.79 
 
 		 174 aa  120  8e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.628527  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5776  shikimate kinase  36.31 
 
 		 172 aa  120  9e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5127  shikimate kinase  37.95 
 
 		 172 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0553  shikimate kinase  37.8 
 
 		 181 aa  120  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.387005  normal  0.100064 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01791  shikimate kinase  39.24 
 
 		 198 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0539701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0839  shikimate kinase  36.31 
 
 		 176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.657447  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_407  shikimate kinase  36.36 
 
 		 176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3977  shikimate kinase  39.63 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.537604  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0408  shikimate kinase  37.95 
 
 		 172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1855  shikimate kinase  37.35 
 
 		 181 aa  119  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0441  shikimate kinase  38.36 
 
 		 176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.567872  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0220  Shikimate kinase  47.15 
 
 		 167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000013813  normal  0.0131612 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0207  shikimate kinase  35.98 
 
 		 183 aa  118  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.807253  normal  0.16478 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2745  Shikimate kinase  36.2 
 
 		 181 aa  118  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.11158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1763  shikimate kinase  38.95 
 
 		 264 aa  118  3e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2022  shikimate kinase  39.88 
 
 		 192 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2313  Shikimate kinase  40.24 
 
 		 168 aa  118  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0915782  hitchhiker  0.00353016 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1476  shikimate kinase  38.61 
 
 		 198 aa  118  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66610  shikimate kinase  36.31 
 
 		 172 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0837  shikimate kinase  39.53 
 
 		 190 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.8297  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1804  Shikimate kinase  40 
 
 		 172 aa  117  6e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3267  shikimate kinase  36.75 
 
 		 229 aa  117  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06110  Shikimate kinase  42.33 
 
 		 171 aa  117  7e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0960  shikimate kinase  40.7 
 
 		 199 aa  117  7e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4255  shikimate kinase  39.02 
 
 		 165 aa  117  9e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3036  shikimate kinase  36.14 
 
 		 180 aa  117  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0215  shikimate kinase  38.32 
 
 		 172 aa  116  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.365544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0882  Shikimate kinase  39.29 
 
 		 179 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.314525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0734  shikimate kinase  39.29 
 
 		 179 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2206  shikimate kinase I  38.27 
 
 		 174 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184461  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0165  Shikimate kinase  39.16 
 
 		 172 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0692  shikimate kinase  35.4 
 
 		 180 aa  117  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1406  shikimate kinase  36.63 
 
 		 202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.812389  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1187  shikimate kinase  40.46 
 
 		 174 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01231  shikimate kinase  36.97 
 
 		 197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.428162 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0547  shikimate kinase  39.24 
 
 		 163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3029  Shikimate kinase  38.51 
 
 		 190 aa  114  5e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.194702  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1878  shikimate kinase  33.73 
 
 		 186 aa  114  5e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0611  shikimate kinase  35.4 
 
 		 180 aa  114  5e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.78726  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0613  shikimate kinase  35.71 
 
 		 180 aa  114  5e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0153  shikimate kinase  40.24 
 
 		 166 aa  114  5e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1591  Shikimate kinase  39.26 
 
 		 175 aa  114  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0946  shikimate kinase  39.53 
 
 		 199 aa  114  6e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.133424  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2970  shikimate kinase  33.53 
 
 		 190 aa  114  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2168  shikimate kinase  34.34 
 
 		 186 aa  114  8.999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.157663  normal  0.699838 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5079  shikimate kinase  35.93 
 
 		 172 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2686  shikimate kinase  37.04 
 
 		 169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.536815  normal  0.0662498 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4952  shikimate kinase  35.93 
 
 		 172 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1297  shikimate 5-dehydrogenase  36.25 
 
 		 458 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01201  shikimate kinase  36.9 
 
 		 185 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0532  shikimate kinase  37.95 
 
 		 206 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0786  shikimate kinase  37.2 
 
 		 174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.549744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00028  shikimate kinase I  36.31 
 
 		 172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2532  shikimate kinase  38.79 
 
 		 173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884272  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1721  Shikimate kinase  38.41 
 
 		 189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547803  normal  0.0497898 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1282  shikimate kinase  36.14 
 
 		 178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6268  Shikimate kinase  39.86 
 
 		 170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00441949  normal  0.76442 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0652  shikimate kinase  33.54 
 
 		 195 aa  112  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3534  Shikimate kinase  37.74 
 
 		 207 aa  112  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0678  shikimate kinase  36.42 
 
 		 182 aa  112  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.211914 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4117  shikimate kinase  36.69 
 
 		 182 aa  112  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  hitchhiker  0.000000685723 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02051  shikimate kinase  38.27 
 
 		 192 aa  112  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2486  Shikimate kinase  34.88 
 
 		 192 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1516  shikimate kinase  39.53 
 
 		 197 aa  111  4.0000000000000004e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.681098 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49363  predicted protein  37.89 
 
 		 277 aa  111  4.0000000000000004e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.130562  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3130  shikimate kinase  34.94 
 
 		 192 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4010  shikimate kinase I  35.37 
 
 		 196 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02182  shikimate kinase  33.73 
 
 		 180 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3014  Shikimate kinase  34.15 
 
 		 203 aa  111  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0650528 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>